274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3524 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A3621  DnaA initiator-associating protein DiaA  100 
 
 
196 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3453  DnaA initiator-associating protein DiaA  100 
 
 
196 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3561  DnaA initiator-associating protein DiaA  100 
 
 
196 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3524  DnaA initiator-associating protein DiaA  100 
 
 
196 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.437897  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3455  DnaA initiator-associating protein DiaA  100 
 
 
196 aa  401  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3586  DnaA initiator-associating protein DiaA  97.45 
 
 
196 aa  393  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.187267 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03016  DnaA initiator-associating factor for replication initiation  97.96 
 
 
196 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0556  DnaA initiator-associating protein DiaA  97.96 
 
 
196 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3341  DnaA initiator-associating protein DiaA  97.96 
 
 
196 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3631  DnaA initiator-associating protein DiaA  97.95 
 
 
196 aa  390  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3623  DnaA initiator-associating protein DiaA  97.96 
 
 
196 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4468  DnaA initiator-associating protein DiaA  97.96 
 
 
196 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02967  hypothetical protein  97.96 
 
 
196 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3444  DnaA initiator-associating protein DiaA  97.95 
 
 
196 aa  390  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0549  DnaA initiator-associating protein DiaA  97.96 
 
 
196 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.91217  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3784  DnaA initiator-associating protein DiaA  94.39 
 
 
196 aa  380  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00388163  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4338  DnaA initiator-associating protein DiaA  95.41 
 
 
196 aa  383  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.850453  normal  0.228591 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0306  DnaA initiator-associating protein DiaA  93.37 
 
 
196 aa  378  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168712  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0312  DnaA initiator-associating protein DiaA  92.35 
 
 
196 aa  376  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3626  DnaA initiator-associating protein DiaA  93.37 
 
 
196 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0473  DnaA initiator-associating protein DiaA  93.37 
 
 
196 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0537  DnaA initiator-associating protein DiaA  93.37 
 
 
196 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.544086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1122  DnaA initiator-associating protein DiaA  92.86 
 
 
196 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004503  phosphoheptose isomerase  69.39 
 
 
196 aa  289  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00889  hypothetical protein  68.88 
 
 
196 aa  288  4e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  68.37 
 
 
196 aa  283  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0111  phosphoheptose isomerase  68.37 
 
 
196 aa  283  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  66.33 
 
 
197 aa  274  7e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  65.13 
 
 
197 aa  269  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  65.13 
 
 
197 aa  269  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  65.13 
 
 
197 aa  269  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  65.13 
 
 
197 aa  269  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  65.13 
 
 
197 aa  269  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  64.62 
 
 
197 aa  266  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  64.62 
 
 
197 aa  266  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  64.62 
 
 
197 aa  266  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  64.62 
 
 
197 aa  266  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  64.1 
 
 
197 aa  265  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  63.59 
 
 
197 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  64.1 
 
 
195 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  64.1 
 
 
196 aa  265  5e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4434  phosphoheptose isomerase  62.56 
 
 
196 aa  264  7e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  62.12 
 
 
198 aa  264  8e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  63.08 
 
 
197 aa  262  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  63.59 
 
 
197 aa  262  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3695  phosphoheptose isomerase  62.18 
 
 
197 aa  256  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.862655  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  56.41 
 
 
197 aa  235  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  56.41 
 
 
197 aa  235  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  56.92 
 
 
197 aa  234  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  56.41 
 
 
195 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1175  DnaA initiator-associating factor for replication initiation  56.77 
 
 
195 aa  232  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.853974  normal  0.116131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  55.38 
 
 
197 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  55.9 
 
 
195 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  55.9 
 
 
197 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  55.9 
 
 
197 aa  228  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  55.38 
 
 
197 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  56.41 
 
 
197 aa  228  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  55.38 
 
 
197 aa  227  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  55.61 
 
 
199 aa  226  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0258  phosphoheptose isomerase  55.61 
 
 
199 aa  227  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  54.69 
 
 
210 aa  221  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  54.5 
 
 
198 aa  210  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2202  phosphoheptose isomerase  56.38 
 
 
197 aa  208  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.874166  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2206  phosphoheptose isomerase  56.61 
 
 
196 aa  206  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175972  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  53.68 
 
 
195 aa  201  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0183  phosphoheptose isomerase  57.67 
 
 
195 aa  199  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  53.16 
 
 
195 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0272  phosphoheptose isomerase  52.04 
 
 
199 aa  194  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  50 
 
 
195 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0107  phosphoheptose isomerase  55.03 
 
 
197 aa  193  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0339734 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  51.58 
 
 
195 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  51.27 
 
 
199 aa  192  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0501  phosphoheptose isomerase  48.17 
 
 
196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.457964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3147  phosphoheptose isomerase  49.74 
 
 
194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  49.73 
 
 
210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0124  phosphoheptose isomerase  51.3 
 
 
195 aa  185  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  48.98 
 
 
197 aa  185  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  48.63 
 
 
200 aa  184  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2284  phosphoheptose isomerase  50.53 
 
 
197 aa  184  9e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.59943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3765  phosphoheptose isomerase  51.02 
 
 
200 aa  180  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765674  normal  0.047114 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2921  hypothetical protein  44.97 
 
 
199 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3064  hypothetical protein  44.97 
 
 
199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1638  phosphoheptose isomerase  45.92 
 
 
197 aa  174  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0835422 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  48.41 
 
 
358 aa  168  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  48.41 
 
 
358 aa  168  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0738  phosphoheptose isomerase  41.97 
 
 
194 aa  156  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0779144  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  47.09 
 
 
212 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  41.21 
 
 
186 aa  153  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  45.51 
 
 
208 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  44.85 
 
 
186 aa  149  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  40.74 
 
 
195 aa  149  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3441  putative phosphoheptose isomerase  40 
 
 
197 aa  149  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.297519  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0407  phosphoheptose isomerase  43.94 
 
 
197 aa  149  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.763268  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  43.64 
 
 
196 aa  147  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  43.78 
 
 
672 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  42.02 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  42.41 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  41.15 
 
 
189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2396  putative phosphoheptose isomerase  39.69 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585256  normal  0.0766763 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  41.27 
 
 
201 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>