149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1199 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1199  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 		 191 aa  384  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.645191  normal  0.0117075 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1507  sugar isomerase (SIS)  70.68 
 
 		 211 aa  284  5.999999999999999e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0910  sugar isomerase (SIS)  70 
 
 		 190 aa  280  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2411  6-phospho 3-hexuloisomerase  67.02 
 
 		 199 aa  276  9e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0993  hexulose-6-phosphate isomerase  64.92 
 
 		 200 aa  251  5.000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.830093  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  51.79 
 
 		 205 aa  207  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3031  sugar isomerase (SIS)  47.42 
 
 		 194 aa  191  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1889  hexulose-6-phosphate isomerase  44.21 
 
 		 202 aa  170  9e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  43.16 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  47.94 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0308  sugar isomerase (SIS)  47.78 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0616  sugar isomerase (SIS)  44.51 
 
 		 201 aa  144  9e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.764233 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0808  hexulose-6-phosphate isomerase  43.89 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0610  6-phospho 3-hexuloisomerase  43.52 
 
 		 202 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1579  sugar isomerase (SIS)  41.97 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.208067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2737  sugar isomerase (SIS)  38.95 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2813  sugar isomerase (SIS)  38.95 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0236  hexulose-6-phosphate isomerase  45.68 
 
 		 209 aa  132  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.249011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  43.83 
 
 		 389 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0594  sugar isomerase (SIS)  37.89 
 
 		 182 aa  131  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0608  sugar isomerase (SIS)  37.89 
 
 		 182 aa  131  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1130  6-phospho 3-hexuloisomerase  48.43 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0217  SIS domain-containing protein  40.46 
 
 		 182 aa  128  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0638  sugar isomerase (SIS)  38.86 
 
 		 178 aa  124  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  41.98 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  41.98 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2930  6-phospho 3-hexuloisomerase  39.63 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000566835 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1650  sugar isomerase (SIS)  36.26 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127624 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3213  6-phospho 3-hexuloisomerase  41.46 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3252  3-hexulose-6-phosphate isomerase  34.97 
 
 		 186 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  0.405094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1653  hexulose-6-phosphate isomerase  35.64 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1850  6-phospho 3-hexuloisomerase  35.23 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0132  hexulose-6-phosphate isomerase  40 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3056  sugar isomerase (SIS)  32.97 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  34.71 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3709  hexulose-6-phosphate isomerase  38.83 
 
 		 200 aa  101  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1367  hexulose-6-phosphate isomerase  33.51 
 
 		 185 aa  98.6  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5672  6-phospho 3-hexuloisomerase  33.13 
 
 		 194 aa  91.7  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.343688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0552  sugar isomerase  30.3 
 
 		 188 aa  85.1  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3836  sugar isomerase (SIS)  29.89 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4594  3-hexulose-6-phosphate isomerase  29.07 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0185  sugar phosphate isomerase  34.58 
 
 		 397 aa  58.9  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0521  RpiR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 283 aa  54.7  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.207231  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0300  RpiR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 266 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0307  hypothetical protein  28.15 
 
 		 266 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02327  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.46 
 
 		 285 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1080  RpiR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 318 aa  52.8  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0801962  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 279 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 279 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02288  hypothetical protein  36.46 
 
 		 285 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  31.25 
 
 		 282 aa  52.8  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29100  transcriptional regulator  26.95 
 
 		 290 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1541  RpiR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 266 aa  52.4  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000907266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2563  RpiR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 285 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2713  RpiR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 285 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1252  RpiR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 285 aa  52  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.102619 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1590  RpiR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 266 aa  51.6  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000388341  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2799  transcriptional regulator, RpiR family  36.46 
 
 		 285 aa  51.6  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.576789  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1044  RpiR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 338 aa  51.2  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408154  normal  0.734102 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  35.42 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001002  transcriptional regulator RpiR family  33.04 
 
 		 283 aa  50.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  27.78 
 
 		 340 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3657  transcriptional regulator, RpiR family  36.46 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 285 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  24.24 
 
 		 280 aa  49.3  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  28.47 
 
 		 299 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3662  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.02 
 
 		 282 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 273 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2581  RpiR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 278 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  hitchhiker  0.000000255705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  29.75 
 
 		 281 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  30.17 
 
 		 272 aa  48.9  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 292 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 292 aa  48.5  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 292 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3745  RpiR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 282 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0176  RpiR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 282 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0659  RpiR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 282 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.78991  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2083  RpiR family transcriptional regulator  30 
 
 		 285 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2136  transcriptional regulator, RpiR family  28.68 
 
 		 284 aa  47.4  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0626  RpiR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 282 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0580  RpiR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 282 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.658912  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0554  RpiR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 282 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.335525  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3319  RpiR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0092  RpiR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 287 aa  45.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4164  RpiR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 282 aa  45.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.045816  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0652  RpiR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 281 aa  45.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  0.0629992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3105  KpsF/GutQ family protein  24.86 
 
 		 324 aa  45.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.345406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  30 
 
 		 353 aa  45.1  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  26.53 
 
 		 326 aa  45.1  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3802  RpiR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 306 aa  44.7  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439738  decreased coverage  0.00014335 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1686  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 272 aa  44.7  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0801516  hitchhiker  0.000000000302216 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  30.97 
 
 		 279 aa  44.7  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03961  DNA-binding transcriptional repressor  31.43 
 
 		 296 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3902  transcriptional regulator, RpiR family  31.43 
 
 		 296 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  33.67 
 
 		 321 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  30.3 
 
 		 327 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4698  transcriptional regulator, RpiR family  29.03 
 
 		 277 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3937  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  31.43 
 
 		 296 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4555  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  31.43 
 
 		 296 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>