282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1347 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1347  phosphoheptose isomerase  100 
 
 
302 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.19661  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  45.16 
 
 
195 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  41.27 
 
 
197 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  41.27 
 
 
197 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  41.27 
 
 
192 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  41.27 
 
 
192 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  41.27 
 
 
192 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  41.27 
 
 
192 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  41.27 
 
 
192 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  40.93 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  44.86 
 
 
186 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  43.35 
 
 
188 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  44.32 
 
 
186 aa  162  9e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  44.32 
 
 
186 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  42.77 
 
 
189 aa  160  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  45.21 
 
 
198 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  47.62 
 
 
208 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  40.33 
 
 
195 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  43.23 
 
 
201 aa  156  4e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  39.89 
 
 
197 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  43.23 
 
 
201 aa  156  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  40.57 
 
 
191 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  41.76 
 
 
210 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  42.78 
 
 
186 aa  154  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5671  phosphoheptose isomerase  37.57 
 
 
198 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.1409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  36.18 
 
 
214 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  46.62 
 
 
212 aa  153  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1745  phosphoheptose isomerase  44.15 
 
 
199 aa  152  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0930264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  41.49 
 
 
191 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  39.57 
 
 
187 aa  149  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  41.27 
 
 
188 aa  150  4e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  44 
 
 
188 aa  148  9e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  47.47 
 
 
196 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  46.2 
 
 
197 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0721  phosphoheptose isomerase  40.21 
 
 
193 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1897  phosphoheptose isomerase  44.16 
 
 
192 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.638192  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0321  phosphoheptose isomerase  34.41 
 
 
199 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0688781  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  42.77 
 
 
186 aa  147  3e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  42.53 
 
 
186 aa  147  3e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  42.2 
 
 
189 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  37.89 
 
 
193 aa  146  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  46.2 
 
 
197 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  46.2 
 
 
197 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  46.2 
 
 
197 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  46.2 
 
 
197 aa  145  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  46.2 
 
 
197 aa  145  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  46.84 
 
 
197 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  46.2 
 
 
197 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  45.39 
 
 
189 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  46.2 
 
 
197 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  46.2 
 
 
197 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0686  phosphoheptose isomerase  47.3 
 
 
203 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.111927  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  46.2 
 
 
197 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1369  phosphoheptose isomerase  41.85 
 
 
197 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  46.2 
 
 
197 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  42.07 
 
 
210 aa  143  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  44.14 
 
 
195 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  42.07 
 
 
193 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0787  phosphoheptose isomerase  41.62 
 
 
194 aa  143  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  43.51 
 
 
358 aa  142  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  43.51 
 
 
358 aa  142  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  45.57 
 
 
197 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  45.57 
 
 
195 aa  142  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  38.29 
 
 
194 aa  141  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  44.44 
 
 
192 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1763  phosphoheptose isomerase  41.5 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  45.57 
 
 
197 aa  140  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1600  phosphoheptose isomerase  44.14 
 
 
194 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  43.83 
 
 
192 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0501  phosphoheptose isomerase  48.3 
 
 
196 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.457964 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  36.51 
 
 
197 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  42.24 
 
 
189 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0144  sugar isomerase (SIS)  39.13 
 
 
198 aa  139  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  36.36 
 
 
189 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  43.48 
 
 
189 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  46 
 
 
194 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  46.45 
 
 
197 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00217  phosphoheptose isomerase  37.17 
 
 
192 aa  136  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3385  phosphoheptose isomerase  37.17 
 
 
192 aa  136  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0254  phosphoheptose isomerase  37.17 
 
 
192 aa  136  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0234  phosphoheptose isomerase  37.17 
 
 
192 aa  136  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.407926  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0218  phosphoheptose isomerase  37.17 
 
 
192 aa  136  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0266  phosphoheptose isomerase  37.17 
 
 
192 aa  136  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3398  phosphoheptose isomerase  37.17 
 
 
192 aa  136  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00221  hypothetical protein  37.17 
 
 
192 aa  136  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0250  phosphoheptose isomerase  37.17 
 
 
192 aa  136  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0717  phosphoheptose isomerase  44.24 
 
 
356 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  38.54 
 
 
197 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  41.72 
 
 
196 aa  135  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  41.77 
 
 
198 aa  135  8e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0759  phosphoheptose isomerase  36.13 
 
 
192 aa  135  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  38.6 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  38.54 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1270  phosphoheptose isomerase  37.95 
 
 
196 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  39.06 
 
 
197 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1612  phosphoheptose isomerase  44.29 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94358  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0258  phosphoheptose isomerase  38.6 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  38.54 
 
 
197 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  36.52 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3872  phosphoheptose isomerase  38.34 
 
 
194 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>