212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1507 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1507  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2411  6-phospho 3-hexuloisomerase  67.84 
 
 		 199 aa  287  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1199  sugar isomerase (SIS)  70.68 
 
 		 191 aa  284  7e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.645191  normal  0.0117075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0910  sugar isomerase (SIS)  64.21 
 
 		 190 aa  261  6.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0993  hexulose-6-phosphate isomerase  59.79 
 
 		 200 aa  243  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.830093  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  53.54 
 
 		 205 aa  221  6e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3031  sugar isomerase (SIS)  46.91 
 
 		 194 aa  201  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  45.79 
 
 		 204 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1889  hexulose-6-phosphate isomerase  40.53 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  43.94 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0308  sugar isomerase (SIS)  42.86 
 
 		 206 aa  152  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0616  sugar isomerase (SIS)  46.15 
 
 		 201 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.764233 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1579  sugar isomerase (SIS)  41.36 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.208067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0236  hexulose-6-phosphate isomerase  40.7 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.249011 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0808  hexulose-6-phosphate isomerase  44.38 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2737  sugar isomerase (SIS)  35.94 
 
 		 183 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2813  sugar isomerase (SIS)  35.94 
 
 		 183 aa  132  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0594  sugar isomerase (SIS)  38.73 
 
 		 182 aa  128  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0608  sugar isomerase (SIS)  38.73 
 
 		 182 aa  128  8.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0217  SIS domain-containing protein  33.85 
 
 		 182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  40.91 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  40.91 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0610  6-phospho 3-hexuloisomerase  43.12 
 
 		 202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1130  6-phospho 3-hexuloisomerase  42.77 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  39.89 
 
 		 389 aa  121  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0638  sugar isomerase (SIS)  39.13 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2930  6-phospho 3-hexuloisomerase  37.8 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000566835 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3056  sugar isomerase (SIS)  33.67 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3213  6-phospho 3-hexuloisomerase  33.68 
 
 		 187 aa  111  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1653  hexulose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  35.52 
 
 		 194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1650  sugar isomerase (SIS)  34.29 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127624 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1850  6-phospho 3-hexuloisomerase  32.96 
 
 		 186 aa  106  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3252  3-hexulose-6-phosphate isomerase  31.96 
 
 		 186 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  0.405094 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0132  hexulose-6-phosphate isomerase  32.61 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1367  hexulose-6-phosphate isomerase  31.35 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3709  hexulose-6-phosphate isomerase  35.64 
 
 		 200 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5672  6-phospho 3-hexuloisomerase  31.25 
 
 		 194 aa  95.5  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.343688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0552  sugar isomerase  30.81 
 
 		 188 aa  89.7  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4594  3-hexulose-6-phosphate isomerase  30.11 
 
 		 187 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3836  sugar isomerase (SIS)  25.91 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  26.42 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0185  sugar phosphate isomerase  30.33 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29100  transcriptional regulator  24.24 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0338  transcriptional regulator, RpiR family  30.09 
 
 		 282 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1394  transcriptional regulator, RpiR family  36.21 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  0.640102 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  25.2 
 
 		 280 aa  53.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0283  transcriptional regulator, RpiR family  26.83 
 
 		 279 aa  53.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1541  RpiR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 266 aa  52.8  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000907266  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0300  RpiR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 266 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0307  hypothetical protein  23.03 
 
 		 266 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  27.4 
 
 		 272 aa  51.6  0.000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  26.87 
 
 		 324 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3662  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.05 
 
 		 282 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  24.59 
 
 		 323 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  26.87 
 
 		 324 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02327  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.42 
 
 		 285 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4661  RpiR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 278 aa  49.7  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  31.96 
 
 		 340 aa  49.7  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02288  hypothetical protein  35.42 
 
 		 285 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001002  transcriptional regulator RpiR family  32.98 
 
 		 283 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  23.31 
 
 		 319 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1590  RpiR family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 266 aa  49.3  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000388341  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3802  RpiR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 306 aa  49.3  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0439738  decreased coverage  0.00014335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0588  RpiR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 273 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.189062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3371  transcriptional regulator, RpiR family  26.57 
 
 		 281 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3048  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.25 
 
 		 282 aa  49.3  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0712519  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1406  RpiR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2771  RpiR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114132 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1297  RpiR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 292 aa  48.9  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1544  transcriptional regulator, RpiR family  26.96 
 
 		 279 aa  48.9  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1252  RpiR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 285 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.102619 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2713  RpiR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 285 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  35.56 
 
 		 285 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2563  RpiR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 285 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 284 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0042  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  29.08 
 
 		 267 aa  48.9  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1243  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 283 aa  48.5  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.665754  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 285 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2799  transcriptional regulator, RpiR family  35.56 
 
 		 285 aa  48.9  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.576789  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0727  KpsF/GutQ family protein  32.35 
 
 		 340 aa  48.5  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.516394  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  26.54 
 
 		 328 aa  48.5  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02455  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.62 
 
 		 282 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1107  transcriptional regulator, RpiR family  25.62 
 
 		 282 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.379447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3796  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.62 
 
 		 282 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.796505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2846  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.62 
 
 		 282 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.632746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2926  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.62 
 
 		 282 aa  48.5  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02419  hypothetical protein  25.62 
 
 		 282 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2714  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.62 
 
 		 282 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2714  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.62 
 
 		 282 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0898  HTH-type transcriptional regulator, rpiR family  29.13 
 
 		 292 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.679683  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3105  KpsF/GutQ family protein  24.38 
 
 		 324 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.345406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1776  transcriptional regulator, RpiR family  28.89 
 
 		 281 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  26.13 
 
 		 326 aa  47.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2838  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.74 
 
 		 282 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2775  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.74 
 
 		 282 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0250  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  27.54 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>