282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0451 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  100 
 
 
195 aa  393  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  55.14 
 
 
193 aa  204  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  50 
 
 
186 aa  171  5e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  46.49 
 
 
195 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  55.48 
 
 
358 aa  168  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  55.48 
 
 
358 aa  168  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  51.63 
 
 
208 aa  167  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  45.4 
 
 
186 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  45.4 
 
 
186 aa  166  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  44.83 
 
 
186 aa  166  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  46.55 
 
 
187 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  45.83 
 
 
188 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  46.43 
 
 
186 aa  165  4e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  52.38 
 
 
191 aa  165  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  47.24 
 
 
186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  53.38 
 
 
188 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  52.26 
 
 
188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2406  phosphoheptose isomerase  41.11 
 
 
193 aa  164  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  47.31 
 
 
192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  48.02 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  46.74 
 
 
195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  48.02 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  46.71 
 
 
192 aa  162  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  47.67 
 
 
193 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  45.9 
 
 
195 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  44.74 
 
 
194 aa  160  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  51.52 
 
 
189 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  47.31 
 
 
196 aa  158  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  46.05 
 
 
189 aa  157  7e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  47.24 
 
 
214 aa  157  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  53.02 
 
 
280 aa  156  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00217  phosphoheptose isomerase  47.43 
 
 
192 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0254  phosphoheptose isomerase  47.43 
 
 
192 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3385  phosphoheptose isomerase  47.43 
 
 
192 aa  156  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  51.59 
 
 
210 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0234  phosphoheptose isomerase  47.43 
 
 
192 aa  156  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.407926  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  44.85 
 
 
197 aa  156  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3398  phosphoheptose isomerase  47.43 
 
 
192 aa  156  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  40.54 
 
 
200 aa  156  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0250  phosphoheptose isomerase  47.43 
 
 
192 aa  156  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00221  hypothetical protein  47.43 
 
 
192 aa  156  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0218  phosphoheptose isomerase  47.43 
 
 
192 aa  156  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0266  phosphoheptose isomerase  47.43 
 
 
192 aa  156  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  46 
 
 
195 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  45.66 
 
 
197 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  43.16 
 
 
200 aa  155  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  45.66 
 
 
197 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  45.66 
 
 
192 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  45.66 
 
 
192 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  45.66 
 
 
192 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  45.66 
 
 
192 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  45.66 
 
 
192 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0759  phosphoheptose isomerase  46.29 
 
 
192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0340  phosphoheptose isomerase  45 
 
 
192 aa  154  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.648368 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3308  phosphoheptose isomerase  45.71 
 
 
193 aa  154  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.765862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3320  phosphoheptose isomerase  45.71 
 
 
193 aa  154  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364582 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3170  phosphoheptose isomerase  45.71 
 
 
193 aa  154  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  41.95 
 
 
198 aa  153  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  45.16 
 
 
210 aa  153  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  45.9 
 
 
195 aa  153  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3872  phosphoheptose isomerase  52.86 
 
 
194 aa  153  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  41.38 
 
 
197 aa  153  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  41.95 
 
 
197 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  40.61 
 
 
210 aa  152  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  47.97 
 
 
189 aa  152  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0950  phosphoheptose isomerase  45.71 
 
 
193 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1369  phosphoheptose isomerase  43.41 
 
 
197 aa  153  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  48.5 
 
 
650 aa  152  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  47.13 
 
 
197 aa  152  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0351  phosphoheptose isomerase  45.71 
 
 
192 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.178027  hitchhiker  0.00118485 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0344  phosphoheptose isomerase  45.71 
 
 
192 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573238  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0359  phosphoheptose isomerase  45.71 
 
 
192 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0349  phosphoheptose isomerase  45.71 
 
 
192 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.477864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  47.27 
 
 
199 aa  151  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2784  phosphoheptose isomerase  41.11 
 
 
195 aa  151  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  40.8 
 
 
195 aa  150  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  40.8 
 
 
197 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  43.43 
 
 
197 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  40.83 
 
 
197 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  44.09 
 
 
198 aa  150  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  40 
 
 
197 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0355  phosphoheptose isomerase  43.2 
 
 
191 aa  149  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902024  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  42.6 
 
 
197 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  49.68 
 
 
189 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1600  phosphoheptose isomerase  47.22 
 
 
194 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1335  phosphoheptose isomerase  47.74 
 
 
191 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292937  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  42.01 
 
 
195 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  42.01 
 
 
197 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  42.01 
 
 
197 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  41.32 
 
 
197 aa  148  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  44.86 
 
 
189 aa  148  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  41.32 
 
 
197 aa  148  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  37.97 
 
 
197 aa  147  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  40 
 
 
197 aa  147  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  38.5 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  37.97 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  38.5 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  38.5 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  38.5 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  47.71 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>