48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4594 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4594  3-hexulose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
187 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3836  sugar isomerase (SIS)  46.28 
 
 
188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2813  sugar isomerase (SIS)  35.11 
 
 
183 aa  104  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2737  sugar isomerase (SIS)  35.11 
 
 
183 aa  104  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1889  hexulose-6-phosphate isomerase  35.14 
 
 
202 aa  103  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0993  hexulose-6-phosphate isomerase  31.66 
 
 
200 aa  103  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.830093  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0217  SIS domain-containing protein  34.24 
 
 
182 aa  100  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2411  6-phospho 3-hexuloisomerase  30 
 
 
199 aa  99.4  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0608  sugar isomerase (SIS)  35.23 
 
 
182 aa  95.5  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0594  sugar isomerase (SIS)  35.23 
 
 
182 aa  95.5  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3056  sugar isomerase (SIS)  30.64 
 
 
186 aa  91.3  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1507  sugar isomerase (SIS)  30.11 
 
 
211 aa  89.4  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0910  sugar isomerase (SIS)  30.32 
 
 
190 aa  88.2  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510158  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  29.12 
 
 
205 aa  85.5  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1650  sugar isomerase (SIS)  31.69 
 
 
186 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000127624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  27.47 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3031  sugar isomerase (SIS)  28.87 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  30.77 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  34.09 
 
 
177 aa  79  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  34.09 
 
 
177 aa  79  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3213  6-phospho 3-hexuloisomerase  31.87 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0308  sugar isomerase (SIS)  31.63 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1199  sugar isomerase (SIS)  29.07 
 
 
191 aa  77.8  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.645191  normal  0.0117075 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0552  sugar isomerase  27.13 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2930  6-phospho 3-hexuloisomerase  30.56 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000566835 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1850  6-phospho 3-hexuloisomerase  29.94 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1367  hexulose-6-phosphate isomerase  27.75 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0132  hexulose-6-phosphate isomerase  30.06 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3709  hexulose-6-phosphate isomerase  29.03 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1653  hexulose-6-phosphate isomerase  30.43 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  30.86 
 
 
389 aa  72.4  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3252  3-hexulose-6-phosphate isomerase  30.27 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  0.405094 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5672  6-phospho 3-hexuloisomerase  26.82 
 
 
194 aa  67  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.343688 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1130  6-phospho 3-hexuloisomerase  33.12 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0616  sugar isomerase (SIS)  27.81 
 
 
201 aa  61.6  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.764233 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0638  sugar isomerase (SIS)  25.61 
 
 
178 aa  61.2  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0236  hexulose-6-phosphate isomerase  32.48 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.249011 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0808  hexulose-6-phosphate isomerase  29.19 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1579  sugar isomerase (SIS)  28.34 
 
 
202 aa  59.3  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.208067  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  25 
 
 
194 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0610  6-phospho 3-hexuloisomerase  28.18 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2234  transcriptional regulator, RpiR family  35.78 
 
 
244 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  28.83 
 
 
280 aa  45.1  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0722  RpiR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
286 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23938  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0727  KpsF/GutQ family protein  25 
 
 
340 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.516394  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0876  transcriptional regulator  23.42 
 
 
251 aa  42  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0549202  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0523  KpsF/GutQ family protein  22.03 
 
 
323 aa  41.6  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1348  transcriptional regulator, RpiR family  28.08 
 
 
307 aa  41.2  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.478547  normal  0.506779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>