275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4434 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4434  phosphoheptose isomerase  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  69.27 
 
 		 198 aa  286  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  71.5 
 
 		 197 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  69.39 
 
 		 196 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  71.5 
 
 		 197 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  71.5 
 
 		 197 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  70.98 
 
 		 197 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  71.5 
 
 		 197 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  69.9 
 
 		 197 aa  284  5.999999999999999e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  69.74 
 
 		 197 aa  283  8e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  70.98 
 
 		 197 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  70.98 
 
 		 197 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  70.98 
 
 		 197 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  70.98 
 
 		 197 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  70.98 
 
 		 197 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  69.23 
 
 		 197 aa  278  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  68.72 
 
 		 195 aa  275  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  68.72 
 
 		 197 aa  275  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  66.32 
 
 		 196 aa  273  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4338  DnaA initiator-associating protein DiaA  62.56 
 
 		 196 aa  268  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.850453  normal  0.228591 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3695  phosphoheptose isomerase  65.8 
 
 		 197 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.862655  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004503  phosphoheptose isomerase  64.06 
 
 		 196 aa  268  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00889  hypothetical protein  64.58 
 
 		 196 aa  267  5.9999999999999995e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3586  DnaA initiator-associating protein DiaA  62.56 
 
 		 196 aa  267  5.9999999999999995e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.187267 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3631  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.08 
 
 		 196 aa  267  8e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3444  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.08 
 
 		 196 aa  267  8e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03016  DnaA initiator-associating factor for replication initiation  63.08 
 
 		 196 aa  266  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0556  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.08 
 
 		 196 aa  266  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02967  hypothetical protein  63.08 
 
 		 196 aa  266  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4468  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.08 
 
 		 196 aa  266  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0549  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.08 
 
 		 196 aa  266  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.91217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3341  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.08 
 
 		 196 aa  266  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3623  DnaA initiator-associating protein DiaA  63.08 
 
 		 196 aa  266  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3455  DnaA initiator-associating protein DiaA  62.56 
 
 		 196 aa  264  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3561  DnaA initiator-associating protein DiaA  62.56 
 
 		 196 aa  264  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3453  DnaA initiator-associating protein DiaA  62.56 
 
 		 196 aa  264  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3524  DnaA initiator-associating protein DiaA  62.56 
 
 		 196 aa  264  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.437897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3621  DnaA initiator-associating protein DiaA  62.56 
 
 		 196 aa  264  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3784  DnaA initiator-associating protein DiaA  62.18 
 
 		 196 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00388163  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0473  DnaA initiator-associating protein DiaA  62.05 
 
 		 196 aa  262  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0537  DnaA initiator-associating protein DiaA  62.05 
 
 		 196 aa  262  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.544086  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0111  phosphoheptose isomerase  63.02 
 
 		 196 aa  261  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3626  DnaA initiator-associating protein DiaA  61.66 
 
 		 196 aa  261  6.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1122  DnaA initiator-associating protein DiaA  62.18 
 
 		 196 aa  260  8e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0306  DnaA initiator-associating protein DiaA  61.66 
 
 		 196 aa  257  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0312  DnaA initiator-associating protein DiaA  60.62 
 
 		 196 aa  255  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  62.83 
 
 		 197 aa  245  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  61.78 
 
 		 197 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  61.78 
 
 		 197 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  60.21 
 
 		 195 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  60.21 
 
 		 197 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  60.21 
 
 		 197 aa  237  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  59.69 
 
 		 197 aa  236  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  59.69 
 
 		 197 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0258  phosphoheptose isomerase  56.41 
 
 		 199 aa  235  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  60.21 
 
 		 197 aa  235  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  56.41 
 
 		 199 aa  234  4e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  60.21 
 
 		 197 aa  234  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  59.16 
 
 		 195 aa  234  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2202  phosphoheptose isomerase  62.77 
 
 		 197 aa  231  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.874166  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  54.45 
 
 		 210 aa  218  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1175  DnaA initiator-associating factor for replication initiation  52.88 
 
 		 195 aa  216  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.853974  normal  0.116131 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  55.03 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2206  phosphoheptose isomerase  57.67 
 
 		 196 aa  213  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  51.83 
 
 		 210 aa  206  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  51.81 
 
 		 195 aa  205  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  50.79 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  51.05 
 
 		 195 aa  201  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0501  phosphoheptose isomerase  48.69 
 
 		 196 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  50 
 
 		 195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  51.05 
 
 		 195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  51.56 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0272  phosphoheptose isomerase  50.76 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0183  phosphoheptose isomerase  52.38 
 
 		 195 aa  194  7e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  48.96 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0107  phosphoheptose isomerase  50.26 
 
 		 197 aa  191  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0339734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0124  phosphoheptose isomerase  51.05 
 
 		 195 aa  188  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2284  phosphoheptose isomerase  49.47 
 
 		 197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3765  phosphoheptose isomerase  47.96 
 
 		 200 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765674  normal  0.047114 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3147  phosphoheptose isomerase  46.6 
 
 		 194 aa  177  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3064  hypothetical protein  42.93 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2921  hypothetical protein  42.93 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1638  phosphoheptose isomerase  43.88 
 
 		 197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0835422 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  49.68 
 
 		 358 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  49.68 
 
 		 358 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  42.54 
 
 		 194 aa  164  9e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  43.23 
 
 		 195 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  48.1 
 
 		 212 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  41.54 
 
 		 192 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  43.62 
 
 		 189 aa  158  6e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  42.16 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  40.62 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  41.75 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  41.58 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  42.19 
 
 		 193 aa  155  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  44.85 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  42.78 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  42.25 
 
 		 186 aa  155  4e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  43.16 
 
 		 186 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  41.88 
 
 		 194 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>