More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0154 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0154  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 
205 aa  425  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3171  sugar isomerase (SIS)  43.27 
 
 
188 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0827  sugar isomerase (SIS)  39.44 
 
 
202 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2898  sugar isomerase (SIS)  42.05 
 
 
188 aa  148  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0146  sugar isomerase (SIS)  38.71 
 
 
216 aa  136  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1245  sugar isomerase (SIS)  41.28 
 
 
200 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0207  phosphoheptose isomerase  38.71 
 
 
216 aa  134  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0184  sugar isomerase (SIS)  40.8 
 
 
184 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4242  phosphoheptose isomerase  45.26 
 
 
193 aa  131  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.782615  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2365  phosphoheptose isomerase  34.86 
 
 
191 aa  125  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2563  sugar isomerase (SIS)  40.52 
 
 
185 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  37.58 
 
 
188 aa  121  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  38.93 
 
 
186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  35.26 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  36.88 
 
 
186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  35.26 
 
 
192 aa  118  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  36.81 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  38.78 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  39.07 
 
 
194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  34.81 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  37.34 
 
 
188 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  37.5 
 
 
196 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  35.56 
 
 
189 aa  115  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  37.27 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  36.08 
 
 
197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0144  sugar isomerase (SIS)  35.09 
 
 
198 aa  115  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  35.05 
 
 
197 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  35.05 
 
 
197 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  35.05 
 
 
197 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  35.05 
 
 
197 aa  115  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10114  phosphoheptose isomerase  38.1 
 
 
196 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  34.54 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  35.05 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  35.05 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  35.05 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  35.05 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  35.05 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  36.08 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  36.77 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  37.87 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  36.08 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  34.02 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1528  sugar isomerase (SIS)  38.98 
 
 
204 aa  112  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  34.02 
 
 
197 aa  112  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  35.05 
 
 
197 aa  112  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  36.69 
 
 
195 aa  111  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  35.81 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  33.53 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  33.51 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0717  phosphoheptose isomerase  38.89 
 
 
356 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
672 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  35.5 
 
 
197 aa  109  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0272  phosphoheptose isomerase  38.51 
 
 
199 aa  109  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  36.31 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  38.51 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  37.25 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  36.09 
 
 
195 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  35.03 
 
 
200 aa  108  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  36.6 
 
 
186 aa  108  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  38.56 
 
 
195 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  37.34 
 
 
200 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1574  sugar isomerase (SIS)  39.04 
 
 
196 aa  107  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.231624  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  36.42 
 
 
193 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  36.71 
 
 
210 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  37.13 
 
 
191 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  33.73 
 
 
198 aa  106  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1705  phosphoheptose isomerase  34.97 
 
 
195 aa  106  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  36.77 
 
 
193 aa  106  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  34.19 
 
 
189 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  34.38 
 
 
198 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  33.12 
 
 
212 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  34.05 
 
 
186 aa  106  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  34.62 
 
 
208 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0787  phosphoheptose isomerase  36.99 
 
 
194 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1369  phosphoheptose isomerase  35.76 
 
 
197 aa  105  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0427  sugar isomerase (SIS)  31.55 
 
 
208 aa  105  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5671  phosphoheptose isomerase  36.48 
 
 
198 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.1409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  35.44 
 
 
191 aa  105  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14411  putative phosphoheptose isomerase  34.12 
 
 
204 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  35.52 
 
 
197 aa  104  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  33.75 
 
 
280 aa  104  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004503  phosphoheptose isomerase  33.5 
 
 
196 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1296  phosphoheptose isomerase  34.78 
 
 
197 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  33.73 
 
 
201 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0501  phosphoheptose isomerase  34.81 
 
 
196 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.457964 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00889  hypothetical protein  34.01 
 
 
196 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  33.73 
 
 
201 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  36.48 
 
 
197 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  36.48 
 
 
197 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  36.48 
 
 
650 aa  102  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
192 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
192 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
192 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
192 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
192 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
197 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
197 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  35.8 
 
 
214 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  33.54 
 
 
187 aa  101  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  35.85 
 
 
197 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>