265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0291 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2815  phosphoheptose isomerase  100 
 
 
194 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0272  phosphoheptose isomerase  98.97 
 
 
194 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0418339 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0291  phosphoheptose isomerase  100 
 
 
194 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0203  phosphoheptose isomerase  91.24 
 
 
194 aa  322  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3392  phosphoheptose isomerase  93.3 
 
 
194 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0217  phosphoheptose isomerase  91.24 
 
 
194 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0116675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0198  phosphoheptose isomerase  93.81 
 
 
194 aa  270  9e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.435023  unclonable  0.00000000000588239 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0040  phosphoheptose isomerase  74.74 
 
 
192 aa  261  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3899  phosphoheptose isomerase  74.74 
 
 
192 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3818  phosphoheptose isomerase  74.74 
 
 
192 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356379  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3177  phosphoheptose isomerase  74.23 
 
 
192 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2800  phosphoheptose isomerase  74.23 
 
 
192 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0292215  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0023  phosphoheptose isomerase  74.23 
 
 
192 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.141575  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1743  phosphoheptose isomerase  74.23 
 
 
192 aa  259  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3147  phosphoheptose isomerase  74.23 
 
 
192 aa  256  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  65.13 
 
 
195 aa  244  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  65.64 
 
 
195 aa  227  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0124  phosphoheptose isomerase  65.64 
 
 
195 aa  226  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  55.15 
 
 
195 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0272  phosphoheptose isomerase  53.09 
 
 
199 aa  191  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  53.09 
 
 
197 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  53.61 
 
 
195 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0407  phosphoheptose isomerase  53.37 
 
 
197 aa  187  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.763268  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1638  phosphoheptose isomerase  52.06 
 
 
197 aa  187  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0835422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  51.55 
 
 
199 aa  187  8e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1063  phosphoheptose isomerase  52.28 
 
 
202 aa  184  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.275691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0415  phosphoheptose isomerase  53.37 
 
 
197 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3695  phosphoheptose isomerase  46.88 
 
 
197 aa  174  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.862655  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3765  phosphoheptose isomerase  51.03 
 
 
200 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765674  normal  0.047114 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0631  phosphoheptose isomerase  51.78 
 
 
200 aa  171  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  47.12 
 
 
197 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  46.63 
 
 
210 aa  165  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0501  phosphoheptose isomerase  49.21 
 
 
196 aa  164  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.457964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3441  putative phosphoheptose isomerase  49.21 
 
 
197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.297519  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  45.6 
 
 
197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  45.55 
 
 
197 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  46.11 
 
 
195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  46.11 
 
 
197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  45.6 
 
 
197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  44.04 
 
 
198 aa  161  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  45.6 
 
 
197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  45.6 
 
 
197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  45.6 
 
 
197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  45.03 
 
 
195 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  46.07 
 
 
197 aa  161  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  45.6 
 
 
197 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  45.6 
 
 
197 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  45.6 
 
 
197 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  45.6 
 
 
197 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  45.6 
 
 
197 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  43.68 
 
 
196 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  45.55 
 
 
195 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  45.03 
 
 
197 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  44.04 
 
 
197 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  45.55 
 
 
197 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  45.55 
 
 
197 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  45.55 
 
 
197 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4817  phosphoheptose isomerase  48.8 
 
 
214 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004503  phosphoheptose isomerase  42.63 
 
 
196 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  45.03 
 
 
197 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  45.03 
 
 
197 aa  157  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00889  hypothetical protein  42.63 
 
 
196 aa  157  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  43.52 
 
 
196 aa  156  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  43.01 
 
 
197 aa  155  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  43.01 
 
 
197 aa  155  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3784  DnaA initiator-associating protein DiaA  44.21 
 
 
196 aa  154  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00388163  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0111  phosphoheptose isomerase  41.58 
 
 
196 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0107  phosphoheptose isomerase  48.42 
 
 
197 aa  153  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0339734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3586  DnaA initiator-associating protein DiaA  43.68 
 
 
196 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.187267 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0306  DnaA initiator-associating protein DiaA  43.68 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0312  DnaA initiator-associating protein DiaA  43.16 
 
 
196 aa  152  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  44.97 
 
 
210 aa  151  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03016  DnaA initiator-associating factor for replication initiation  43.39 
 
 
196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0556  DnaA initiator-associating protein DiaA  43.39 
 
 
196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3631  DnaA initiator-associating protein DiaA  43.39 
 
 
196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0549  DnaA initiator-associating protein DiaA  43.39 
 
 
196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.91217  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3626  DnaA initiator-associating protein DiaA  43.16 
 
 
196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3341  DnaA initiator-associating protein DiaA  43.39 
 
 
196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3623  DnaA initiator-associating protein DiaA  43.39 
 
 
196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02967  hypothetical protein  43.39 
 
 
196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3444  DnaA initiator-associating protein DiaA  43.39 
 
 
196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4468  DnaA initiator-associating protein DiaA  43.39 
 
 
196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0537  DnaA initiator-associating protein DiaA  42.63 
 
 
196 aa  150  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.544086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1122  DnaA initiator-associating protein DiaA  42.63 
 
 
196 aa  150  8.999999999999999e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0473  DnaA initiator-associating protein DiaA  42.63 
 
 
196 aa  150  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  44.44 
 
 
200 aa  150  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  46.35 
 
 
198 aa  150  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3561  DnaA initiator-associating protein DiaA  42.63 
 
 
196 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3455  DnaA initiator-associating protein DiaA  42.63 
 
 
196 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3453  DnaA initiator-associating protein DiaA  42.63 
 
 
196 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3524  DnaA initiator-associating protein DiaA  42.63 
 
 
196 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.437897  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3621  DnaA initiator-associating protein DiaA  42.63 
 
 
196 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4338  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.58 
 
 
196 aa  147  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.850453  normal  0.228591 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2206  phosphoheptose isomerase  46.84 
 
 
196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175972  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0629  phosphoheptose isomerase  51.3 
 
 
194 aa  146  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4434  phosphoheptose isomerase  39.47 
 
 
196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2284  phosphoheptose isomerase  42.33 
 
 
197 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  42.11 
 
 
199 aa  143  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0258  phosphoheptose isomerase  42.11 
 
 
199 aa  142  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0183  phosphoheptose isomerase  43.98 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>