More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0506 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0506  phosphoheptose isomerase  100 
 
 		 185 aa  380  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0787  phosphoheptose isomerase  52.84 
 
 		 194 aa  194  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  48.6 
 
 		 200 aa  187  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1897  phosphoheptose isomerase  47.51 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.638192  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  48.55 
 
 		 189 aa  166  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  50 
 
 		 197 aa  166  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  52 
 
 		 188 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  46.86 
 
 		 186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  48.62 
 
 		 186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  48.3 
 
 		 188 aa  165  4e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  48.62 
 
 		 186 aa  165  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  47.5 
 
 		 189 aa  164  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  48.62 
 
 		 186 aa  164  6.9999999999999995e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  51.01 
 
 		 188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  51.98 
 
 		 195 aa  164  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  46.89 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  43.41 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  49.09 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  50 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1369  phosphoheptose isomerase  50.66 
 
 		 197 aa  161  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  47.19 
 
 		 189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  50.68 
 
 		 189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  46.24 
 
 		 196 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  44.02 
 
 		 280 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  50 
 
 		 195 aa  160  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0321  phosphoheptose isomerase  48.43 
 
 		 199 aa  160  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0688781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  51.55 
 
 		 210 aa  160  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  50.63 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  46.41 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  43.78 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  43.78 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  44.32 
 
 		 186 aa  158  4e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  47.97 
 
 		 198 aa  157  7e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  45.51 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  46.88 
 
 		 189 aa  155  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  47.71 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  48.39 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  42.78 
 
 		 191 aa  155  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1270  phosphoheptose isomerase  48.81 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  46.88 
 
 		 192 aa  153  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  46.25 
 
 		 192 aa  152  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  51.9 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  44 
 
 		 195 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  46.02 
 
 		 197 aa  151  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0144  sugar isomerase (SIS)  42.93 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  42.13 
 
 		 192 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  42.13 
 
 		 197 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  42.13 
 
 		 197 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  42.13 
 
 		 192 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  51.33 
 
 		 195 aa  150  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  42.13 
 
 		 192 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  42.13 
 
 		 192 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  42.13 
 
 		 192 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1600  phosphoheptose isomerase  47.95 
 
 		 194 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0272  phosphoheptose isomerase  47.37 
 
 		 199 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  46.75 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  46.75 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  47.06 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  45.73 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  44.89 
 
 		 195 aa  148  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  43.43 
 
 		 197 aa  148  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  44.89 
 
 		 197 aa  148  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  44.26 
 
 		 195 aa  147  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  44.58 
 
 		 210 aa  147  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  43.18 
 
 		 197 aa  147  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0501  phosphoheptose isomerase  48.05 
 
 		 196 aa  147  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1612  phosphoheptose isomerase  46.62 
 
 		 195 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  43.18 
 
 		 197 aa  147  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  43.18 
 
 		 197 aa  147  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  43.18 
 
 		 197 aa  147  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5671  phosphoheptose isomerase  46.45 
 
 		 198 aa  147  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1409 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  43.18 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  43.18 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  43.18 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  43.18 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  42.78 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  43.18 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  43.75 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  44.38 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  42.05 
 
 		 196 aa  143  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1296  phosphoheptose isomerase  45.86 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1705  phosphoheptose isomerase  41.05 
 
 		 195 aa  142  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  41.53 
 
 		 191 aa  142  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  41.48 
 
 		 197 aa  141  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  47.22 
 
 		 195 aa  141  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  44.3 
 
 		 358 aa  141  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  44.3 
 
 		 358 aa  141  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3206  phosphoheptose isomerase  41.51 
 
 		 204 aa  141  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0721  phosphoheptose isomerase  43.92 
 
 		 193 aa  140  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  45.91 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  45.28 
 
 		 197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  45.28 
 
 		 195 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  45.28 
 
 		 197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  44.65 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  43.4 
 
 		 197 aa  137  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  38.14 
 
 		 197 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10114  phosphoheptose isomerase  44.97 
 
 		 196 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  38.14 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  47.1 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  43.4 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>