51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3056 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_3056  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 
186 aa  378  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1367  hexulose-6-phosphate isomerase  52.46 
 
 
185 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0552  sugar isomerase  59.75 
 
 
188 aa  184  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1507  sugar isomerase (SIS)  33.67 
 
 
211 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0910  sugar isomerase (SIS)  32.97 
 
 
190 aa  108  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510158  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1199  sugar isomerase (SIS)  32.97 
 
 
191 aa  108  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.645191  normal  0.0117075 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  30.43 
 
 
194 aa  106  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2411  6-phospho 3-hexuloisomerase  31.63 
 
 
199 aa  103  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3213  6-phospho 3-hexuloisomerase  33.55 
 
 
187 aa  101  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2930  6-phospho 3-hexuloisomerase  31.91 
 
 
188 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000566835 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  32.82 
 
 
202 aa  100  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  30.53 
 
 
204 aa  99.4  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0993  hexulose-6-phosphate isomerase  28.65 
 
 
200 aa  98.6  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.830093  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2813  sugar isomerase (SIS)  32.57 
 
 
183 aa  97.8  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2737  sugar isomerase (SIS)  32.57 
 
 
183 aa  97.8  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1850  6-phospho 3-hexuloisomerase  35.93 
 
 
186 aa  97.1  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0217  SIS domain-containing protein  32 
 
 
182 aa  95.9  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3709  hexulose-6-phosphate isomerase  37.5 
 
 
200 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0616  sugar isomerase (SIS)  32.81 
 
 
201 aa  92  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.764233 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0594  sugar isomerase (SIS)  30.29 
 
 
182 aa  91.3  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0608  sugar isomerase (SIS)  30.29 
 
 
182 aa  91.3  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4594  3-hexulose-6-phosphate isomerase  30.64 
 
 
187 aa  91.3  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1650  sugar isomerase (SIS)  28.98 
 
 
186 aa  90.9  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000127624 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1889  hexulose-6-phosphate isomerase  27.78 
 
 
202 aa  90.5  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0808  hexulose-6-phosphate isomerase  32.98 
 
 
202 aa  89.4  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0308  sugar isomerase (SIS)  28.87 
 
 
206 aa  88.2  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  31.84 
 
 
389 aa  85.1  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3252  3-hexulose-6-phosphate isomerase  27.84 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  0.405094 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0132  hexulose-6-phosphate isomerase  27.68 
 
 
180 aa  82  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5672  6-phospho 3-hexuloisomerase  32 
 
 
194 aa  82  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.343688 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  30.11 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  30.11 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1579  sugar isomerase (SIS)  31.84 
 
 
202 aa  80.9  0.000000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.208067  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0610  6-phospho 3-hexuloisomerase  32.91 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3836  sugar isomerase (SIS)  31.25 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  26.46 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0638  sugar isomerase (SIS)  30.92 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3031  sugar isomerase (SIS)  26.84 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1130  6-phospho 3-hexuloisomerase  28.33 
 
 
209 aa  74.3  0.0000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1653  hexulose-6-phosphate isomerase  28.25 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0236  hexulose-6-phosphate isomerase  30.17 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.249011 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  28.16 
 
 
280 aa  48.5  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5684  putative transcriptional regulator, RpiR family  25.95 
 
 
299 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0287132  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1547  RpiR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
296 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2734  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.84 
 
 
282 aa  42  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2775  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.84 
 
 
282 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2950  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.84 
 
 
282 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2815  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.84 
 
 
282 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.901844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2838  putative DNA-binding transcriptional regulator  25.84 
 
 
282 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0042  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  25.47 
 
 
267 aa  41.6  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0185  sugar phosphate isomerase  27.72 
 
 
397 aa  41.6  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>