287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4312 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  100 
 
 
195 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  96.92 
 
 
195 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0124  phosphoheptose isomerase  81.03 
 
 
195 aa  307  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  70.1 
 
 
197 aa  289  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  71.13 
 
 
195 aa  284  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  68.04 
 
 
199 aa  281  5.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0272  phosphoheptose isomerase  67.53 
 
 
199 aa  281  6.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  68.56 
 
 
195 aa  279  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0501  phosphoheptose isomerase  67.54 
 
 
196 aa  259  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.457964 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3765  phosphoheptose isomerase  64.43 
 
 
200 aa  256  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765674  normal  0.047114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1638  phosphoheptose isomerase  59.28 
 
 
197 aa  249  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0835422 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  61.66 
 
 
197 aa  248  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  62.69 
 
 
197 aa  247  6e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  62.69 
 
 
197 aa  247  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  62.69 
 
 
197 aa  247  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  62.69 
 
 
197 aa  247  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  62.69 
 
 
197 aa  247  8e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  62.69 
 
 
197 aa  247  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  62.69 
 
 
197 aa  247  8e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  62.69 
 
 
197 aa  247  8e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  62.69 
 
 
197 aa  246  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3899  phosphoheptose isomerase  68.21 
 
 
192 aa  245  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3818  phosphoheptose isomerase  68.21 
 
 
192 aa  245  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356379  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  61.78 
 
 
195 aa  245  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  62.69 
 
 
195 aa  245  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  62.69 
 
 
197 aa  245  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  62.3 
 
 
197 aa  245  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  61.78 
 
 
197 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3147  phosphoheptose isomerase  68.21 
 
 
192 aa  244  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  61.66 
 
 
197 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  62.3 
 
 
197 aa  244  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  62.3 
 
 
197 aa  243  9e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1743  phosphoheptose isomerase  67.69 
 
 
192 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2800  phosphoheptose isomerase  67.69 
 
 
192 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0292215  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  60.73 
 
 
197 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3177  phosphoheptose isomerase  67.69 
 
 
192 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  60.62 
 
 
196 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0023  phosphoheptose isomerase  67.69 
 
 
192 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.141575  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  62.3 
 
 
195 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  62.3 
 
 
197 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  62.83 
 
 
197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  62.3 
 
 
197 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0040  phosphoheptose isomerase  67.69 
 
 
192 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  60.1 
 
 
197 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  60.62 
 
 
197 aa  241  6e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  61.78 
 
 
197 aa  241  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  59.26 
 
 
200 aa  234  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  59.07 
 
 
198 aa  234  7e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  59.79 
 
 
210 aa  232  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  56.48 
 
 
210 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0107  phosphoheptose isomerase  61.05 
 
 
197 aa  229  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0339734 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0203  phosphoheptose isomerase  64.62 
 
 
194 aa  227  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  54.69 
 
 
196 aa  225  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3392  phosphoheptose isomerase  66.67 
 
 
194 aa  223  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3695  phosphoheptose isomerase  55.73 
 
 
197 aa  222  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.862655  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  57.29 
 
 
198 aa  220  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2206  phosphoheptose isomerase  60.53 
 
 
196 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175972  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004503  phosphoheptose isomerase  52.63 
 
 
196 aa  218  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00889  hypothetical protein  53.16 
 
 
196 aa  217  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0217  phosphoheptose isomerase  64.62 
 
 
194 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0116675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2202  phosphoheptose isomerase  61.38 
 
 
197 aa  216  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.874166  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0111  phosphoheptose isomerase  52.11 
 
 
196 aa  214  8e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0258  phosphoheptose isomerase  55.03 
 
 
199 aa  213  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  55.03 
 
 
199 aa  213  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3441  putative phosphoheptose isomerase  52.36 
 
 
197 aa  209  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.297519  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0198  phosphoheptose isomerase  65.13 
 
 
194 aa  207  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.435023  unclonable  0.00000000000588239 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3586  DnaA initiator-associating protein DiaA  54.21 
 
 
196 aa  204  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.187267 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03016  DnaA initiator-associating factor for replication initiation  54.5 
 
 
196 aa  204  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0556  DnaA initiator-associating protein DiaA  54.5 
 
 
196 aa  204  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3444  DnaA initiator-associating protein DiaA  54.5 
 
 
196 aa  204  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02967  hypothetical protein  54.5 
 
 
196 aa  204  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0549  DnaA initiator-associating protein DiaA  54.5 
 
 
196 aa  204  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.91217  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3341  DnaA initiator-associating protein DiaA  54.5 
 
 
196 aa  204  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3623  DnaA initiator-associating protein DiaA  54.5 
 
 
196 aa  204  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3631  DnaA initiator-associating protein DiaA  54.5 
 
 
196 aa  204  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4468  DnaA initiator-associating protein DiaA  54.5 
 
 
196 aa  204  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3784  DnaA initiator-associating protein DiaA  54.21 
 
 
196 aa  204  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00388163  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2284  phosphoheptose isomerase  52.91 
 
 
197 aa  203  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1063  phosphoheptose isomerase  50.25 
 
 
202 aa  202  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.275691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3621  DnaA initiator-associating protein DiaA  53.68 
 
 
196 aa  201  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3524  DnaA initiator-associating protein DiaA  53.68 
 
 
196 aa  201  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.437897  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3455  DnaA initiator-associating protein DiaA  53.68 
 
 
196 aa  201  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3453  DnaA initiator-associating protein DiaA  53.68 
 
 
196 aa  201  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3561  DnaA initiator-associating protein DiaA  53.68 
 
 
196 aa  201  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4338  DnaA initiator-associating protein DiaA  52.63 
 
 
196 aa  201  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.850453  normal  0.228591 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0306  DnaA initiator-associating protein DiaA  53.16 
 
 
196 aa  201  8e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0312  DnaA initiator-associating protein DiaA  53.16 
 
 
196 aa  200  9e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1122  DnaA initiator-associating protein DiaA  52.63 
 
 
196 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0473  DnaA initiator-associating protein DiaA  52.63 
 
 
196 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0537  DnaA initiator-associating protein DiaA  52.63 
 
 
196 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.544086  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3626  DnaA initiator-associating protein DiaA  52.11 
 
 
196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  49.73 
 
 
186 aa  199  3e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4434  phosphoheptose isomerase  50 
 
 
196 aa  197  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0407  phosphoheptose isomerase  50 
 
 
197 aa  193  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.763268  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  57.5 
 
 
358 aa  189  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  57.5 
 
 
358 aa  189  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0272  phosphoheptose isomerase  64.62 
 
 
194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0418339 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2815  phosphoheptose isomerase  64.62 
 
 
194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0291  phosphoheptose isomerase  64.62 
 
 
194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0183  phosphoheptose isomerase  52.36 
 
 
195 aa  186  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>