77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1850 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1850  6-phospho 3-hexuloisomerase  100 
 
 
186 aa  375  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3213  6-phospho 3-hexuloisomerase  52.94 
 
 
187 aa  202  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3252  3-hexulose-6-phosphate isomerase  45.99 
 
 
186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  0.405094 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1650  sugar isomerase (SIS)  43.01 
 
 
186 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000127624 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0217  SIS domain-containing protein  42.94 
 
 
182 aa  132  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0608  sugar isomerase (SIS)  40.86 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0594  sugar isomerase (SIS)  40.86 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2813  sugar isomerase (SIS)  41.81 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2737  sugar isomerase (SIS)  41.81 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2930  6-phospho 3-hexuloisomerase  38.42 
 
 
188 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000566835 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  39.25 
 
 
204 aa  123  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0308  sugar isomerase (SIS)  38.01 
 
 
206 aa  124  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  43.48 
 
 
389 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2411  6-phospho 3-hexuloisomerase  36.46 
 
 
199 aa  119  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0132  hexulose-6-phosphate isomerase  36.16 
 
 
180 aa  117  7.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5672  6-phospho 3-hexuloisomerase  41.44 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.343688 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  40.99 
 
 
194 aa  115  5e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  42.77 
 
 
177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1889  hexulose-6-phosphate isomerase  35.71 
 
 
202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  42.77 
 
 
177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  39.87 
 
 
202 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  33.33 
 
 
205 aa  110  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1199  sugar isomerase (SIS)  35.23 
 
 
191 aa  110  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.645191  normal  0.0117075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0910  sugar isomerase (SIS)  33.52 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510158  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0236  hexulose-6-phosphate isomerase  34.62 
 
 
209 aa  108  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.249011 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1507  sugar isomerase (SIS)  32.96 
 
 
211 aa  106  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0993  hexulose-6-phosphate isomerase  33.15 
 
 
200 aa  105  4e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.830093  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3836  sugar isomerase (SIS)  36.72 
 
 
188 aa  105  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3709  hexulose-6-phosphate isomerase  41.67 
 
 
200 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0808  hexulose-6-phosphate isomerase  37.14 
 
 
202 aa  103  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0616  sugar isomerase (SIS)  36.31 
 
 
201 aa  103  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.764233 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1579  sugar isomerase (SIS)  36.09 
 
 
202 aa  103  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.208067  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0610  6-phospho 3-hexuloisomerase  37.14 
 
 
202 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1653  hexulose-6-phosphate isomerase  36.7 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3056  sugar isomerase (SIS)  35.93 
 
 
186 aa  97.1  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1130  6-phospho 3-hexuloisomerase  34.38 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3031  sugar isomerase (SIS)  29.79 
 
 
194 aa  96.3  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1367  hexulose-6-phosphate isomerase  31.87 
 
 
185 aa  95.5  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0638  sugar isomerase (SIS)  31.17 
 
 
178 aa  88.2  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0552  sugar isomerase  30.43 
 
 
188 aa  88.2  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4594  3-hexulose-6-phosphate isomerase  29.94 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0185  sugar phosphate isomerase  29.77 
 
 
397 aa  58.5  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  29.52 
 
 
280 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  28.32 
 
 
338 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  28.69 
 
 
272 aa  48.9  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5015  KpsF/GutQ family protein  35.64 
 
 
329 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.336764 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2136  transcriptional regulator, RpiR family  29.91 
 
 
284 aa  48.9  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0042  RpiR family phosphosugar-binding transcriptional regulator  28.21 
 
 
267 aa  47  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  27.11 
 
 
341 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0307  hypothetical protein  29.63 
 
 
266 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3418  KpsF/GutQ  30.69 
 
 
332 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000032508  normal  0.585789 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0300  RpiR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
266 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3564  RpiR family transcriptional regulator  24.02 
 
 
284 aa  45.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.536409  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  25 
 
 
304 aa  45.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  21.95 
 
 
333 aa  44.7  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2604  RpiR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
242 aa  44.7  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0875  putative transcriptional regulator, RpiR family  24.26 
 
 
287 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4997  KpsF/GutQ family protein  26.19 
 
 
333 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0692534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0192  KpsF/GutQ family protein  26.19 
 
 
334 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3071  transcriptional regulator, RpiR family  28.7 
 
 
261 aa  42.7  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3105  KpsF/GutQ family protein  22.37 
 
 
324 aa  42  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.345406  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0151  transcriptional regulator, RpiR family  32.32 
 
 
243 aa  41.6  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  25.79 
 
 
345 aa  42  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0696  RpiR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
289 aa  41.6  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000925251  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4698  sugar isomerase (SIS)  21.16 
 
 
199 aa  42  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0917  putative transcriptional regulator, RpiR family  23.08 
 
 
287 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.47337e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0782  RpiR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
287 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0821  RpiR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
287 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  25.16 
 
 
345 aa  41.6  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0717  RpiR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
287 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  21.34 
 
 
327 aa  41.2  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0179  RpiR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
279 aa  41.2  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0912  RpiR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
287 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1252  KpsF/GutQ family protein  26.81 
 
 
338 aa  41.2  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465409  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0986  putative transcriptional regulator, RpiR family  23.78 
 
 
287 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0182  RpiR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
279 aa  41.2  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0731  RpiR family transcriptional regulator  23.78 
 
 
287 aa  41.2  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>