277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2563 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2563  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 		 185 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0827  sugar isomerase (SIS)  38.51 
 
 		 202 aa  141  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0207  phosphoheptose isomerase  38.73 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3171  sugar isomerase (SIS)  36.93 
 
 		 188 aa  127  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1245  sugar isomerase (SIS)  37.08 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2898  sugar isomerase (SIS)  37.85 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0146  sugar isomerase (SIS)  38.15 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0154  sugar isomerase (SIS)  40.52 
 
 		 205 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4242  phosphoheptose isomerase  36.36 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.782615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  38.16 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  32.69 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  32.69 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1369  phosphoheptose isomerase  34.81 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1528  sugar isomerase (SIS)  37.85 
 
 		 204 aa  110  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  35.67 
 
 		 194 aa  111  8.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14411  putative phosphoheptose isomerase  37.63 
 
 		 204 aa  111  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1270  phosphoheptose isomerase  30.05 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  34.62 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  30.77 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  36.43 
 
 		 188 aa  104  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1763  phosphoheptose isomerase  36.43 
 
 		 246 aa  104  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1574  sugar isomerase (SIS)  32 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.231624  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0787  phosphoheptose isomerase  31.35 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  30.11 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  30.11 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  31.65 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11240  phosphoheptose isomerase  31.32 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.184865 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3206  phosphoheptose isomerase  33.55 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  34.9 
 
 		 187 aa  101  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  29.67 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  31.46 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  32.91 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  30.9 
 
 		 189 aa  101  8e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0256  phosphoheptose isomerase  33.12 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.245661 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  30.86 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2640  phosphoheptose isomerase  35.71 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  32.48 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1749  phosphoheptose isomerase  35.71 
 
 		 248 aa  99.8  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  32.65 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  30.05 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  31.21 
 
 		 189 aa  99  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5634  putative phosphoheptose isomerase (sedoheptulose 7-phosphate isomerase)  37.71 
 
 		 202 aa  98.6  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0570  sugar isomerase (SIS)  36.11 
 
 		 234 aa  98.6  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2365  phosphoheptose isomerase  29.14 
 
 		 191 aa  97.8  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 197 aa  97.8  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  35 
 
 		 226 aa  97.8  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  27.72 
 
 		 195 aa  97.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004503  phosphoheptose isomerase  30.9 
 
 		 196 aa  97.8  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0184  sugar isomerase (SIS)  29.78 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  32.89 
 
 		 195 aa  97.1  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 197 aa  97.1  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00889  hypothetical protein  31.46 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  27.51 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  29.78 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 197 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1745  phosphoheptose isomerase  37.75 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0930264 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  31.22 
 
 		 195 aa  95.5  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  29.76 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0144  sugar isomerase (SIS)  32.69 
 
 		 198 aa  95.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 197 aa  95.1  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 195 aa  95.1  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  28.4 
 
 		 191 aa  95.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0460  sugar isomerase (SIS)  32.22 
 
 		 226 aa  94.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  28.65 
 
 		 189 aa  94.4  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2337  phosphoheptose isomerase  35.03 
 
 		 214 aa  94.4  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  34.53 
 
 		 200 aa  94.4  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2311  phosphoheptose isomerase  29.69 
 
 		 208 aa  94.4  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.720425  normal  0.582035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  30.82 
 
 		 195 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  33.76 
 
 		 210 aa  94  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  29.21 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  27.57 
 
 		 197 aa  92.8  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  29.78 
 
 		 197 aa  92.8  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  36.96 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  32.02 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0717  phosphoheptose isomerase  35.8 
 
 		 356 aa  92.8  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0111  phosphoheptose isomerase  29.78 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  26.6 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  29.75 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10114  phosphoheptose isomerase  35.97 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4434  phosphoheptose isomerase  31.45 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2354  phosphoheptose isomerase  28.57 
 
 		 199 aa  92  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0107  phosphoheptose isomerase  32.4 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0339734 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  31.48 
 
 		 198 aa  92  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  30.34 
 
 		 196 aa  92  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  28.57 
 
 		 195 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  30.65 
 
 		 195 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0501  phosphoheptose isomerase  28.39 
 
 		 196 aa  91.7  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457964 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0506  phosphoheptose isomerase  34.53 
 
 		 185 aa  91.7  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3765  phosphoheptose isomerase  35.33 
 
 		 200 aa  91.3  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765674  normal  0.047114 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  28.49 
 
 		 199 aa  90.9  8e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>