252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1337 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1337  phosphoheptose isomerase  100 
 
 
206 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0623143  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2365  phosphoheptose isomerase  35.48 
 
 
191 aa  125  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5634  putative phosphoheptose isomerase (sedoheptulose 7-phosphate isomerase)  37.78 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00991  putative phosphoheptose isomerase  38.2 
 
 
222 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14411  putative phosphoheptose isomerase  39.88 
 
 
204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0827  sugar isomerase (SIS)  31.49 
 
 
202 aa  108  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0154  sugar isomerase (SIS)  28.79 
 
 
205 aa  97.8  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0184  sugar isomerase (SIS)  31.72 
 
 
184 aa  96.3  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0146  sugar isomerase (SIS)  31.41 
 
 
216 aa  95.9  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0207  phosphoheptose isomerase  31.41 
 
 
216 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3171  sugar isomerase (SIS)  31.58 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  28.99 
 
 
210 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  30.59 
 
 
196 aa  92  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1245  sugar isomerase (SIS)  31.28 
 
 
200 aa  89.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  30.49 
 
 
196 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  30.49 
 
 
196 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  29.59 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4242  phosphoheptose isomerase  29.61 
 
 
193 aa  88.2  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.782615  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2898  sugar isomerase (SIS)  28.02 
 
 
188 aa  85.1  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  29.3 
 
 
186 aa  85.1  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2563  sugar isomerase (SIS)  29.44 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  32.53 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10114  phosphoheptose isomerase  30.22 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  29.73 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  34.33 
 
 
198 aa  82  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  29.73 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  31.33 
 
 
210 aa  82  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  32.88 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  26.95 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  30.3 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  36.3 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  31.61 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  33.58 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  33.58 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  33.58 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  33.58 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  33.58 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  31.06 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  28.74 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  31.25 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1528  sugar isomerase (SIS)  36.45 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  32.09 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  31.16 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1990  phosphoheptose isomerase  31.76 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  35.71 
 
 
650 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  32.84 
 
 
201 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  32.84 
 
 
201 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
672 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  28.47 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  28.97 
 
 
192 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  28.28 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  26.45 
 
 
188 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  28.57 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  26.34 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0721  phosphoheptose isomerase  32.35 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  34.67 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  26.59 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  27.81 
 
 
358 aa  75.9  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  33.78 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  27.81 
 
 
358 aa  75.9  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0144  sugar isomerase (SIS)  27.49 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1574  sugar isomerase (SIS)  24.86 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.231624  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  32.19 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  27.27 
 
 
186 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  31.34 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  28.32 
 
 
187 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1270  phosphoheptose isomerase  23.37 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  26.4 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  30.72 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0256  phosphoheptose isomerase  29.05 
 
 
213 aa  72  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.245661 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  25.4 
 
 
189 aa  72  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1705  phosphoheptose isomerase  27.91 
 
 
195 aa  72  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  25.13 
 
 
195 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2916  phosphoheptose isomerase  28.22 
 
 
211 aa  71.2  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  30.88 
 
 
189 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2337  phosphoheptose isomerase  31.33 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0272  phosphoheptose isomerase  25.91 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  30.94 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  31.11 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  28.12 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  30.82 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0787  phosphoheptose isomerase  22.6 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  30.41 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5603  sugar isomerase (SIS)  26.88 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.23973  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  28.19 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  29.33 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3812  phosphoheptose isomerase  26.74 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0616302  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  27.39 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0792  SIS domain-containing protein  30.94 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  30.37 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0686  phosphoheptose isomerase  30.88 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.111927  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0570  sugar isomerase (SIS)  26.44 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  30.37 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0687  phosphoheptose isomerase  30.94 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  30.37 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0506  phosphoheptose isomerase  27.4 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  26.98 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  26.98 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  26.98 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  26.98 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>