More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0638 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0638  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 		 178 aa  359  9e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0308  sugar isomerase (SIS)  43.01 
 
 		 206 aa  143  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  44.74 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0616  sugar isomerase (SIS)  44.04 
 
 		 201 aa  133  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.764233 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0910  sugar isomerase (SIS)  39.88 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1889  hexulose-6-phosphate isomerase  38.92 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0808  hexulose-6-phosphate isomerase  44.56 
 
 		 202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1579  sugar isomerase (SIS)  41.97 
 
 		 202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.208067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0610  6-phospho 3-hexuloisomerase  41.97 
 
 		 202 aa  127  6e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1199  sugar isomerase (SIS)  38.86 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.645191  normal  0.0117075 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1130  6-phospho 3-hexuloisomerase  47.4 
 
 		 209 aa  122  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0608  sugar isomerase (SIS)  37.64 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0594  sugar isomerase (SIS)  37.64 
 
 		 182 aa  122  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  35.88 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0217  SIS domain-containing protein  37.5 
 
 		 182 aa  121  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0236  hexulose-6-phosphate isomerase  41.15 
 
 		 209 aa  121  6e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.249011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  37.79 
 
 		 389 aa  120  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1507  sugar isomerase (SIS)  39.13 
 
 		 211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  34.95 
 
 		 204 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0993  hexulose-6-phosphate isomerase  37.57 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.830093  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  38.46 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  38.46 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2813  sugar isomerase (SIS)  37.14 
 
 		 183 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2737  sugar isomerase (SIS)  37.14 
 
 		 183 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3031  sugar isomerase (SIS)  37.35 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1653  hexulose-6-phosphate isomerase  40.52 
 
 		 181 aa  111  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2411  6-phospho 3-hexuloisomerase  36.31 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  35.33 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3213  6-phospho 3-hexuloisomerase  34.29 
 
 		 187 aa  104  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0132  hexulose-6-phosphate isomerase  33.93 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3252  3-hexulose-6-phosphate isomerase  33.33 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  0.405094 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1850  6-phospho 3-hexuloisomerase  31.17 
 
 		 186 aa  88.2  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2930  6-phospho 3-hexuloisomerase  35.4 
 
 		 188 aa  87.8  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000566835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1367  hexulose-6-phosphate isomerase  27.37 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5672  6-phospho 3-hexuloisomerase  30.81 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.343688 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1650  sugar isomerase (SIS)  31.07 
 
 		 186 aa  80.9  0.000000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3709  hexulose-6-phosphate isomerase  35.95 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  34.27 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3056  sugar isomerase (SIS)  30.92 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  28.65 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  28.82 
 
 		 324 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  30.12 
 
 		 329 aa  72  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  33.11 
 
 		 323 aa  72  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  28.82 
 
 		 324 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  30.77 
 
 		 333 aa  71.6  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  30.99 
 
 		 330 aa  71.2  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2023  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.71 
 
 		 289 aa  71.2  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.197371  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  28.24 
 
 		 324 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  31.82 
 
 		 315 aa  71.2  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2135  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.71 
 
 		 301 aa  71.2  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2413  DNA-binding transcriptional regulator HexR  30.71 
 
 		 301 aa  71.2  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000012699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  30.77 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  28.07 
 
 		 324 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  30.41 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  32.87 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1891  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.9 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  32.21 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  27.06 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  30.87 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  32.17 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  32.45 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2137  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.33 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00439922  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  30.77 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1865  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.9 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0552  sugar isomerase  27.89 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2129  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.32 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00123484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2255  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.32 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000281724  hitchhiker  0.00000550313 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2242  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.32 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4528  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.32 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2174  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.32 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.271639  normal  0.12603 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2047  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.32 
 
 		 284 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1928  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.32 
 
 		 284 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0915843  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2336  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.32 
 
 		 284 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.760972  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2152  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.32 
 
 		 284 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.284863  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1831  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.33 
 
 		 289 aa  68.2  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2490  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.32 
 
 		 284 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2115  DNA-binding transcriptional regulator HexR  33.33 
 
 		 308 aa  67.8  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2080  DNA-binding transcriptional regulator HexR  28.32 
 
 		 286 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00496237  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  29.93 
 
 		 340 aa  67  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2049  DNA-binding transcriptional regulator HexR  29.58 
 
 		 284 aa  67  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000665792  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1686  transcriptional regulator  25.42 
 
 		 272 aa  67  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0801516  hitchhiker  0.000000000302216 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  32 
 
 		 321 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1813  DNA-binding transcriptional regulator HexR  27.75 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000867158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  32.17 
 
 		 325 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  32 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1080  RpiR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0801962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  31.47 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2245  DNA-binding transcriptional regulator HexR  31.94 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  26.78 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0521  RpiR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.207231  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2046  DNA-binding transcriptional regulator HexR  32.14 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.45003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  28.65 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2041  DNA-binding transcriptional regulator HexR  32.14 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2101  DNA-binding transcriptional regulator HexR  32.14 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.928102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  31.47 
 
 		 321 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1237  DNA-binding transcriptional regulator HexR  32.14 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.101978  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  34.27 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  27.95 
 
 		 325 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  30.07 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>