297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1600 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1600  phosphoheptose isomerase  100 
 
 		 194 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1612  phosphoheptose isomerase  90.1 
 
 		 195 aa  320  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  88.42 
 
 		 195 aa  295  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5671  phosphoheptose isomerase  68.78 
 
 		 198 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  63.21 
 
 		 197 aa  252  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1296  phosphoheptose isomerase  61.66 
 
 		 197 aa  241  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  50.26 
 
 		 197 aa  194  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  50.26 
 
 		 197 aa  194  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  51.37 
 
 		 192 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  51.37 
 
 		 192 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  48.13 
 
 		 198 aa  192  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  51.37 
 
 		 192 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  51.37 
 
 		 192 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  51.37 
 
 		 192 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  48.11 
 
 		 201 aa  191  4e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  48.11 
 
 		 201 aa  191  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0321  phosphoheptose isomerase  55.23 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0688781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  50.26 
 
 		 189 aa  187  9e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  57.93 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  54.49 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  57.05 
 
 		 186 aa  185  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  59.29 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  56.38 
 
 		 186 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  44.86 
 
 		 195 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  54.67 
 
 		 186 aa  181  5.0000000000000004e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  53.95 
 
 		 186 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  55.78 
 
 		 280 aa  180  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  48.94 
 
 		 196 aa  177  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  53.79 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  60 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  53.53 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  53.29 
 
 		 188 aa  175  5e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  53.7 
 
 		 197 aa  173  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  49.75 
 
 		 195 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  49.22 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  50.3 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  54.55 
 
 		 212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  50.61 
 
 		 187 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  47.22 
 
 		 189 aa  171  5e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  51.28 
 
 		 196 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  51.28 
 
 		 196 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0721  phosphoheptose isomerase  45.41 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  57.24 
 
 		 191 aa  169  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  51.28 
 
 		 195 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  45.99 
 
 		 192 aa  168  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  50.85 
 
 		 189 aa  168  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  49.69 
 
 		 189 aa  167  8e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  46.24 
 
 		 192 aa  166  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  51.25 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  43.85 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1897  phosphoheptose isomerase  53.16 
 
 		 192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.638192  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2354  phosphoheptose isomerase  50.93 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  48.37 
 
 		 188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  47.06 
 
 		 189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  52.33 
 
 		 195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  44.21 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  48.21 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  42.31 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1369  phosphoheptose isomerase  50.34 
 
 		 197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  43.65 
 
 		 198 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  44.27 
 
 		 210 aa  160  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0144  sugar isomerase (SIS)  47.2 
 
 		 198 aa  160  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1745  phosphoheptose isomerase  46.06 
 
 		 199 aa  160  9e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0930264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  48.72 
 
 		 195 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3206  phosphoheptose isomerase  50.33 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  43.71 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  42.11 
 
 		 198 aa  158  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  42.11 
 
 		 196 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  42.63 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  50 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  49.38 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2311  phosphoheptose isomerase  50.33 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.720425  normal  0.582035 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  42.64 
 
 		 210 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  41.58 
 
 		 197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  41.12 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  41.58 
 
 		 197 aa  154  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  41.58 
 
 		 197 aa  154  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  41.58 
 
 		 197 aa  154  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  41.58 
 
 		 197 aa  154  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  44.87 
 
 		 197 aa  154  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  44.87 
 
 		 197 aa  154  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  41.62 
 
 		 195 aa  154  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  44.87 
 
 		 195 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  44.23 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  41.62 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  41.58 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0124  phosphoheptose isomerase  45.08 
 
 		 195 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0523  phosphoheptose isomerase  55.06 
 
 		 207 aa  153  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  47.13 
 
 		 672 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  44.87 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1270  phosphoheptose isomerase  50.33 
 
 		 196 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  41.58 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0506  phosphoheptose isomerase  46.71 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  41.58 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  41.58 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  41.58 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0686  phosphoheptose isomerase  50.61 
 
 		 203 aa  152  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.111927  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  41.58 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  45.51 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  44.23 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>