280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3874 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  100 
 
 		 197 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  86.8 
 
 		 199 aa  355  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0272  phosphoheptose isomerase  84.77 
 
 		 199 aa  346  2e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3765  phosphoheptose isomerase  76.02 
 
 		 200 aa  304  6e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765674  normal  0.047114 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  70.1 
 
 		 195 aa  289  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  71.13 
 
 		 195 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  69.11 
 
 		 195 aa  278  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  67.54 
 
 		 195 aa  276  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1638  phosphoheptose isomerase  65.82 
 
 		 197 aa  276  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0835422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1063  phosphoheptose isomerase  64.32 
 
 		 202 aa  256  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0124  phosphoheptose isomerase  66.15 
 
 		 195 aa  254  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  60.51 
 
 		 197 aa  247  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0501  phosphoheptose isomerase  63.49 
 
 		 196 aa  247  7e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  60.51 
 
 		 195 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  62.05 
 
 		 197 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  60.51 
 
 		 197 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  61.54 
 
 		 197 aa  245  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  61.03 
 
 		 195 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  61.03 
 
 		 197 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  60 
 
 		 197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  60 
 
 		 197 aa  242  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  59.49 
 
 		 197 aa  241  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  58.64 
 
 		 200 aa  240  1e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4817  phosphoheptose isomerase  64.02 
 
 		 214 aa  238  5e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0407  phosphoheptose isomerase  61.62 
 
 		 197 aa  237  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.763268  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  58.64 
 
 		 210 aa  237  9e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  59.38 
 
 		 197 aa  235  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0631  phosphoheptose isomerase  61.11 
 
 		 200 aa  236  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  58.38 
 
 		 197 aa  231  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  58.16 
 
 		 195 aa  226  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  58.16 
 
 		 197 aa  226  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  57.14 
 
 		 197 aa  225  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  57.14 
 
 		 197 aa  225  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  57.14 
 
 		 197 aa  225  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  57.14 
 
 		 197 aa  225  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  56.63 
 
 		 197 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  57.14 
 
 		 197 aa  224  7e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  57.14 
 
 		 197 aa  224  9e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  57.14 
 
 		 197 aa  224  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  57.14 
 
 		 197 aa  224  9e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  57.14 
 
 		 197 aa  224  9e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0415  phosphoheptose isomerase  61.62 
 
 		 197 aa  224  9e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.467216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2202  phosphoheptose isomerase  59.49 
 
 		 197 aa  222  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.874166  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  55.61 
 
 		 196 aa  222  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  56.25 
 
 		 197 aa  220  9e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0107  phosphoheptose isomerase  60.51 
 
 		 197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0339734 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  54.59 
 
 		 197 aa  218  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  56.77 
 
 		 210 aa  218  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  54.69 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  55.33 
 
 		 196 aa  211  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0629  phosphoheptose isomerase  65.31 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2206  phosphoheptose isomerase  58.2 
 
 		 196 aa  205  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  51.79 
 
 		 199 aa  204  9e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0258  phosphoheptose isomerase  51.79 
 
 		 199 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00889  hypothetical protein  51.31 
 
 		 196 aa  203  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004503  phosphoheptose isomerase  50.79 
 
 		 196 aa  203  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  53.16 
 
 		 198 aa  201  6e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0111  phosphoheptose isomerase  50.79 
 
 		 196 aa  201  8e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3441  putative phosphoheptose isomerase  49.23 
 
 		 197 aa  193  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.297519  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4434  phosphoheptose isomerase  48.96 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3695  phosphoheptose isomerase  50 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.862655  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3818  phosphoheptose isomerase  52.58 
 
 		 192 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.356379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3899  phosphoheptose isomerase  52.58 
 
 		 192 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2284  phosphoheptose isomerase  51.56 
 
 		 197 aa  191  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  55.88 
 
 		 186 aa  190  9e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3444  DnaA initiator-associating protein DiaA  48.21 
 
 		 196 aa  190  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3631  DnaA initiator-associating protein DiaA  48.21 
 
 		 196 aa  190  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  55.29 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03016  DnaA initiator-associating factor for replication initiation  48.21 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0556  DnaA initiator-associating protein DiaA  48.21 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2800  phosphoheptose isomerase  52.36 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0292215  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3177  phosphoheptose isomerase  52.36 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3147  phosphoheptose isomerase  52.58 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3623  DnaA initiator-associating protein DiaA  48.21 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0549  DnaA initiator-associating protein DiaA  48.21 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.91217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1743  phosphoheptose isomerase  52.36 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3586  DnaA initiator-associating protein DiaA  49.49 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.187267 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02967  hypothetical protein  48.21 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3341  DnaA initiator-associating protein DiaA  48.21 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4468  DnaA initiator-associating protein DiaA  48.21 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0023  phosphoheptose isomerase  52.36 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.141575  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0040  phosphoheptose isomerase  52.58 
 
 		 192 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  51.06 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3784  DnaA initiator-associating protein DiaA  48.96 
 
 		 196 aa  187  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00388163  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0473  DnaA initiator-associating protein DiaA  48.98 
 
 		 196 aa  187  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0537  DnaA initiator-associating protein DiaA  48.98 
 
 		 196 aa  187  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.544086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1122  DnaA initiator-associating protein DiaA  48.98 
 
 		 196 aa  186  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0183  phosphoheptose isomerase  53.4 
 
 		 195 aa  186  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3455  DnaA initiator-associating protein DiaA  48.98 
 
 		 196 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3561  DnaA initiator-associating protein DiaA  48.98 
 
 		 196 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3621  DnaA initiator-associating protein DiaA  48.98 
 
 		 196 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3524  DnaA initiator-associating protein DiaA  48.98 
 
 		 196 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.437897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4338  DnaA initiator-associating protein DiaA  47.92 
 
 		 196 aa  185  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.850453  normal  0.228591 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3453  DnaA initiator-associating protein DiaA  48.98 
 
 		 196 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  50.8 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0306  DnaA initiator-associating protein DiaA  47.92 
 
 		 196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0312  DnaA initiator-associating protein DiaA  47.92 
 
 		 196 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3626  DnaA initiator-associating protein DiaA  46.88 
 
 		 196 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  55 
 
 		 358 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  55 
 
 		 358 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>