283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0387 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  100 
 
 		 197 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  97.95 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  95.92 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  95.92 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  95.92 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  95.92 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  95.92 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  95.92 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  95.92 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  95.92 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  95.41 
 
 		 197 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  93.91 
 
 		 197 aa  384  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  93.4 
 
 		 197 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  90.86 
 
 		 197 aa  374  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  89.8 
 
 		 197 aa  366  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  89.74 
 
 		 195 aa  364  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  77.44 
 
 		 198 aa  309  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  70.47 
 
 		 196 aa  288  5.0000000000000004e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4434  phosphoheptose isomerase  70.98 
 
 		 196 aa  285  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004503  phosphoheptose isomerase  68.88 
 
 		 196 aa  285  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00889  hypothetical protein  67.86 
 
 		 196 aa  283  1.0000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0111  phosphoheptose isomerase  67.86 
 
 		 196 aa  279  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  69.23 
 
 		 197 aa  278  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  69.23 
 
 		 197 aa  278  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  69.74 
 
 		 197 aa  275  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  69.23 
 
 		 197 aa  273  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  68.72 
 
 		 197 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  68.72 
 
 		 195 aa  272  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3695  phosphoheptose isomerase  68.37 
 
 		 197 aa  271  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.862655  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  67.18 
 
 		 197 aa  270  9e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  67.18 
 
 		 195 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  67.69 
 
 		 197 aa  266  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3586  DnaA initiator-associating protein DiaA  65.64 
 
 		 196 aa  266  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.187267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  67.18 
 
 		 197 aa  266  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  67.18 
 
 		 197 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3784  DnaA initiator-associating protein DiaA  64.77 
 
 		 196 aa  264  5.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00388163  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4338  DnaA initiator-associating protein DiaA  64.29 
 
 		 196 aa  263  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.850453  normal  0.228591 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03016  DnaA initiator-associating factor for replication initiation  63.59 
 
 		 196 aa  262  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0556  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.59 
 
 		 196 aa  262  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02967  hypothetical protein  63.59 
 
 		 196 aa  262  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3621  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.59 
 
 		 196 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3341  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.59 
 
 		 196 aa  262  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3455  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.59 
 
 		 196 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3453  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.59 
 
 		 196 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3623  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.59 
 
 		 196 aa  262  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3524  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.59 
 
 		 196 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.437897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0549  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.59 
 
 		 196 aa  262  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.91217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4468  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.59 
 
 		 196 aa  262  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3444  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.59 
 
 		 196 aa  262  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3561  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.59 
 
 		 196 aa  262  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3631  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.59 
 
 		 196 aa  262  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3626  DnaA initiator-associating protein DiaA  64.25 
 
 		 196 aa  261  6e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0473  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.59 
 
 		 196 aa  260  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0306  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.73 
 
 		 196 aa  260  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168712  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0537  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.59 
 
 		 196 aa  260  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.544086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1122  DnaA initiator-associating protein DiaA  64.25 
 
 		 196 aa  259  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0312  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.73 
 
 		 196 aa  259  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2202  phosphoheptose isomerase  69.27 
 
 		 197 aa  254  5e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.874166  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0258  phosphoheptose isomerase  62.05 
 
 		 199 aa  253  9e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  62.05 
 
 		 199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2206  phosphoheptose isomerase  67.72 
 
 		 196 aa  250  9.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  63.49 
 
 		 198 aa  245  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  60.1 
 
 		 195 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  59.69 
 
 		 210 aa  238  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  59.59 
 
 		 195 aa  237  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  58.33 
 
 		 195 aa  228  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  57.29 
 
 		 195 aa  228  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1175  DnaA initiator-associating factor for replication initiation  57.59 
 
 		 195 aa  228  6e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.853974  normal  0.116131 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0501  phosphoheptose isomerase  56.54 
 
 		 196 aa  224  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457964 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0107  phosphoheptose isomerase  58.03 
 
 		 197 aa  222  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0339734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0272  phosphoheptose isomerase  57.14 
 
 		 199 aa  221  8e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  54.59 
 
 		 197 aa  218  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  56.12 
 
 		 199 aa  217  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  54.64 
 
 		 210 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  52.88 
 
 		 200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0183  phosphoheptose isomerase  56.61 
 
 		 195 aa  204  8e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3765  phosphoheptose isomerase  53.06 
 
 		 200 aa  202  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765674  normal  0.047114 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0124  phosphoheptose isomerase  53.89 
 
 		 195 aa  201  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1638  phosphoheptose isomerase  47.72 
 
 		 197 aa  194  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0835422 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2921  hypothetical protein  46.07 
 
 		 199 aa  194  8.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3064  hypothetical protein  46.07 
 
 		 199 aa  193  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  51.98 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  56.69 
 
 		 358 aa  190  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  56.69 
 
 		 358 aa  190  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2284  phosphoheptose isomerase  51.89 
 
 		 197 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3147  phosphoheptose isomerase  47.12 
 
 		 194 aa  185  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  47.85 
 
 		 186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  53.29 
 
 		 212 aa  181  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  48.11 
 
 		 188 aa  181  7e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  48.15 
 
 		 195 aa  178  4e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  44.75 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  47.09 
 
 		 189 aa  175  5e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  51.48 
 
 		 196 aa  175  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  42.93 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  46.67 
 
 		 197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  47.87 
 
 		 280 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  48.13 
 
 		 186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3441  putative phosphoheptose isomerase  43.46 
 
 		 197 aa  171  5e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.297519  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3320  phosphoheptose isomerase  51.5 
 
 		 193 aa  171  6.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364582 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3308  phosphoheptose isomerase  51.5 
 
 		 193 aa  171  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.765862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>