159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2737 on replicon NC_009477
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009477  SaurJH9_2737  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 
183 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2813  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 
183 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0594  sugar isomerase (SIS)  70.88 
 
 
182 aa  266  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0608  sugar isomerase (SIS)  70.88 
 
 
182 aa  266  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0217  SIS domain-containing protein  69.78 
 
 
182 aa  261  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1199  sugar isomerase (SIS)  38.95 
 
 
191 aa  137  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.645191  normal  0.0117075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0910  sugar isomerase (SIS)  37.57 
 
 
190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510158  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2411  6-phospho 3-hexuloisomerase  39.15 
 
 
199 aa  135  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3213  6-phospho 3-hexuloisomerase  41.71 
 
 
187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1507  sugar isomerase (SIS)  35.94 
 
 
211 aa  132  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1653  hexulose-6-phosphate isomerase  42.86 
 
 
181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  40.45 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  40.45 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  38.76 
 
 
389 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1850  6-phospho 3-hexuloisomerase  41.81 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0993  hexulose-6-phosphate isomerase  36.6 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.830093  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0308  sugar isomerase (SIS)  34.83 
 
 
206 aa  124  9e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1650  sugar isomerase (SIS)  41.24 
 
 
186 aa  123  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000127624 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1889  hexulose-6-phosphate isomerase  34.95 
 
 
202 aa  122  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  37.13 
 
 
204 aa  120  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  41.21 
 
 
202 aa  121  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0236  hexulose-6-phosphate isomerase  42.5 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.249011 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3031  sugar isomerase (SIS)  35.71 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1579  sugar isomerase (SIS)  36.5 
 
 
202 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.208067  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0808  hexulose-6-phosphate isomerase  39.5 
 
 
202 aa  115  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0616  sugar isomerase (SIS)  36.68 
 
 
201 aa  115  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.764233 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0610  6-phospho 3-hexuloisomerase  38 
 
 
202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3252  3-hexulose-6-phosphate isomerase  39.55 
 
 
186 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  0.405094 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0638  sugar isomerase (SIS)  37.14 
 
 
178 aa  114  6e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  32.81 
 
 
205 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  33.13 
 
 
194 aa  111  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1130  6-phospho 3-hexuloisomerase  40.13 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4594  3-hexulose-6-phosphate isomerase  35.11 
 
 
187 aa  104  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0132  hexulose-6-phosphate isomerase  32.24 
 
 
180 aa  99  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3836  sugar isomerase (SIS)  33.15 
 
 
188 aa  98.6  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3056  sugar isomerase (SIS)  32.57 
 
 
186 aa  97.8  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1367  hexulose-6-phosphate isomerase  32 
 
 
185 aa  97.4  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5672  6-phospho 3-hexuloisomerase  37.5 
 
 
194 aa  95.9  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.343688 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0552  sugar isomerase  33.33 
 
 
188 aa  95.5  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2930  6-phospho 3-hexuloisomerase  31.38 
 
 
188 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000566835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3709  hexulose-6-phosphate isomerase  37.5 
 
 
200 aa  86.3  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1544  transcriptional regulator, RpiR family  24.07 
 
 
279 aa  59.7  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  32.56 
 
 
282 aa  55.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3022  transcriptional regulator, RpiR family  30.15 
 
 
262 aa  54.7  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0727  KpsF/GutQ family protein  30.77 
 
 
340 aa  54.3  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.516394  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  28.99 
 
 
327 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  28.99 
 
 
327 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0335  KpsF/GutQ family protein  28.78 
 
 
334 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00223142  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0185  sugar phosphate isomerase  28.31 
 
 
397 aa  52.4  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  28.95 
 
 
331 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3965  KpsF/GutQ family protein  28.07 
 
 
330 aa  51.2  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  28.99 
 
 
327 aa  51.2  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1243  transcriptional regulator  27.56 
 
 
283 aa  50.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.665754  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  30.43 
 
 
330 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2797  KpsF/GutQ family protein  28.99 
 
 
327 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
304 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4269  KpsF/GutQ family protein  28.16 
 
 
354 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12348  Sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  29.37 
 
 
321 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1281  KpsF/GutQ family protein  25.9 
 
 
334 aa  49.3  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2704  KpsF/GutQ family protein  31.13 
 
 
327 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2172  KpsF/GutQ family protein  28.99 
 
 
327 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0331  KpsF/GutQ family protein  27.54 
 
 
346 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2846  KpsF/GutQ family protein  31.13 
 
 
327 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  28.99 
 
 
327 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1665  KpsF/GutQ family protein  27.03 
 
 
320 aa  49.3  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.309824  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
282 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29100  transcriptional regulator  24.8 
 
 
290 aa  49.3  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0529  KpsF/GutQ family protein  31.13 
 
 
327 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64598  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  30.53 
 
 
327 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0300  RpiR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
266 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0307  hypothetical protein  32.69 
 
 
266 aa  48.5  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  30.61 
 
 
341 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  29.35 
 
 
330 aa  48.5  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  30.53 
 
 
327 aa  48.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2815  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.32 
 
 
282 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.901844 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  28.97 
 
 
333 aa  47.4  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2734  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.32 
 
 
282 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2838  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.32 
 
 
282 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  25 
 
 
272 aa  47  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2950  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.32 
 
 
282 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  28.97 
 
 
359 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2775  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.32 
 
 
282 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1123  KpsF/GutQ family protein  26.95 
 
 
342 aa  47.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  28.48 
 
 
320 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  28.48 
 
 
320 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  29.84 
 
 
338 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  25.78 
 
 
326 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  26.02 
 
 
324 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0363  KpsF/GutQ family protein  27.34 
 
 
344 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103679  normal  0.93857 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1747  KpsF/GutQ  28.1 
 
 
326 aa  45.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001785  arabinose 5-phosphate isomerase  25.56 
 
 
329 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2110  KpsF/GutQ family protein  24.72 
 
 
332 aa  45.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4064  KpsF/GutQ family protein  26.61 
 
 
348 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2788  RpiR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
285 aa  45.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.293627 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0807  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  30.66 
 
 
346 aa  45.1  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0151  transcriptional regulator, RpiR family  25.83 
 
 
243 aa  45.4  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4187  KpsF/GutQ family protein  26.61 
 
 
348 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0718  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  30.66 
 
 
346 aa  45.4  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  25.55 
 
 
324 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4212  KpsF/GutQ family protein  26.61 
 
 
348 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>