46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0185 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0185  sugar phosphate isomerase  100 
 
 		 397 aa  818    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0132  hexulose-6-phosphate isomerase  33.04 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  27.98 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1889  hexulose-6-phosphate isomerase  28.78 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0308  sugar isomerase (SIS)  31.21 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3213  6-phospho 3-hexuloisomerase  37.61 
 
 		 187 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  32.88 
 
 		 389 aa  66.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  28.65 
 
 		 204 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0910  sugar isomerase (SIS)  36.54 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1653  hexulose-6-phosphate isomerase  30.25 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2411  6-phospho 3-hexuloisomerase  27.17 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3031  sugar isomerase (SIS)  27.47 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1199  sugar isomerase (SIS)  34.58 
 
 		 191 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.645191  normal  0.0117075 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  30 
 
 		 205 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1850  6-phospho 3-hexuloisomerase  29.77 
 
 		 186 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0236  hexulose-6-phosphate isomerase  28.5 
 
 		 209 aa  57  0.0000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.249011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  28.92 
 
 		 177 aa  57  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  28.92 
 
 		 177 aa  57  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1579  sugar isomerase (SIS)  27.07 
 
 		 202 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.208067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1507  sugar isomerase (SIS)  30.33 
 
 		 211 aa  56.2  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0217  SIS domain-containing protein  27.46 
 
 		 182 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0808  hexulose-6-phosphate isomerase  35.8 
 
 		 202 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1130  6-phospho 3-hexuloisomerase  31.74 
 
 		 209 aa  54.7  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0616  sugar isomerase (SIS)  39 
 
 		 201 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.764233 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0610  6-phospho 3-hexuloisomerase  43.33 
 
 		 202 aa  54.7  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0608  sugar isomerase (SIS)  26.67 
 
 		 182 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0594  sugar isomerase (SIS)  26.67 
 
 		 182 aa  54.3  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3709  hexulose-6-phosphate isomerase  30 
 
 		 200 aa  53.9  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2737  sugar isomerase (SIS)  28.31 
 
 		 183 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2813  sugar isomerase (SIS)  28.31 
 
 		 183 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0993  hexulose-6-phosphate isomerase  26.99 
 
 		 200 aa  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.830093  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0638  sugar isomerase (SIS)  29.03 
 
 		 178 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3252  3-hexulose-6-phosphate isomerase  26.45 
 
 		 186 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  0.405094 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  29.59 
 
 		 194 aa  47.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5672  6-phospho 3-hexuloisomerase  27.94 
 
 		 194 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.343688 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0151  transcriptional regulator, RpiR family  32.99 
 
 		 243 aa  46.2  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4460  putative transcriptional regulator, RpiR family  29.7 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.857974 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1650  sugar isomerase (SIS)  30.28 
 
 		 186 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1394  transcriptional regulator, RpiR family  26.87 
 
 		 285 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0784467  normal  0.640102 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0717  RpiR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 287 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0917  putative transcriptional regulator, RpiR family  28.71 
 
 		 287 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.47337e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0782  RpiR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 287 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1468  transcriptional regulator, RpiR family  29.59 
 
 		 286 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000610661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0912  RpiR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 287 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0821  RpiR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 287 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1367  hexulose-6-phosphate isomerase  29.84 
 
 		 185 aa  42.7  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>