134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3709 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3709  hexulose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 200 aa  392  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5672  6-phospho 3-hexuloisomerase  55.14 
 
 		 194 aa  188  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.343688 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0910  sugar isomerase (SIS)  37.89 
 
 		 190 aa  121  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0132  hexulose-6-phosphate isomerase  40.57 
 
 		 180 aa  119  3.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1850  6-phospho 3-hexuloisomerase  41.67 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1650  sugar isomerase (SIS)  36.78 
 
 		 186 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127624 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0217  SIS domain-containing protein  38.33 
 
 		 182 aa  114  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  40.43 
 
 		 202 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0993  hexulose-6-phosphate isomerase  37.89 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.830093  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3252  3-hexulose-6-phosphate isomerase  35.63 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  0.405094 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1199  sugar isomerase (SIS)  38.83 
 
 		 191 aa  112  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.645191  normal  0.0117075 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3213  6-phospho 3-hexuloisomerase  36.61 
 
 		 187 aa  111  8.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1507  sugar isomerase (SIS)  35.64 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3031  sugar isomerase (SIS)  37.5 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0308  sugar isomerase (SIS)  39.89 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0594  sugar isomerase (SIS)  37.29 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0608  sugar isomerase (SIS)  37.29 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  40.22 
 
 		 177 aa  105  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  40.22 
 
 		 177 aa  105  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2737  sugar isomerase (SIS)  37.5 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2813  sugar isomerase (SIS)  37.5 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3056  sugar isomerase (SIS)  37.5 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1889  hexulose-6-phosphate isomerase  33.51 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2411  6-phospho 3-hexuloisomerase  32.45 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  37.57 
 
 		 389 aa  97.1  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  32.39 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2930  6-phospho 3-hexuloisomerase  41.07 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000566835 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1653  hexulose-6-phosphate isomerase  40.52 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  36.63 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0616  sugar isomerase (SIS)  40.76 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.764233 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  30.63 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1579  sugar isomerase (SIS)  42.86 
 
 		 202 aa  91.7  7e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.208067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1367  hexulose-6-phosphate isomerase  39.43 
 
 		 185 aa  91.3  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0638  sugar isomerase (SIS)  35.95 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0610  6-phospho 3-hexuloisomerase  42.24 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3836  sugar isomerase (SIS)  32.96 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0236  hexulose-6-phosphate isomerase  39.87 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.249011 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1130  6-phospho 3-hexuloisomerase  35.56 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0808  hexulose-6-phosphate isomerase  40.13 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0552  sugar isomerase  36.11 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4594  3-hexulose-6-phosphate isomerase  29.03 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0300  RpiR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0307  hypothetical protein  31.58 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0185  sugar phosphate isomerase  28.89 
 
 		 397 aa  59.3  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0696  RpiR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000925251  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0042  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  23.12 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1541  RpiR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000907266  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1590  RpiR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 266 aa  54.3  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000388341  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02327  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.03 
 
 		 285 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02288  hypothetical protein  32.03 
 
 		 285 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1252  RpiR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 285 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.102619 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2563  RpiR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 285 aa  52  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2713  RpiR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 285 aa  52  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2799  transcriptional regulator, RpiR family  32.03 
 
 		 285 aa  52  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.576789  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  31.25 
 
 		 285 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1547  RpiR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 296 aa  50.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0154  sugar isomerase (SIS)  41.54 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 279 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 279 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 304 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3657  transcriptional regulator, RpiR family  32.03 
 
 		 285 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0092  RpiR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  30.6 
 
 		 282 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2734  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.58 
 
 		 282 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  28.06 
 
 		 280 aa  48.9  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  32.23 
 
 		 299 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 273 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2815  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.3 
 
 		 282 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.901844 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1192  transcriptional regulator, RpiR family  31.09 
 
 		 293 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.497061  normal  0.760306 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3787  transcriptional regulator, RpiR family  33.6 
 
 		 280 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.925929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1202  RpiR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.658823 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 285 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4864  transcriptional regulator, RpiR family  33.6 
 
 		 280 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403808 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2950  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.3 
 
 		 282 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1222  RpiR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.514843 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2775  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.3 
 
 		 282 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1237  RpiR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.676137 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2838  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.3 
 
 		 282 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3406  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  29.73 
 
 		 298 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0521  RpiR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 283 aa  46.6  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.207231  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  33.33 
 
 		 609 aa  46.2  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2898  sugar isomerase (SIS)  38.46 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2006  RpiR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0473713 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  30.37 
 
 		 281 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02455  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.3 
 
 		 282 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1107  transcriptional regulator, RpiR family  31.3 
 
 		 282 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.379447  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2714  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.3 
 
 		 282 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2846  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.3 
 
 		 282 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.632746  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02419  hypothetical protein  31.3 
 
 		 282 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2714  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.3 
 
 		 282 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3796  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.3 
 
 		 282 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2926  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.3 
 
 		 282 aa  45.1  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0338  transcriptional regulator, RpiR family  29.5 
 
 		 282 aa  45.1  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4477  KpsF/GutQ family protein  33.61 
 
 		 334 aa  44.7  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1544  transcriptional regulator, RpiR family  23.57 
 
 		 279 aa  44.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0250  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  32 
 
 		 287 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 292 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 292 aa  43.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 292 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1116  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.53 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>