282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2311 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2311  phosphoheptose isomerase  100 
 
 
208 aa  417  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.720425  normal  0.582035 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2354  phosphoheptose isomerase  52.02 
 
 
199 aa  204  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  48.44 
 
 
196 aa  174  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  42.42 
 
 
201 aa  169  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  42.42 
 
 
201 aa  169  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  51.2 
 
 
226 aa  169  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  47.72 
 
 
189 aa  167  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  41.75 
 
 
198 aa  166  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  50.59 
 
 
208 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  43.28 
 
 
214 aa  165  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  43.72 
 
 
186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0321  phosphoheptose isomerase  49.11 
 
 
199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0688781  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  48.88 
 
 
210 aa  162  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  54.14 
 
 
212 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1990  phosphoheptose isomerase  47.4 
 
 
222 aa  161  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  43.72 
 
 
194 aa  161  7e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  44.69 
 
 
186 aa  160  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  44.69 
 
 
186 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0256  phosphoheptose isomerase  47.88 
 
 
213 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.245661 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2337  phosphoheptose isomerase  49.4 
 
 
214 aa  159  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  40.91 
 
 
197 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  51.28 
 
 
195 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  47.53 
 
 
186 aa  156  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  46.91 
 
 
186 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  44.26 
 
 
197 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  43.5 
 
 
672 aa  156  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  48.26 
 
 
189 aa  155  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  48.8 
 
 
210 aa  155  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  45.05 
 
 
280 aa  155  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1369  phosphoheptose isomerase  41.15 
 
 
197 aa  155  4e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1600  phosphoheptose isomerase  50.33 
 
 
194 aa  154  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1612  phosphoheptose isomerase  49.66 
 
 
195 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94358  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  45.79 
 
 
193 aa  153  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  45.71 
 
 
192 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  38.66 
 
 
195 aa  154  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2710  phosphoheptose isomerase  47.21 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.555636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  45.71 
 
 
192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3206  phosphoheptose isomerase  42.86 
 
 
204 aa  151  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5671  phosphoheptose isomerase  45.13 
 
 
198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.1409 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  47.4 
 
 
197 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  47.4 
 
 
197 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  47.4 
 
 
192 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  47.4 
 
 
192 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  47.4 
 
 
192 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  47.4 
 
 
192 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  47.4 
 
 
192 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0721  phosphoheptose isomerase  47.71 
 
 
193 aa  148  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0523  phosphoheptose isomerase  53.94 
 
 
207 aa  147  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1897  phosphoheptose isomerase  49.69 
 
 
192 aa  147  8e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.638192  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0686  phosphoheptose isomerase  46.19 
 
 
203 aa  147  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.111927  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1296  phosphoheptose isomerase  43.72 
 
 
197 aa  147  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  47.1 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  42.39 
 
 
191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  48.52 
 
 
191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  44.17 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  44.58 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  44.58 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  42.86 
 
 
189 aa  145  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  48.67 
 
 
186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  42.13 
 
 
189 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  41.36 
 
 
197 aa  145  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0290  phosphoheptose isomerase  49.47 
 
 
203 aa  145  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.520293 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  41.36 
 
 
195 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  42.49 
 
 
198 aa  144  8.000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  45.16 
 
 
195 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  41.88 
 
 
197 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1705  phosphoheptose isomerase  43.58 
 
 
195 aa  143  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  43.46 
 
 
197 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  43.46 
 
 
197 aa  142  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  41.36 
 
 
197 aa  141  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  46.84 
 
 
188 aa  141  6e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  46.41 
 
 
195 aa  141  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  44.77 
 
 
189 aa  141  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  40.74 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  45.45 
 
 
188 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  47.13 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  49.36 
 
 
193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  45.16 
 
 
195 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  46.15 
 
 
189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  40.31 
 
 
195 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  41.53 
 
 
200 aa  139  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  42.86 
 
 
195 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  40.84 
 
 
197 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  40.84 
 
 
197 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  40.84 
 
 
197 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  40.84 
 
 
197 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  40.84 
 
 
197 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  40.84 
 
 
197 aa  138  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  40.84 
 
 
197 aa  138  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  40.84 
 
 
197 aa  138  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  40.84 
 
 
197 aa  138  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  47.22 
 
 
650 aa  137  7.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  40.74 
 
 
197 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  40.74 
 
 
197 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  40.21 
 
 
195 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  40.21 
 
 
197 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  40.31 
 
 
197 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1745  phosphoheptose isomerase  40.44 
 
 
199 aa  136  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0930264 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  40.84 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0717  phosphoheptose isomerase  40 
 
 
356 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>