52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3836 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3836  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 
188 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4594  3-hexulose-6-phosphate isomerase  46.28 
 
 
187 aa  166  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1850  6-phospho 3-hexuloisomerase  36.72 
 
 
186 aa  115  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2930  6-phospho 3-hexuloisomerase  36.56 
 
 
188 aa  114  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000566835 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0217  SIS domain-containing protein  36.52 
 
 
182 aa  112  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0594  sugar isomerase (SIS)  36.17 
 
 
182 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0608  sugar isomerase (SIS)  36.17 
 
 
182 aa  107  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3213  6-phospho 3-hexuloisomerase  35 
 
 
187 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2737  sugar isomerase (SIS)  33.15 
 
 
183 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2813  sugar isomerase (SIS)  33.15 
 
 
183 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0993  hexulose-6-phosphate isomerase  32.12 
 
 
200 aa  98.2  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.830093  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  34.25 
 
 
389 aa  94.4  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2411  6-phospho 3-hexuloisomerase  27.14 
 
 
199 aa  94  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  36.31 
 
 
177 aa  92.4  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  36.31 
 
 
177 aa  92.4  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0132  hexulose-6-phosphate isomerase  28.98 
 
 
180 aa  91.3  7e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5672  6-phospho 3-hexuloisomerase  35.03 
 
 
194 aa  88.2  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.343688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3056  sugar isomerase (SIS)  28.32 
 
 
186 aa  87  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0308  sugar isomerase (SIS)  30.1 
 
 
206 aa  85.9  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1650  sugar isomerase (SIS)  31.64 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000127624 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1889  hexulose-6-phosphate isomerase  31.18 
 
 
202 aa  85.5  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  31.11 
 
 
202 aa  84  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3252  3-hexulose-6-phosphate isomerase  29.94 
 
 
186 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  0.405094 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  26.87 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3709  hexulose-6-phosphate isomerase  32.96 
 
 
200 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0910  sugar isomerase (SIS)  29.1 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510158  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1199  sugar isomerase (SIS)  29.89 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.645191  normal  0.0117075 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0552  sugar isomerase  31.29 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1653  hexulose-6-phosphate isomerase  32.04 
 
 
181 aa  79  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1367  hexulose-6-phosphate isomerase  27.01 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  26.9 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  27.81 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0610  6-phospho 3-hexuloisomerase  31.64 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1507  sugar isomerase (SIS)  25.91 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1579  sugar isomerase (SIS)  30.94 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.208067  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0808  hexulose-6-phosphate isomerase  31.07 
 
 
202 aa  72  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0616  sugar isomerase (SIS)  28.57 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.764233 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3031  sugar isomerase (SIS)  25 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0236  hexulose-6-phosphate isomerase  31.67 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.249011 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0638  sugar isomerase (SIS)  26.71 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1130  6-phospho 3-hexuloisomerase  32.91 
 
 
209 aa  63.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5015  KpsF/GutQ family protein  29.65 
 
 
329 aa  48.1  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.336764 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1749  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  25.95 
 
 
319 aa  46.2  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0800  sugar phosphate isomerase  22.68 
 
 
320 aa  45.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3105  KpsF/GutQ family protein  31.07 
 
 
324 aa  44.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.345406  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3219  polysialic acid capsule expression protein KpsF  24.42 
 
 
339 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  29.09 
 
 
280 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02764  hypothetical protein  24.85 
 
 
339 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000908304  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02814  conserved hypothetical protein  24.85 
 
 
339 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2959  KpsF/GutQ family sugar isomerase  24.34 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0467  transcriptional regulator  25.58 
 
 
242 aa  42  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00031412  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0727  KpsF/GutQ family protein  29.91 
 
 
340 aa  41.2  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.516394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>