More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0808 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0808  hexulose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 202 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0610  6-phospho 3-hexuloisomerase  85.15 
 
 		 202 aa  333  1e-90  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0616  sugar isomerase (SIS)  82.59 
 
 		 201 aa  330  6e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.764233 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1579  sugar isomerase (SIS)  82.67 
 
 		 202 aa  328  3e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.208067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0308  sugar isomerase (SIS)  65.33 
 
 		 206 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  58.76 
 
 		 202 aa  241  5e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0236  hexulose-6-phosphate isomerase  60.62 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.249011 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1130  6-phospho 3-hexuloisomerase  58.03 
 
 		 209 aa  220  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0910  sugar isomerase (SIS)  47.59 
 
 		 190 aa  171  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1199  sugar isomerase (SIS)  43.89 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.645191  normal  0.0117075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1889  hexulose-6-phosphate isomerase  44.26 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1507  sugar isomerase (SIS)  44.38 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2411  6-phospho 3-hexuloisomerase  40.31 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  39.47 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0993  hexulose-6-phosphate isomerase  41.76 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.830093  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0638  sugar isomerase (SIS)  44.56 
 
 		 178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3031  sugar isomerase (SIS)  38.22 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2737  sugar isomerase (SIS)  39.5 
 
 		 183 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2813  sugar isomerase (SIS)  39.5 
 
 		 183 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  40.84 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0217  SIS domain-containing protein  39.23 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3213  6-phospho 3-hexuloisomerase  36.02 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0132  hexulose-6-phosphate isomerase  38.19 
 
 		 180 aa  122  5e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  36.97 
 
 		 194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0608  sugar isomerase (SIS)  38.61 
 
 		 182 aa  117  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0594  sugar isomerase (SIS)  38.61 
 
 		 182 aa  117  9e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  38.61 
 
 		 389 aa  116  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1850  6-phospho 3-hexuloisomerase  37.14 
 
 		 186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1653  hexulose-6-phosphate isomerase  41.45 
 
 		 181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  39.49 
 
 		 177 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  39.49 
 
 		 177 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3056  sugar isomerase (SIS)  32.98 
 
 		 186 aa  104  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1650  sugar isomerase (SIS)  34.64 
 
 		 186 aa  101  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127624 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3252  3-hexulose-6-phosphate isomerase  32.82 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  0.405094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5672  6-phospho 3-hexuloisomerase  35.91 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.343688 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2930  6-phospho 3-hexuloisomerase  36.14 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000566835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1367  hexulose-6-phosphate isomerase  34.68 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0552  sugar isomerase  31.61 
 
 		 188 aa  87.8  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3836  sugar isomerase (SIS)  31.07 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3709  hexulose-6-phosphate isomerase  40.13 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4594  3-hexulose-6-phosphate isomerase  29.19 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4164  RpiR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.045816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  40 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1252  RpiR family transcriptional regulator  40 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.102619 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2713  RpiR family transcriptional regulator  40 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02327  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02288  hypothetical protein  40 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2799  transcriptional regulator, RpiR family  40 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.576789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2563  RpiR family transcriptional regulator  40 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  40 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3657  transcriptional regulator, RpiR family  39.05 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  27.17 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0185  sugar phosphate isomerase  27.46 
 
 		 397 aa  65.1  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  30.47 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0300  RpiR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  30.07 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  30.07 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  30.07 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0307  hypothetical protein  30.7 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  30.07 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  28.04 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  30.07 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  32.73 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  27.21 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  27.21 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3213  KpsF/GutQ family protein  29.41 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  28.57 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  28.57 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 328 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  28.57 
 
 		 328 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.37 
 
 		 328 aa  58.5  0.00000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1541  RpiR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000907266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  26.14 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  29.13 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  31.88 
 
 		 280 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  32.79 
 
 		 330 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  29.13 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  33.33 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  28.57 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2246  transcriptional regulator, RpiR family  29.45 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2295  RpiR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.651664  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  31.25 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  31.15 
 
 		 333 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  31.25 
 
 		 357 aa  54.7  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  31.15 
 
 		 333 aa  55.1  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  24.76 
 
 		 342 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  24.76 
 
 		 357 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0503  arabinose 5-phosphate isomerase  30.4 
 
 		 324 aa  53.9  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  30.08 
 
 		 324 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  26.57 
 
 		 345 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  28 
 
 		 333 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0335  KpsF/GutQ family protein  30.08 
 
 		 334 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00223142  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  30.08 
 
 		 324 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  30.08 
 
 		 324 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>