280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3356 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  93.88 
 
 		 197 aa  381  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  93.88 
 
 		 197 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  93.88 
 
 		 197 aa  381  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  93.88 
 
 		 197 aa  380  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  93.88 
 
 		 197 aa  381  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  91.88 
 
 		 197 aa  378  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  93.37 
 
 		 197 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  93.37 
 
 		 197 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  93.37 
 
 		 197 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  93.37 
 
 		 197 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  92.31 
 
 		 196 aa  375  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  91.37 
 
 		 197 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  90.86 
 
 		 197 aa  374  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  90.82 
 
 		 197 aa  367  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  91.28 
 
 		 195 aa  367  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  75.38 
 
 		 198 aa  305  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  72.54 
 
 		 196 aa  299  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004503  phosphoheptose isomerase  71.28 
 
 		 196 aa  296  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00889  hypothetical protein  71.28 
 
 		 196 aa  295  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0111  phosphoheptose isomerase  70.77 
 
 		 196 aa  291  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4434  phosphoheptose isomerase  69.9 
 
 		 196 aa  284  5.999999999999999e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  70.26 
 
 		 197 aa  280  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  70.26 
 
 		 197 aa  280  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  69.74 
 
 		 197 aa  278  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  69.23 
 
 		 197 aa  276  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3695  phosphoheptose isomerase  70.47 
 
 		 197 aa  276  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.862655  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  70.26 
 
 		 197 aa  275  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  68.72 
 
 		 195 aa  275  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3455  DnaA initiator-associating protein DiaA  66.33 
 
 		 196 aa  274  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  68.72 
 
 		 197 aa  274  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3524  DnaA initiator-associating protein DiaA  66.33 
 
 		 196 aa  274  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.437897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3453  DnaA initiator-associating protein DiaA  66.33 
 
 		 196 aa  274  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3621  DnaA initiator-associating protein DiaA  66.33 
 
 		 196 aa  274  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3561  DnaA initiator-associating protein DiaA  66.33 
 
 		 196 aa  274  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  70.26 
 
 		 195 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  70.26 
 
 		 197 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.152156 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03016  DnaA initiator-associating factor for replication initiation  65.82 
 
 		 196 aa  272  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0556  DnaA initiator-associating protein DiaA  65.82 
 
 		 196 aa  272  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02967  hypothetical protein  65.82 
 
 		 196 aa  272  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3623  DnaA initiator-associating protein DiaA  65.82 
 
 		 196 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4468  DnaA initiator-associating protein DiaA  65.82 
 
 		 196 aa  272  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0549  DnaA initiator-associating protein DiaA  65.82 
 
 		 196 aa  272  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.91217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3586  DnaA initiator-associating protein DiaA  65.82 
 
 		 196 aa  272  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.187267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  70.26 
 
 		 197 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3341  DnaA initiator-associating protein DiaA  65.82 
 
 		 196 aa  272  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3444  DnaA initiator-associating protein DiaA  66.15 
 
 		 196 aa  272  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3631  DnaA initiator-associating protein DiaA  66.15 
 
 		 196 aa  272  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3784  DnaA initiator-associating protein DiaA  65.82 
 
 		 196 aa  271  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00388163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  69.74 
 
 		 197 aa  271  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4338  DnaA initiator-associating protein DiaA  66.33 
 
 		 196 aa  271  7e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.850453  normal  0.228591 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0306  DnaA initiator-associating protein DiaA  64.8 
 
 		 196 aa  268  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168712  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3626  DnaA initiator-associating protein DiaA  65.31 
 
 		 196 aa  268  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0473  DnaA initiator-associating protein DiaA  65.31 
 
 		 196 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0537  DnaA initiator-associating protein DiaA  65.31 
 
 		 196 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.544086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1122  DnaA initiator-associating protein DiaA  65.31 
 
 		 196 aa  267  8e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0312  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.78 
 
 		 196 aa  266  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0258  phosphoheptose isomerase  63.78 
 
 		 199 aa  263  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  63.78 
 
 		 199 aa  263  2e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2202  phosphoheptose isomerase  70.83 
 
 		 197 aa  257  7e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.874166  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2206  phosphoheptose isomerase  69.84 
 
 		 196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  65.08 
 
 		 198 aa  249  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  61.66 
 
 		 195 aa  248  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  63.21 
 
 		 195 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  62.3 
 
 		 210 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  63.02 
 
 		 195 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  60.42 
 
 		 195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0272  phosphoheptose isomerase  59.6 
 
 		 199 aa  232  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  58.38 
 
 		 197 aa  231  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0501  phosphoheptose isomerase  58.64 
 
 		 196 aa  230  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  58.88 
 
 		 199 aa  229  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1175  DnaA initiator-associating factor for replication initiation  58.64 
 
 		 195 aa  230  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.853974  normal  0.116131 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  56.54 
 
 		 210 aa  222  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  56.02 
 
 		 200 aa  221  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0107  phosphoheptose isomerase  59.59 
 
 		 197 aa  220  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0339734 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0183  phosphoheptose isomerase  59.26 
 
 		 195 aa  207  6e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3765  phosphoheptose isomerase  54.08 
 
 		 200 aa  207  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765674  normal  0.047114 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0124  phosphoheptose isomerase  56.48 
 
 		 195 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2921  hypothetical protein  47.64 
 
 		 199 aa  201  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3064  hypothetical protein  47.64 
 
 		 199 aa  201  7e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1638  phosphoheptose isomerase  48.22 
 
 		 197 aa  197  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0835422 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  57.96 
 
 		 358 aa  195  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  57.96 
 
 		 358 aa  195  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  52.54 
 
 		 186 aa  191  6e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2284  phosphoheptose isomerase  52.97 
 
 		 197 aa  188  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  53.89 
 
 		 212 aa  187  9e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  48.39 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3147  phosphoheptose isomerase  48.17 
 
 		 194 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  49.74 
 
 		 195 aa  186  3e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  50.27 
 
 		 188 aa  184  6e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  54.49 
 
 		 280 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3441  putative phosphoheptose isomerase  46.6 
 
 		 197 aa  181  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.297519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  53.29 
 
 		 208 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  49.21 
 
 		 188 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  48.95 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  50 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  49.47 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  48.94 
 
 		 186 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  48.68 
 
 		 189 aa  178  4e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  44.95 
 
 		 195 aa  178  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>