More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0184 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0184  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 		 184 aa  369  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1245  sugar isomerase (SIS)  45.6 
 
 		 200 aa  153  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2365  phosphoheptose isomerase  41.34 
 
 		 191 aa  144  8.000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0207  phosphoheptose isomerase  40.45 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0146  sugar isomerase (SIS)  40.45 
 
 		 216 aa  141  5e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0154  sugar isomerase (SIS)  40.8 
 
 		 205 aa  134  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0827  sugar isomerase (SIS)  37.21 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4242  phosphoheptose isomerase  37.91 
 
 		 193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.782615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00991  putative phosphoheptose isomerase  37.36 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3171  sugar isomerase (SIS)  37.43 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2898  sugar isomerase (SIS)  37.43 
 
 		 188 aa  110  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1528  sugar isomerase (SIS)  41.9 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14411  putative phosphoheptose isomerase  36.27 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  36.26 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  31.95 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  34.1 
 
 		 188 aa  99.8  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  29.28 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  35.76 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5603  sugar isomerase (SIS)  37.42 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.23973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  36.59 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2563  sugar isomerase (SIS)  29.78 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1337  phosphoheptose isomerase  31.72 
 
 		 206 aa  96.3  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0623143  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  37.34 
 
 		 195 aa  94.7  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  38.22 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4450  sugar isomerase (SIS)  38.89 
 
 		 222 aa  94.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.570371  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5634  putative phosphoheptose isomerase (sedoheptulose 7-phosphate isomerase)  34.44 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  34.87 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  31.21 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  36.05 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  37.86 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3812  sugar isomerase (SIS)  38.19 
 
 		 228 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.671592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  35.15 
 
 		 186 aa  91.7  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  38.27 
 
 		 210 aa  90.5  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  32.95 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  28.98 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  32.75 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  34 
 
 		 197 aa  89.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  35.92 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  34.78 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  34.78 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1763  phosphoheptose isomerase  31.94 
 
 		 246 aa  87.8  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1270  phosphoheptose isomerase  31.79 
 
 		 196 aa  87.8  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10114  phosphoheptose isomerase  33.11 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  37.14 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  30.23 
 
 		 192 aa  85.1  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0355  phosphoheptose isomerase  35.67 
 
 		 191 aa  85.1  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902024  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  32.45 
 
 		 358 aa  85.1  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  29.65 
 
 		 192 aa  85.1  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  32.45 
 
 		 358 aa  85.1  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  32.57 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  32.57 
 
 		 186 aa  84.7  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0787  phosphoheptose isomerase  31.69 
 
 		 194 aa  84.7  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  32.32 
 
 		 212 aa  84.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  30.92 
 
 		 189 aa  84.7  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1749  phosphoheptose isomerase  31.94 
 
 		 248 aa  84.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1296  phosphoheptose isomerase  34.67 
 
 		 197 aa  84.7  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  35.92 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0256  phosphoheptose isomerase  29.94 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.245661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  30.9 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0717  phosphoheptose isomerase  35.09 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  31.68 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  32.7 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  31.68 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0721  phosphoheptose isomerase  31.55 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  31.68 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  31.68 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  31.68 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  29.01 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  31.52 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1574  sugar isomerase (SIS)  31.43 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.231624  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 		 672 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5469  sugar isomerase family protein  30.37 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  30.28 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  31.68 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  31.68 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  29.63 
 
 		 650 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0473  phosphoheptose isomerase  32.88 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114293 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  30.32 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  31.25 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  30.77 
 
 		 197 aa  80.9  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  31.14 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0144  sugar isomerase (SIS)  34.29 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  31.21 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  32.34 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2337  phosphoheptose isomerase  27.37 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0506  phosphoheptose isomerase  30.18 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  31.45 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2916  phosphoheptose isomerase  29.38 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0759  phosphoheptose isomerase  35.66 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  32.34 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  31.47 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  30.92 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1335  phosphoheptose isomerase  34.57 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  33.52 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  29.41 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  29.49 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  32.03 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1892  putative phosphoheptose isomerase  36.05 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3872  phosphoheptose isomerase  35.21 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>