More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2365 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2365  phosphoheptose isomerase  100 
 
 		 191 aa  393  1e-109  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0827  sugar isomerase (SIS)  41.62 
 
 		 202 aa  151  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0184  sugar isomerase (SIS)  41.34 
 
 		 184 aa  144  8.000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0146  sugar isomerase (SIS)  35.33 
 
 		 216 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3171  sugar isomerase (SIS)  35.33 
 
 		 188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0207  phosphoheptose isomerase  35.91 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2898  sugar isomerase (SIS)  34.41 
 
 		 188 aa  128  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14411  putative phosphoheptose isomerase  38.55 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1337  phosphoheptose isomerase  35.48 
 
 		 206 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0623143  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0154  sugar isomerase (SIS)  34.86 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1528  sugar isomerase (SIS)  36.56 
 
 		 204 aa  123  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00991  putative phosphoheptose isomerase  34.69 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4242  phosphoheptose isomerase  35.26 
 
 		 193 aa  122  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.782615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1245  sugar isomerase (SIS)  36.11 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5634  putative phosphoheptose isomerase (sedoheptulose 7-phosphate isomerase)  34.44 
 
 		 202 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10114  phosphoheptose isomerase  37.18 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  35.9 
 
 		 188 aa  110  9e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  39.73 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  35.67 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  33.68 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0258  phosphoheptose isomerase  33.68 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  35.71 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  32.39 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  35.19 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  34.19 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  30.46 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  28.81 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  37.59 
 
 		 200 aa  101  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  32.53 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  28.93 
 
 		 188 aa  101  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  32.53 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  29.69 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  32.2 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  27.96 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  34.67 
 
 		 197 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  34.67 
 
 		 197 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  32.34 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  32.14 
 
 		 210 aa  99  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  31.05 
 
 		 192 aa  98.6  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  31.05 
 
 		 192 aa  98.6  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  31.05 
 
 		 192 aa  98.6  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  31.05 
 
 		 192 aa  98.6  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  30.72 
 
 		 186 aa  98.6  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  31.05 
 
 		 192 aa  98.6  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  28.09 
 
 		 210 aa  98.2  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1763  phosphoheptose isomerase  34.06 
 
 		 246 aa  98.2  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  38.13 
 
 		 210 aa  98.2  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  29.21 
 
 		 226 aa  98.2  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  35.22 
 
 		 197 aa  98.2  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2563  sugar isomerase (SIS)  29.14 
 
 		 185 aa  97.8  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1749  phosphoheptose isomerase  34.06 
 
 		 248 aa  97.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  34.81 
 
 		 198 aa  97.1  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1335  phosphoheptose isomerase  29.03 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1705  phosphoheptose isomerase  27.78 
 
 		 195 aa  97.1  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  30.22 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  34.78 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1574  sugar isomerase (SIS)  29.93 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.231624  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 		 672 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1238  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 193 aa  97.1  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  31.68 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  28.11 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5851  phosphoheptose isomerase  35.98 
 
 		 190 aa  96.3  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4434  phosphoheptose isomerase  32.09 
 
 		 196 aa  95.9  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  27.57 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  36.07 
 
 		 196 aa  95.9  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  28.4 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0144  sugar isomerase (SIS)  31.36 
 
 		 198 aa  95.5  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  28.98 
 
 		 197 aa  95.5  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  33.56 
 
 		 195 aa  95.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  34.16 
 
 		 197 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  35.33 
 
 		 191 aa  94.7  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  31.06 
 
 		 186 aa  94.7  7e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  35.52 
 
 		 197 aa  94.4  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  34.16 
 
 		 195 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3320  phosphoheptose isomerase  32.12 
 
 		 193 aa  94.4  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  32.96 
 
 		 197 aa  94.4  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1600  phosphoheptose isomerase  32.19 
 
 		 194 aa  94.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3308  phosphoheptose isomerase  32.12 
 
 		 193 aa  94.4  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.765862  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3170  phosphoheptose isomerase  32.12 
 
 		 193 aa  94.4  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  35.52 
 
 		 197 aa  94.4  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  35.52 
 
 		 197 aa  94.4  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  35.52 
 
 		 197 aa  94.4  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  36.61 
 
 		 197 aa  94.7  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  28.98 
 
 		 189 aa  93.6  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  28.07 
 
 		 280 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  34.81 
 
 		 197 aa  93.6  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  35.53 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  32.96 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  32.96 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2640  phosphoheptose isomerase  29.94 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  34.81 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  34.81 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  34.81 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1612  phosphoheptose isomerase  34.53 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5671  phosphoheptose isomerase  34.27 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1409 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  35.36 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  34.59 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  34.59 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  34.81 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0359  phosphoheptose isomerase  30.49 
 
 		 192 aa  92.8  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>