283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2354 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2354  phosphoheptose isomerase  100 
 
 
199 aa  390  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2311  phosphoheptose isomerase  52.02 
 
 
208 aa  204  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.720425  normal  0.582035 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  51.43 
 
 
226 aa  175  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0256  phosphoheptose isomerase  44.56 
 
 
213 aa  168  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.245661 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  47.06 
 
 
194 aa  167  8e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1990  phosphoheptose isomerase  49.44 
 
 
222 aa  166  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2337  phosphoheptose isomerase  50.29 
 
 
214 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  52.94 
 
 
195 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  43.09 
 
 
195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  41.44 
 
 
186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1600  phosphoheptose isomerase  51.63 
 
 
194 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  47.93 
 
 
189 aa  161  7e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  52.32 
 
 
208 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1612  phosphoheptose isomerase  51.01 
 
 
195 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94358  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  41.67 
 
 
191 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  44.92 
 
 
196 aa  158  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  52.9 
 
 
193 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  45.11 
 
 
197 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  46.93 
 
 
186 aa  156  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  47.03 
 
 
189 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  50 
 
 
188 aa  155  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  51.35 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0321  phosphoheptose isomerase  51.97 
 
 
199 aa  154  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0688781  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  41.99 
 
 
186 aa  154  6e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2710  phosphoheptose isomerase  49.45 
 
 
211 aa  154  8e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.555636  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5671  phosphoheptose isomerase  51.33 
 
 
198 aa  154  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.1409 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  49.07 
 
 
188 aa  153  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  46.86 
 
 
214 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  45.2 
 
 
197 aa  152  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  48 
 
 
192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1897  phosphoheptose isomerase  49.38 
 
 
192 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.638192  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0290  phosphoheptose isomerase  49.19 
 
 
203 aa  151  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.520293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  46.86 
 
 
192 aa  151  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  46.41 
 
 
198 aa  150  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  45.66 
 
 
672 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  40.21 
 
 
201 aa  149  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1369  phosphoheptose isomerase  46.45 
 
 
197 aa  149  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  45 
 
 
280 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  40.21 
 
 
201 aa  149  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  43.09 
 
 
193 aa  148  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  44.07 
 
 
186 aa  147  7e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  42.7 
 
 
186 aa  147  7e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  46.01 
 
 
197 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  46.01 
 
 
197 aa  147  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  46.01 
 
 
192 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  46.01 
 
 
192 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  46.01 
 
 
192 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3206  phosphoheptose isomerase  45.03 
 
 
204 aa  147  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  46.01 
 
 
192 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  46.01 
 
 
192 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1296  phosphoheptose isomerase  45.65 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  46.75 
 
 
188 aa  146  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  47.68 
 
 
212 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  44.39 
 
 
195 aa  145  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  43.72 
 
 
187 aa  145  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  46.67 
 
 
200 aa  144  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  45.45 
 
 
186 aa  143  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  46.49 
 
 
210 aa  143  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  49.35 
 
 
189 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  39.77 
 
 
194 aa  143  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  44.74 
 
 
196 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  44.74 
 
 
196 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  44.32 
 
 
189 aa  141  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  45.03 
 
 
200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0787  phosphoheptose isomerase  39.25 
 
 
194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0523  phosphoheptose isomerase  47.51 
 
 
207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  48.03 
 
 
191 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0686  phosphoheptose isomerase  44.33 
 
 
203 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.111927  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  43.17 
 
 
189 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2406  phosphoheptose isomerase  41.33 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  44.38 
 
 
210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  44.3 
 
 
189 aa  135  4e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1335  phosphoheptose isomerase  44.81 
 
 
191 aa  135  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292937  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1745  phosphoheptose isomerase  40.11 
 
 
199 aa  133  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0930264 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  47.33 
 
 
650 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  46.2 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0862  phosphoheptose isomerase  42.13 
 
 
232 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296003  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  40.1 
 
 
197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0714  phosphoheptose isomerase  42.13 
 
 
231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  39.89 
 
 
197 aa  132  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  44.23 
 
 
210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1347  phosphoheptose isomerase  41.67 
 
 
302 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.19661  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  39.89 
 
 
195 aa  132  5e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  39.88 
 
 
199 aa  131  5e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0258  phosphoheptose isomerase  43.71 
 
 
199 aa  131  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  40.62 
 
 
195 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  41.01 
 
 
197 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1705  phosphoheptose isomerase  49.35 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00217  phosphoheptose isomerase  42.58 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3385  phosphoheptose isomerase  42.58 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0254  phosphoheptose isomerase  42.58 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0721  phosphoheptose isomerase  44 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0234  phosphoheptose isomerase  42.58 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.407926  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0506  phosphoheptose isomerase  38.24 
 
 
185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0759  phosphoheptose isomerase  42.58 
 
 
192 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0250  phosphoheptose isomerase  42.58 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0218  phosphoheptose isomerase  42.58 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3398  phosphoheptose isomerase  42.58 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00221  hypothetical protein  42.58 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0266  phosphoheptose isomerase  42.58 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>