278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0131 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  100 
 
 		 210 aa  423  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2710  phosphoheptose isomerase  79.81 
 
 		 211 aa  310  1e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.555636  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2337  phosphoheptose isomerase  73.68 
 
 		 214 aa  308  2.9999999999999997e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  72.6 
 
 		 226 aa  308  4e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1990  phosphoheptose isomerase  69.71 
 
 		 222 aa  295  4e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0256  phosphoheptose isomerase  62.43 
 
 		 213 aa  234  5.0000000000000005e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.245661 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0290  phosphoheptose isomerase  62.7 
 
 		 203 aa  209  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.520293 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0759  phosphoheptose isomerase  52.51 
 
 		 192 aa  178  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1335  phosphoheptose isomerase  52.94 
 
 		 191 aa  176  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3320  phosphoheptose isomerase  55 
 
 		 193 aa  175  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364582 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3308  phosphoheptose isomerase  55 
 
 		 193 aa  175  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.765862  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3170  phosphoheptose isomerase  55 
 
 		 193 aa  175  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1238  phosphoheptose isomerase  53.89 
 
 		 193 aa  175  5e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0349  phosphoheptose isomerase  51.96 
 
 		 192 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.477864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0359  phosphoheptose isomerase  51.96 
 
 		 192 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0344  phosphoheptose isomerase  51.96 
 
 		 192 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573238  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0340  phosphoheptose isomerase  51.96 
 
 		 192 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.648368 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0351  phosphoheptose isomerase  51.96 
 
 		 192 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.178027  hitchhiker  0.00118485 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00217  phosphoheptose isomerase  51.4 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3385  phosphoheptose isomerase  51.4 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0266  phosphoheptose isomerase  51.4 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0250  phosphoheptose isomerase  51.4 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0254  phosphoheptose isomerase  51.4 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0234  phosphoheptose isomerase  51.4 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.407926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00221  hypothetical protein  51.4 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0218  phosphoheptose isomerase  51.4 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3398  phosphoheptose isomerase  51.4 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03203  phosphoheptose isomerase  59.09 
 
 		 191 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0950  phosphoheptose isomerase  53.12 
 
 		 193 aa  171  6.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  48.95 
 
 		 197 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  48.04 
 
 		 186 aa  169  4e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1822  phosphoheptose isomerase  57.79 
 
 		 191 aa  168  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0924  phosphoheptose isomerase  51.48 
 
 		 193 aa  167  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0891  phosphoheptose isomerase  50.6 
 
 		 193 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  53.09 
 
 		 672 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  48.86 
 
 		 196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002778  phosphoheptose isomerase  59.06 
 
 		 191 aa  164  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  53.89 
 
 		 186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  51.45 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  50.9 
 
 		 192 aa  161  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3872  phosphoheptose isomerase  51.88 
 
 		 194 aa  161  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  44.75 
 
 		 195 aa  161  7e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3443  phosphoheptose isomerase  52.07 
 
 		 193 aa  161  7e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3296  phosphoheptose isomerase  52.07 
 
 		 193 aa  161  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  49.7 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  53.94 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  50.3 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  48.86 
 
 		 189 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2393  phosphoheptose isomerase  53.85 
 
 		 193 aa  158  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  48.77 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2311  phosphoheptose isomerase  48.8 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.720425  normal  0.582035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  48.28 
 
 		 189 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2354  phosphoheptose isomerase  51.35 
 
 		 199 aa  155  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  48.88 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0355  phosphoheptose isomerase  48.28 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902024  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  45.51 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  49.43 
 
 		 189 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1897  phosphoheptose isomerase  49.72 
 
 		 192 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.638192  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  44.39 
 
 		 212 aa  151  8e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  49.38 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2406  phosphoheptose isomerase  41.67 
 
 		 193 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  50.32 
 
 		 189 aa  149  3e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  48.28 
 
 		 193 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  50.61 
 
 		 188 aa  148  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5851  phosphoheptose isomerase  47.5 
 
 		 190 aa  148  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  45.99 
 
 		 280 aa  147  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  45.55 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  45.45 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  44.32 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  49.34 
 
 		 188 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  44.89 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  47.9 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  47.9 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  47.9 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  47.9 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6781  phosphoheptose isomerase  45.91 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375812  normal  0.778027 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  47.9 
 
 		 197 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  47.9 
 
 		 197 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  47.85 
 
 		 196 aa  145  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  43.23 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  47.9 
 
 		 197 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  51.66 
 
 		 197 aa  145  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  47.9 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  47.9 
 
 		 197 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  50.63 
 
 		 200 aa  144  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  47.9 
 
 		 197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3206  phosphoheptose isomerase  40.31 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  44.91 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  45.36 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  45.36 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  45.36 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1612  phosphoheptose isomerase  51.01 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  45.57 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  47.24 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  45.36 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  45.57 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  45.36 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  45.36 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  45.36 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  42.93 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>