More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0355 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0355  phosphoheptose isomerase  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902024  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3308  phosphoheptose isomerase  60.73 
 
 		 193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.765862  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0924  phosphoheptose isomerase  62.11 
 
 		 193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3170  phosphoheptose isomerase  60.73 
 
 		 193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1238  phosphoheptose isomerase  67.22 
 
 		 193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3320  phosphoheptose isomerase  60.73 
 
 		 193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364582 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0349  phosphoheptose isomerase  60.21 
 
 		 192 aa  251  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.477864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0351  phosphoheptose isomerase  60.21 
 
 		 192 aa  251  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.178027  hitchhiker  0.00118485 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0359  phosphoheptose isomerase  60.21 
 
 		 192 aa  251  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0344  phosphoheptose isomerase  60.21 
 
 		 192 aa  251  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573238  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0340  phosphoheptose isomerase  60.21 
 
 		 192 aa  251  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.648368 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3872  phosphoheptose isomerase  61.38 
 
 		 194 aa  251  5.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0950  phosphoheptose isomerase  61.78 
 
 		 193 aa  251  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1335  phosphoheptose isomerase  64.17 
 
 		 191 aa  251  5.000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0759  phosphoheptose isomerase  60.73 
 
 		 192 aa  250  7e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0891  phosphoheptose isomerase  61.58 
 
 		 193 aa  250  8.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00217  phosphoheptose isomerase  59.69 
 
 		 192 aa  248  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0234  phosphoheptose isomerase  59.69 
 
 		 192 aa  248  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.407926  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3385  phosphoheptose isomerase  59.69 
 
 		 192 aa  248  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0250  phosphoheptose isomerase  59.69 
 
 		 192 aa  248  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3398  phosphoheptose isomerase  59.69 
 
 		 192 aa  248  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0218  phosphoheptose isomerase  59.69 
 
 		 192 aa  248  5e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00221  hypothetical protein  59.69 
 
 		 192 aa  248  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0266  phosphoheptose isomerase  59.69 
 
 		 192 aa  248  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0254  phosphoheptose isomerase  59.69 
 
 		 192 aa  248  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5851  phosphoheptose isomerase  62.37 
 
 		 190 aa  246  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3443  phosphoheptose isomerase  63.68 
 
 		 193 aa  244  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3296  phosphoheptose isomerase  63.68 
 
 		 193 aa  244  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1822  phosphoheptose isomerase  64.57 
 
 		 191 aa  241  3e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03203  phosphoheptose isomerase  62.29 
 
 		 191 aa  234  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2393  phosphoheptose isomerase  63.83 
 
 		 193 aa  231  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002778  phosphoheptose isomerase  61.18 
 
 		 191 aa  223  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6781  phosphoheptose isomerase  58.6 
 
 		 213 aa  221  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375812  normal  0.778027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1230  phosphoheptose isomerase  59.47 
 
 		 195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243182  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2406  phosphoheptose isomerase  48.42 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  52.12 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  52.12 
 
 		 186 aa  168  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  51.76 
 
 		 186 aa  167  6e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2784  phosphoheptose isomerase  50.56 
 
 		 195 aa  167  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  43.78 
 
 		 186 aa  167  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  46.51 
 
 		 188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2337  phosphoheptose isomerase  49.43 
 
 		 214 aa  161  6e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  46.07 
 
 		 194 aa  160  8.000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  43.98 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0256  phosphoheptose isomerase  43.16 
 
 		 213 aa  158  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.245661 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  50.58 
 
 		 197 aa  158  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  46.77 
 
 		 197 aa  157  9e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  46.24 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  48.39 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  43.98 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  46.19 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  50.58 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  48.39 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  50.58 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  50.58 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  50.58 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  50.58 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  47.31 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  50.58 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  50.58 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  50.58 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  50.58 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  50.3 
 
 		 197 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  50 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  50.3 
 
 		 197 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  48.39 
 
 		 197 aa  155  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  50.3 
 
 		 195 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  45.31 
 
 		 193 aa  154  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  49.09 
 
 		 210 aa  154  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  49.7 
 
 		 197 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  43.89 
 
 		 186 aa  154  7e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  48.28 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  47.09 
 
 		 188 aa  154  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  41.18 
 
 		 192 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  41.18 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  41.18 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  41.18 
 
 		 192 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  50 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  49.42 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  41.18 
 
 		 192 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  41.18 
 
 		 192 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  41.18 
 
 		 192 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  40.64 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  43.55 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  49.4 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  48.84 
 
 		 196 aa  151  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  48.84 
 
 		 197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  49.7 
 
 		 186 aa  150  7e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  48.84 
 
 		 195 aa  151  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  49.4 
 
 		 199 aa  151  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  47.8 
 
 		 358 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  47.8 
 
 		 358 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  42.94 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  43.2 
 
 		 195 aa  149  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0272  phosphoheptose isomerase  50 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  47.67 
 
 		 197 aa  148  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  45.83 
 
 		 199 aa  147  8e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  41.18 
 
 		 189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  47.59 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0258  phosphoheptose isomerase  45.83 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>