More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1579 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1579  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 		 202 aa  407  1e-113  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.208067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0610  6-phospho 3-hexuloisomerase  88.61 
 
 		 202 aa  348  4e-95  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0616  sugar isomerase (SIS)  84.58 
 
 		 201 aa  337  9.999999999999999e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.764233 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0808  hexulose-6-phosphate isomerase  82.67 
 
 		 202 aa  326  1.0000000000000001e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0308  sugar isomerase (SIS)  64.32 
 
 		 206 aa  273  1.0000000000000001e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  56.7 
 
 		 202 aa  224  7e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0236  hexulose-6-phosphate isomerase  59.59 
 
 		 209 aa  221  7e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.249011 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1130  6-phospho 3-hexuloisomerase  56.48 
 
 		 209 aa  214  5e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0910  sugar isomerase (SIS)  44.79 
 
 		 190 aa  159  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1199  sugar isomerase (SIS)  41.97 
 
 		 191 aa  149  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.645191  normal  0.0117075 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1507  sugar isomerase (SIS)  42.31 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2411  6-phospho 3-hexuloisomerase  41.21 
 
 		 199 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0993  hexulose-6-phosphate isomerase  41.44 
 
 		 200 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.830093  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1889  hexulose-6-phosphate isomerase  40.1 
 
 		 202 aa  138  7e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0638  sugar isomerase (SIS)  42.49 
 
 		 178 aa  134  7.000000000000001e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  37.36 
 
 		 204 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3031  sugar isomerase (SIS)  40.24 
 
 		 194 aa  129  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0132  hexulose-6-phosphate isomerase  39.06 
 
 		 180 aa  129  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2813  sugar isomerase (SIS)  36.5 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2737  sugar isomerase (SIS)  36.5 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  41.44 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3213  6-phospho 3-hexuloisomerase  36.53 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0217  SIS domain-containing protein  39.49 
 
 		 182 aa  116  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  35.29 
 
 		 389 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1850  6-phospho 3-hexuloisomerase  36.09 
 
 		 186 aa  112  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0594  sugar isomerase (SIS)  36.46 
 
 		 182 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0608  sugar isomerase (SIS)  36.46 
 
 		 182 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  35.12 
 
 		 194 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1653  hexulose-6-phosphate isomerase  35.48 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  39.88 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  39.88 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1650  sugar isomerase (SIS)  35.16 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5672  6-phospho 3-hexuloisomerase  37.02 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.343688 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2930  6-phospho 3-hexuloisomerase  35.54 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000566835 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1367  hexulose-6-phosphate isomerase  34.74 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3056  sugar isomerase (SIS)  31.84 
 
 		 186 aa  93.6  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3252  3-hexulose-6-phosphate isomerase  33.52 
 
 		 186 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  0.405094 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3709  hexulose-6-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3836  sugar isomerase (SIS)  30.94 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0552  sugar isomerase  31.22 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  29.57 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  41.18 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02327  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.18 
 
 		 285 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02288  hypothetical protein  41.18 
 
 		 285 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2713  RpiR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 285 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2563  RpiR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 285 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1252  RpiR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 285 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.102619 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2799  transcriptional regulator, RpiR family  41.18 
 
 		 285 aa  67  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.576789  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4594  3-hexulose-6-phosphate isomerase  28.34 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0300  RpiR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0307  hypothetical protein  30.99 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0185  sugar phosphate isomerase  27.07 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3657  transcriptional regulator, RpiR family  40.2 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4164  RpiR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.045816  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  30.23 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1050  transcriptional regulator, RpiR family  29.45 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  28.81 
 
 		 329 aa  58.5  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3662  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.62 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1993  transcriptional regulator, RpiR family  36.75 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.29 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.29 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.29 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  29.29 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.29 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  29.29 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.29 
 
 		 328 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.29 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.29 
 
 		 328 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.29 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.29 
 
 		 328 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.29 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1541  RpiR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000907266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.29 
 
 		 328 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  29.29 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  33.06 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1208  KpsF/GutQ family protein  29.2 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.905604 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  26.14 
 
 		 320 aa  55.1  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  31.07 
 
 		 326 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  29.27 
 
 		 282 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35980  transcriptional regulator, RpiR family  35.78 
 
 		 333 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.309329  normal  0.261129 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  25.37 
 
 		 323 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1544  transcriptional regulator, RpiR family  28.32 
 
 		 279 aa  53.9  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  30.43 
 
 		 333 aa  53.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0521  RpiR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 283 aa  53.9  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.207231  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0154  sugar isomerase (SIS)  27.15 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0727  KpsF/GutQ family protein  29.31 
 
 		 340 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.516394  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  25.37 
 
 		 323 aa  53.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1590  RpiR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 266 aa  53.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000388341  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  32.17 
 
 		 353 aa  52.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  26.11 
 
 		 324 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  30.43 
 
 		 359 aa  53.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4997  KpsF/GutQ family protein  31.54 
 
 		 333 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0692534 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  27.14 
 
 		 328 aa  52.4  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0363  KpsF/GutQ family protein  28.99 
 
 		 344 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103679  normal  0.93857 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  26.11 
 
 		 324 aa  52.8  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  26.89 
 
 		 319 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0731  RpiR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 287 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0335  KpsF/GutQ family protein  32.41 
 
 		 334 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00223142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>