297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002778 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002778  phosphoheptose isomerase  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03203  phosphoheptose isomerase  98.43 
 
 		 191 aa  386  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1822  phosphoheptose isomerase  93.16 
 
 		 191 aa  343  8e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3308  phosphoheptose isomerase  84.21 
 
 		 193 aa  333  9e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.765862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3320  phosphoheptose isomerase  84.21 
 
 		 193 aa  333  9e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364582 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3170  phosphoheptose isomerase  84.21 
 
 		 193 aa  333  9e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0950  phosphoheptose isomerase  82.63 
 
 		 193 aa  330  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0924  phosphoheptose isomerase  80.53 
 
 		 193 aa  328  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0891  phosphoheptose isomerase  80.53 
 
 		 193 aa  325  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0349  phosphoheptose isomerase  81.05 
 
 		 192 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.477864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0351  phosphoheptose isomerase  81.05 
 
 		 192 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.178027  hitchhiker  0.00118485 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0344  phosphoheptose isomerase  81.05 
 
 		 192 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573238  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0359  phosphoheptose isomerase  81.05 
 
 		 192 aa  325  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0340  phosphoheptose isomerase  80.53 
 
 		 192 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.648368 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2393  phosphoheptose isomerase  88.95 
 
 		 193 aa  320  9.000000000000001e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0759  phosphoheptose isomerase  78.95 
 
 		 192 aa  316  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00217  phosphoheptose isomerase  78.95 
 
 		 192 aa  315  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0234  phosphoheptose isomerase  78.95 
 
 		 192 aa  315  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.407926  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3385  phosphoheptose isomerase  78.95 
 
 		 192 aa  315  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00221  hypothetical protein  78.95 
 
 		 192 aa  315  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0218  phosphoheptose isomerase  78.95 
 
 		 192 aa  315  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0250  phosphoheptose isomerase  78.95 
 
 		 192 aa  315  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0266  phosphoheptose isomerase  78.95 
 
 		 192 aa  315  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0254  phosphoheptose isomerase  78.95 
 
 		 192 aa  315  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3398  phosphoheptose isomerase  78.95 
 
 		 192 aa  315  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3443  phosphoheptose isomerase  82.11 
 
 		 193 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3296  phosphoheptose isomerase  82.11 
 
 		 193 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1238  phosphoheptose isomerase  78.92 
 
 		 193 aa  308  5e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1335  phosphoheptose isomerase  73.68 
 
 		 191 aa  299  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3872  phosphoheptose isomerase  70.59 
 
 		 194 aa  280  8.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5851  phosphoheptose isomerase  67.38 
 
 		 190 aa  271  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0355  phosphoheptose isomerase  61.58 
 
 		 191 aa  250  8.000000000000001e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902024  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6781  phosphoheptose isomerase  60.11 
 
 		 213 aa  236  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375812  normal  0.778027 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1230  phosphoheptose isomerase  58.92 
 
 		 195 aa  223  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243182  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2406  phosphoheptose isomerase  46.45 
 
 		 193 aa  187  5.999999999999999e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  56.21 
 
 		 210 aa  187  7e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2784  phosphoheptose isomerase  48.91 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2337  phosphoheptose isomerase  53.29 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  51.79 
 
 		 226 aa  171  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  49.43 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1990  phosphoheptose isomerase  51.2 
 
 		 222 aa  167  9e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2710  phosphoheptose isomerase  55.03 
 
 		 211 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.555636  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  48.77 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  43.09 
 
 		 188 aa  159  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  49.09 
 
 		 197 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0256  phosphoheptose isomerase  46.03 
 
 		 213 aa  158  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.245661 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  48.48 
 
 		 196 aa  157  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  44.64 
 
 		 197 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  47.27 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  41.94 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  47.27 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  45.74 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  46.67 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  47.27 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  47.27 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  47.27 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  47.27 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  47.27 
 
 		 197 aa  155  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  42.93 
 
 		 197 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  46.06 
 
 		 197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  47.27 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  47.27 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  43.01 
 
 		 195 aa  154  6e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  47.27 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  47.27 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  42.93 
 
 		 197 aa  154  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  42.39 
 
 		 197 aa  154  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  42.39 
 
 		 197 aa  154  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  45.45 
 
 		 195 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  41.85 
 
 		 195 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  45.45 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  46.67 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  45.45 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  44.85 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  48.45 
 
 		 186 aa  152  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  42.78 
 
 		 198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  47.83 
 
 		 186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  48.45 
 
 		 186 aa  151  5e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  50.62 
 
 		 186 aa  151  5e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  44.27 
 
 		 189 aa  151  7e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  46.06 
 
 		 197 aa  150  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  46.06 
 
 		 195 aa  150  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  45.11 
 
 		 188 aa  150  8.999999999999999e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  43.01 
 
 		 192 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  46.91 
 
 		 210 aa  147  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  41.94 
 
 		 192 aa  147  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  44.32 
 
 		 193 aa  147  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2202  phosphoheptose isomerase  41.76 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.874166  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  43.09 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  50.67 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  44.24 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  40.84 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  47.06 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  45 
 
 		 196 aa  145  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  42.59 
 
 		 197 aa  144  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0107  phosphoheptose isomerase  41.36 
 
 		 197 aa  144  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0339734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  42.62 
 
 		 199 aa  144  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  44.85 
 
 		 195 aa  144  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  42.62 
 
 		 197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  42.62 
 
 		 197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>