More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2605 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  100 
 
 		 188 aa  381  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  57.38 
 
 		 189 aa  207  5e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  61.59 
 
 		 191 aa  206  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  56.11 
 
 		 280 aa  202  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  57.32 
 
 		 208 aa  201  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  56.33 
 
 		 186 aa  197  7e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  53.76 
 
 		 189 aa  196  1.0000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  59.01 
 
 		 195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  55.9 
 
 		 191 aa  194  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  51.35 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  57.14 
 
 		 193 aa  191  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  55.9 
 
 		 188 aa  191  5e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  54.88 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  56.88 
 
 		 187 aa  187  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  51.87 
 
 		 192 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  52.17 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  52.17 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0523  phosphoheptose isomerase  58.33 
 
 		 207 aa  185  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  53.05 
 
 		 197 aa  184  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  52.17 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  52.17 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  55.9 
 
 		 210 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  54.04 
 
 		 186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5671  phosphoheptose isomerase  56.96 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1409 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  53.42 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  52.17 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  53.42 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1270  phosphoheptose isomerase  51.89 
 
 		 196 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  58.71 
 
 		 200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  52.8 
 
 		 197 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  52.8 
 
 		 197 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  52.8 
 
 		 192 aa  181  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  52.8 
 
 		 192 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  52.8 
 
 		 192 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  52.8 
 
 		 192 aa  181  7e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  52.8 
 
 		 192 aa  181  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  49.21 
 
 		 197 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  51.52 
 
 		 214 aa  180  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  48.42 
 
 		 197 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  54.72 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  47.89 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  51.81 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  53.7 
 
 		 197 aa  178  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  55.03 
 
 		 195 aa  177  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  47.85 
 
 		 196 aa  177  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  52.73 
 
 		 197 aa  177  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  48.45 
 
 		 195 aa  177  9e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  52.73 
 
 		 197 aa  177  9e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  52.73 
 
 		 197 aa  177  9e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  52.73 
 
 		 197 aa  177  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  52.73 
 
 		 197 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  52.73 
 
 		 197 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  52.73 
 
 		 197 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  52.73 
 
 		 197 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  52.73 
 
 		 197 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  46.84 
 
 		 195 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  45.79 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  52.41 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  52.12 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  46.84 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  58.06 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  45.26 
 
 		 197 aa  175  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  46.74 
 
 		 194 aa  175  4e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  46.77 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  48.8 
 
 		 197 aa  174  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  45.26 
 
 		 195 aa  174  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  51.52 
 
 		 195 aa  174  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  51.52 
 
 		 197 aa  174  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  54.22 
 
 		 189 aa  174  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  51.52 
 
 		 197 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  52.1 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  50.91 
 
 		 196 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  45.79 
 
 		 197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  45.26 
 
 		 197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0759  phosphoheptose isomerase  50.26 
 
 		 192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  58.22 
 
 		 195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  56.1 
 
 		 197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  55.41 
 
 		 195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  45.79 
 
 		 197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  45.26 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  50.3 
 
 		 197 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1369  phosphoheptose isomerase  46.96 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1296  phosphoheptose isomerase  53.29 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00217  phosphoheptose isomerase  49.74 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3385  phosphoheptose isomerase  49.74 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3170  phosphoheptose isomerase  48.95 
 
 		 193 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3320  phosphoheptose isomerase  48.95 
 
 		 193 aa  169  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  49.67 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3398  phosphoheptose isomerase  49.74 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0250  phosphoheptose isomerase  49.74 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0234  phosphoheptose isomerase  49.74 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.407926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3308  phosphoheptose isomerase  48.95 
 
 		 193 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.765862  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0266  phosphoheptose isomerase  49.74 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0254  phosphoheptose isomerase  49.74 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00221  hypothetical protein  49.74 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0218  phosphoheptose isomerase  49.74 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0721  phosphoheptose isomerase  53.64 
 
 		 193 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  43.55 
 
 		 194 aa  168  5e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0349  phosphoheptose isomerase  48.69 
 
 		 192 aa  167  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.477864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  54.27 
 
 		 199 aa  167  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>