More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0727 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0727  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 340 aa  658    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.516394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4477  KpsF/GutQ family protein  47.42 
 
 		 334 aa  238  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3965  KpsF/GutQ family protein  44.31 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2608  KpsF/GutQ family protein  48.65 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  43.87 
 
 		 329 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3588  arabinose-5-phosphate isomerase  49.43 
 
 		 320 aa  222  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3854  KpsF/GutQ family protein  44.14 
 
 		 323 aa  215  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2497  KpsF/GutQ family protein  40.52 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1895  KpsF/GutQ family protein  43.04 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2814  KpsF/GutQ family protein  49.79 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2774  KpsF/GutQ family protein  48.09 
 
 		 321 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1153  sugar phosphate isomerase  49.36 
 
 		 307 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1208  KpsF/GutQ family protein  47.89 
 
 		 323 aa  210  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.905604 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  49.17 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1670  KpsF/GutQ family protein  42.91 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.225758  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  49.57 
 
 		 338 aa  206  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  39.94 
 
 		 321 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0931  sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  40.98 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  40.13 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0769  KpsF/GutQ family protein  38.69 
 
 		 337 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0192  KpsF/GutQ family protein  43.53 
 
 		 334 aa  202  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0947  KpsF/GutQ family protein  36.39 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4997  KpsF/GutQ family protein  43.17 
 
 		 333 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0692534 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3413  KpsF/GutQ family protein  39.67 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.285872  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  45.88 
 
 		 322 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0073  KpsF/GutQ family protein  48.75 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3609  KpsF/GutQ family protein  39.68 
 
 		 331 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  46.75 
 
 		 329 aa  199  7e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0014  KpsF/GutQ  43.2 
 
 		 366 aa  198  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  38.44 
 
 		 321 aa  198  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  41.35 
 
 		 315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  38.85 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  38.85 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  34.08 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0335  KpsF/GutQ family sugar isomerase  41.44 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4539  KpsF/GutQ family protein  42.98 
 
 		 336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0864  KpsF/GutQ family protein  42.55 
 
 		 336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1252  KpsF/GutQ family protein  48.74 
 
 		 338 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465409  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  46.44 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1114  arabinose 5-phosphate isomerase  37.77 
 
 		 320 aa  194  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  38.34 
 
 		 359 aa  193  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  38.34 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  46.47 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2580  KpsF/GutQ family protein  41.44 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597133  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  37.03 
 
 		 344 aa  192  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  38.36 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3307  KpsF/GutQ family protein  39.03 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  37.7 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2737  KpsF/GutQ family protein  40.83 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3030  sugar isomerase, KpsF/GutQ family  43.32 
 
 		 328 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2638  KpsF/GutQ family protein  43.32 
 
 		 328 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  39.16 
 
 		 324 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  44.73 
 
 		 321 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  44.35 
 
 		 333 aa  189  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  41.91 
 
 		 323 aa  189  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  41.67 
 
 		 323 aa  189  7e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  39.41 
 
 		 323 aa  189  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  45.61 
 
 		 327 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  42.15 
 
 		 325 aa  189  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1210  KpsF/GutQ family protein  35.96 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  36.28 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  40.32 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4269  KpsF/GutQ family protein  38.99 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  39.42 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  36.96 
 
 		 326 aa  187  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  43.67 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  44.4 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  40.32 
 
 		 345 aa  186  5e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3105  KpsF/GutQ family protein  42.37 
 
 		 324 aa  186  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.345406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  40.32 
 
 		 345 aa  185  8e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  39.26 
 
 		 324 aa  185  9e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  40.14 
 
 		 326 aa  185  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  38.19 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  38.51 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.86 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  38.19 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  33.54 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  39.26 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  39.35 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  43.85 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  41.3 
 
 		 326 aa  184  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.42 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  38.19 
 
 		 324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0922  sugar isomerase  43.25 
 
 		 330 aa  183  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  36.31 
 
 		 326 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.181851 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.98 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  42.98 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.98 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.98 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  42.98 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.98 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.98 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.98 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.98 
 
 		 328 aa  182  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  39.8 
 
 		 324 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  41.42 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.98 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.98 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  35.96 
 
 		 320 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  41.32 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>