More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1889 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1889  hexulose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 202 aa  403  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  59.8 
 
 		 204 aa  250  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2411  6-phospho 3-hexuloisomerase  44.74 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0910  sugar isomerase (SIS)  44.74 
 
 		 190 aa  175  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1199  sugar isomerase (SIS)  44.21 
 
 		 191 aa  170  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.645191  normal  0.0117075 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1507  sugar isomerase (SIS)  40.53 
 
 		 211 aa  169  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0993  hexulose-6-phosphate isomerase  44.21 
 
 		 200 aa  169  4e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.830093  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  42.93 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  40.59 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0308  sugar isomerase (SIS)  43.16 
 
 		 206 aa  147  9e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0236  hexulose-6-phosphate isomerase  40.87 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.249011 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3031  sugar isomerase (SIS)  36.6 
 
 		 194 aa  141  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1130  6-phospho 3-hexuloisomerase  50.64 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0616  sugar isomerase (SIS)  47.17 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.764233 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0808  hexulose-6-phosphate isomerase  42.71 
 
 		 202 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0610  6-phospho 3-hexuloisomerase  42.71 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1579  sugar isomerase (SIS)  40.1 
 
 		 202 aa  131  7.999999999999999e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.208067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3213  6-phospho 3-hexuloisomerase  39.15 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0217  SIS domain-containing protein  35.26 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0638  sugar isomerase (SIS)  38.92 
 
 		 178 aa  129  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0608  sugar isomerase (SIS)  37.37 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0594  sugar isomerase (SIS)  37.37 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  37.63 
 
 		 389 aa  125  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  38.98 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2737  sugar isomerase (SIS)  34.95 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2813  sugar isomerase (SIS)  34.95 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1650  sugar isomerase (SIS)  37.5 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127624 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  40.24 
 
 		 177 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  40.24 
 
 		 177 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1850  6-phospho 3-hexuloisomerase  35.71 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3252  3-hexulose-6-phosphate isomerase  33.7 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  0.405094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1653  hexulose-6-phosphate isomerase  34.41 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2930  6-phospho 3-hexuloisomerase  35.32 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000566835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4594  3-hexulose-6-phosphate isomerase  35.14 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0132  hexulose-6-phosphate isomerase  33.7 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5672  6-phospho 3-hexuloisomerase  34.43 
 
 		 194 aa  98.6  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.343688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1367  hexulose-6-phosphate isomerase  29.44 
 
 		 185 aa  91.3  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3056  sugar isomerase (SIS)  27.78 
 
 		 186 aa  90.5  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3709  hexulose-6-phosphate isomerase  33.51 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3836  sugar isomerase (SIS)  31.18 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0552  sugar isomerase  25.32 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0185  sugar phosphate isomerase  28.78 
 
 		 397 aa  67.8  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  32.48 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02814  conserved hypothetical protein  31.08 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  42.27 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02764  hypothetical protein  31.08 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000908304  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.56 
 
 		 328 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  29.56 
 
 		 328 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.56 
 
 		 328 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.56 
 
 		 328 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.56 
 
 		 328 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.56 
 
 		 328 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  28.26 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.56 
 
 		 328 aa  58.2  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  29.56 
 
 		 328 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  28.65 
 
 		 326 aa  58.5  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.63 
 
 		 328 aa  58.2  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  27.88 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.56 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3219  polysialic acid capsule expression protein KpsF  30.41 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  25.95 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.56 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.56 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  29.56 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.56 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.56 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0338  transcriptional regulator, RpiR family  31.3 
 
 		 282 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  33.65 
 
 		 282 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  30.13 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  28.93 
 
 		 328 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  30.82 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  25.97 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  27.32 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  31.58 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.49 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1243  transcriptional regulator  27.5 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.665754  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001785  arabinose 5-phosphate isomerase  34.4 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1393  KpsF/GutQ family protein  33.07 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.49 
 
 		 345 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  35.79 
 
 		 327 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  33.33 
 
 		 330 aa  55.1  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  30.16 
 
 		 321 aa  55.1  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  32.12 
 
 		 321 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  25.29 
 
 		 324 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  30.19 
 
 		 324 aa  54.7  0.0000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  32.99 
 
 		 340 aa  54.7  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  27.03 
 
 		 325 aa  54.7  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  28.3 
 
 		 357 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  28.3 
 
 		 328 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1544  transcriptional regulator, RpiR family  28.95 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  24.86 
 
 		 324 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0503  KpsF/GutQ family protein  30.08 
 
 		 311 aa  53.9  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  25.67 
 
 		 325 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1590  RpiR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000388341  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1541  RpiR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 266 aa  53.9  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000907266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 279 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  29.84 
 
 		 322 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  28.93 
 
 		 323 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  28.3 
 
 		 342 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>