117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0608 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0594  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 
182 aa  370  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0608  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 
182 aa  370  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2737  sugar isomerase (SIS)  70.88 
 
 
183 aa  266  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2813  sugar isomerase (SIS)  70.88 
 
 
183 aa  266  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0217  SIS domain-containing protein  67.58 
 
 
182 aa  256  1e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0910  sugar isomerase (SIS)  39.15 
 
 
190 aa  135  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510158  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1199  sugar isomerase (SIS)  37.89 
 
 
191 aa  131  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.645191  normal  0.0117075 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1850  6-phospho 3-hexuloisomerase  40.86 
 
 
186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1507  sugar isomerase (SIS)  38.73 
 
 
211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3252  3-hexulose-6-phosphate isomerase  41.24 
 
 
186 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  0.405094 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3213  6-phospho 3-hexuloisomerase  41.18 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1889  hexulose-6-phosphate isomerase  37.37 
 
 
202 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  38.41 
 
 
204 aa  125  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2411  6-phospho 3-hexuloisomerase  37.04 
 
 
199 aa  125  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1650  sugar isomerase (SIS)  40.68 
 
 
186 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000127624 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0638  sugar isomerase (SIS)  37.64 
 
 
178 aa  122  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0308  sugar isomerase (SIS)  36.41 
 
 
206 aa  122  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0993  hexulose-6-phosphate isomerase  37.64 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.830093  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  37.71 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  37.71 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  42.67 
 
 
389 aa  117  9e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  39.74 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  34.9 
 
 
205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0236  hexulose-6-phosphate isomerase  41.03 
 
 
209 aa  111  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.249011 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1653  hexulose-6-phosphate isomerase  36.46 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0616  sugar isomerase (SIS)  37.91 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.764233 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3031  sugar isomerase (SIS)  32.77 
 
 
194 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  32.68 
 
 
194 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1130  6-phospho 3-hexuloisomerase  41.03 
 
 
209 aa  104  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1579  sugar isomerase (SIS)  36.46 
 
 
202 aa  103  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.208067  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0552  sugar isomerase  33.9 
 
 
188 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0132  hexulose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 
180 aa  102  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0808  hexulose-6-phosphate isomerase  38.61 
 
 
202 aa  102  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3836  sugar isomerase (SIS)  36.17 
 
 
188 aa  102  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0610  6-phospho 3-hexuloisomerase  35.14 
 
 
202 aa  98.6  4e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2930  6-phospho 3-hexuloisomerase  33.14 
 
 
188 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000566835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5672  6-phospho 3-hexuloisomerase  35 
 
 
194 aa  95.9  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.343688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4594  3-hexulose-6-phosphate isomerase  35.23 
 
 
187 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1367  hexulose-6-phosphate isomerase  30.29 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3709  hexulose-6-phosphate isomerase  37.29 
 
 
200 aa  91.3  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3056  sugar isomerase (SIS)  30.29 
 
 
186 aa  91.3  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1544  transcriptional regulator, RpiR family  24.69 
 
 
279 aa  58.2  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0185  sugar phosphate isomerase  26.67 
 
 
397 aa  54.3  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0300  RpiR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
266 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0307  hypothetical protein  28.4 
 
 
266 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3022  transcriptional regulator, RpiR family  28.91 
 
 
262 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0727  KpsF/GutQ family protein  33.33 
 
 
340 aa  50.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.516394  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  27.15 
 
 
331 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2775  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.35 
 
 
282 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2838  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.35 
 
 
282 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2815  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.35 
 
 
282 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.901844 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2734  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.35 
 
 
282 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2950  putative DNA-binding transcriptional regulator  37.35 
 
 
282 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  33.04 
 
 
282 aa  48.5  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0363  KpsF/GutQ family protein  27.13 
 
 
344 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103679  normal  0.93857 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1895  KpsF/GutQ family protein  26.9 
 
 
338 aa  48.1  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258547  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3603  KpsF/GutQ family protein  30 
 
 
324 aa  48.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.478278 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  32.63 
 
 
327 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 
279 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2846  KpsF/GutQ family protein  32.63 
 
 
327 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2704  KpsF/GutQ family protein  32.63 
 
 
327 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  28.12 
 
 
321 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 
279 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  30.83 
 
 
329 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0529  KpsF/GutQ family protein  31.58 
 
 
327 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64598  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0151  transcriptional regulator, RpiR family  26.11 
 
 
243 aa  46.2  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2172  KpsF/GutQ family protein  32.63 
 
 
327 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  32.63 
 
 
327 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2797  KpsF/GutQ family protein  32.63 
 
 
327 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.154837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02327  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.25 
 
 
285 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  28.93 
 
 
272 aa  45.4  0.0004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  25.99 
 
 
299 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02288  hypothetical protein  31.25 
 
 
285 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4477  KpsF/GutQ family protein  30.33 
 
 
334 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382175  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12348  Sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  30.4 
 
 
321 aa  45.1  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2674  transcriptional regulator, RpiR family  31.06 
 
 
293 aa  44.7  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0539121 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  31.25 
 
 
285 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29100  transcriptional regulator  24.22 
 
 
290 aa  44.7  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2713  RpiR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
285 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1252  RpiR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
285 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.102619 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2799  transcriptional regulator, RpiR family  31.25 
 
 
285 aa  44.7  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.576789  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  27.4 
 
 
325 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2563  RpiR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
285 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
285 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  27.27 
 
 
325 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3657  transcriptional regulator, RpiR family  31.25 
 
 
285 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  29.31 
 
 
324 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1243  transcriptional regulator  28.08 
 
 
283 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.665754  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  25.93 
 
 
326 aa  43.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3018  RpiR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
256 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576007  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  29.37 
 
 
324 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  29.37 
 
 
324 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3105  KpsF/GutQ family protein  24.49 
 
 
324 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.345406  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  29.25 
 
 
330 aa  42.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2349  RpiR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
254 aa  42.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  29.37 
 
 
324 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5015  KpsF/GutQ family protein  25.42 
 
 
329 aa  42.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.336764 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2392  sugar isomerase (SIS)  26.67 
 
 
254 aa  42.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  28.23 
 
 
330 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  29.57 
 
 
325 aa  42  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.338058 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>