288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4698 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4698  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 		 199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0436  sugar isomerase (SIS)  73.33 
 
 		 201 aa  295  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0369  SIS domain-containing protein  73.33 
 
 		 201 aa  295  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1226  SIS domain-containing protein  72.82 
 
 		 201 aa  292  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.939122 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  38.27 
 
 		 331 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2308  KpsF/GutQ family protein  41.01 
 
 		 333 aa  141  5e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5916  KpsF/GutQ family protein  38.14 
 
 		 310 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0826034  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  39.05 
 
 		 340 aa  139  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1886  arabinose 5-phosphate isomerase  36.92 
 
 		 317 aa  139  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.106886  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0335  KpsF/GutQ family protein  42.24 
 
 		 334 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00223142  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7389  KpsF/GutQ  38.66 
 
 		 310 aa  137  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1749  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  36.18 
 
 		 319 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  36.79 
 
 		 335 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  38.98 
 
 		 339 aa  131  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02814  conserved hypothetical protein  34.95 
 
 		 339 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  35.56 
 
 		 328 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02764  hypothetical protein  34.95 
 
 		 339 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000908304  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  36.67 
 
 		 326 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  40.94 
 
 		 344 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  34.57 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  31.79 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3219  polysialic acid capsule expression protein KpsF  34.41 
 
 		 339 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  37.85 
 
 		 326 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3809  arabinose-5-phosphate isomerase  36.55 
 
 		 340 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  37.7 
 
 		 335 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1114  arabinose 5-phosphate isomerase  36.18 
 
 		 320 aa  128  6e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6185  KpsF/GutQ family protein  37.85 
 
 		 291 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  37.23 
 
 		 329 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  39.24 
 
 		 330 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0591  KpsF/GutQ family protein  32.63 
 
 		 329 aa  127  1.0000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000664449  hitchhiker  0.000000000000829793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0776  KpsF/GutQ family protein  35.64 
 
 		 324 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3603  KpsF/GutQ family protein  36.87 
 
 		 324 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.478278 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  37.93 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  36.7 
 
 		 326 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  34.55 
 
 		 321 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  38.99 
 
 		 330 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  35.48 
 
 		 326 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  37.72 
 
 		 326 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.181851 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  34.32 
 
 		 319 aa  126  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2063  KpsF/GutQ family protein  38.18 
 
 		 321 aa  125  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.806095  normal  0.101433 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0213  KpsF/GutQ  34.21 
 
 		 320 aa  125  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  35.83 
 
 		 320 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  35.83 
 
 		 320 aa  125  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1362  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  37.23 
 
 		 333 aa  125  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  38.01 
 
 		 324 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  36.51 
 
 		 332 aa  124  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  38.01 
 
 		 324 aa  124  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  36.97 
 
 		 324 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  35.42 
 
 		 321 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5962  KpsF/GutQ family protein  38.24 
 
 		 322 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3262  arabinose-5-phosphate isomerase  36.7 
 
 		 351 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1393  KpsF/GutQ family protein  33.51 
 
 		 310 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  33.51 
 
 		 321 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  38.32 
 
 		 333 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  33.85 
 
 		 325 aa  123  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0298  KpsF/GutQ family sugar isomerase  36.36 
 
 		 322 aa  123  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  32.4 
 
 		 315 aa  123  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0617  KpsF/GutQ family protein  35.33 
 
 		 319 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.851934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  36.6 
 
 		 333 aa  122  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1665  KpsF/GutQ family protein  35.64 
 
 		 320 aa  122  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.309824  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25501  putative polysialic acid capsule expression protein KpsF  38.51 
 
 		 347 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3213  KpsF/GutQ family protein  33.5 
 
 		 331 aa  122  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3211  KpsF/GutQ family sugar isomerase  36.7 
 
 		 311 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  33.68 
 
 		 325 aa  122  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3249  KpsF/GutQ family sugar isomerase  36.7 
 
 		 311 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212815  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  35.11 
 
 		 333 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  34.54 
 
 		 325 aa  122  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0064  KpsF/GutQ family protein  37.74 
 
 		 321 aa  121  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  36.27 
 
 		 330 aa  121  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0282  KpsF/GutQ family protein  38.31 
 
 		 321 aa  121  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  36.97 
 
 		 324 aa  121  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  35.23 
 
 		 328 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001785  arabinose 5-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 329 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  34.04 
 
 		 310 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  37.74 
 
 		 326 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  35.71 
 
 		 357 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  35.05 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  36.84 
 
 		 324 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  34.04 
 
 		 327 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0720  KpsF/GutQ family protein  33.51 
 
 		 325 aa  119  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  36 
 
 		 324 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12348  Sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  35 
 
 		 321 aa  119  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1810  KpsF/GutQ  33.51 
 
 		 326 aa  119  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220338  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1747  KpsF/GutQ  34.29 
 
 		 326 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  35.6 
 
 		 321 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5735  D-arabinose 5-phosphate isomerase  34.36 
 
 		 320 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  33.85 
 
 		 323 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0183  KpsF/GutQ family protein  37.93 
 
 		 337 aa  118  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.367959  normal  0.0516701 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0404  KpsF/GutQ family protein  38.06 
 
 		 323 aa  118  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.126623 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  37.74 
 
 		 324 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3575  D-arabinose 5-phosphate isomerase  38.99 
 
 		 323 aa  118  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.521049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  36.99 
 
 		 330 aa  118  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  36.87 
 
 		 324 aa  117  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  33.51 
 
 		 327 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  36.27 
 
 		 328 aa  117  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  41.67 
 
 		 339 aa  117  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  34.2 
 
 		 342 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5957  KpsF/GutQ family protein  33.33 
 
 		 334 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  34.2 
 
 		 357 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  36.87 
 
 		 324 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>