279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0256 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0256  phosphoheptose isomerase  100 
 
 
213 aa  436  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.245661 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  67.01 
 
 
226 aa  260  8.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2337  phosphoheptose isomerase  65.13 
 
 
214 aa  254  8e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2710  phosphoheptose isomerase  66.67 
 
 
211 aa  242  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.555636  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  62.43 
 
 
210 aa  234  5.0000000000000005e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1990  phosphoheptose isomerase  58.85 
 
 
222 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0290  phosphoheptose isomerase  62.76 
 
 
203 aa  231  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.520293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  47.45 
 
 
197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  44.02 
 
 
186 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2354  phosphoheptose isomerase  44.56 
 
 
199 aa  168  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  44.77 
 
 
194 aa  167  8e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00217  phosphoheptose isomerase  47.62 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3385  phosphoheptose isomerase  47.62 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00221  hypothetical protein  47.62 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0250  phosphoheptose isomerase  47.62 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0359  phosphoheptose isomerase  48.15 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3398  phosphoheptose isomerase  47.62 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0266  phosphoheptose isomerase  47.62 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0344  phosphoheptose isomerase  48.15 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573238  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0351  phosphoheptose isomerase  48.15 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.178027  hitchhiker  0.00118485 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0254  phosphoheptose isomerase  47.62 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0218  phosphoheptose isomerase  47.62 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0349  phosphoheptose isomerase  48.15 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.477864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0759  phosphoheptose isomerase  47.62 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0234  phosphoheptose isomerase  47.62 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.407926  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3170  phosphoheptose isomerase  48.68 
 
 
193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3320  phosphoheptose isomerase  48.68 
 
 
193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364582 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3308  phosphoheptose isomerase  48.68 
 
 
193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.765862  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0340  phosphoheptose isomerase  47.62 
 
 
192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.648368 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1238  phosphoheptose isomerase  48.55 
 
 
193 aa  160  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  41.58 
 
 
195 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  46.52 
 
 
188 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2311  phosphoheptose isomerase  47.88 
 
 
208 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.720425  normal  0.582035 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0924  phosphoheptose isomerase  47.09 
 
 
193 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  45.6 
 
 
194 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0950  phosphoheptose isomerase  46.56 
 
 
193 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  47.31 
 
 
193 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  45.65 
 
 
192 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0355  phosphoheptose isomerase  43.16 
 
 
191 aa  158  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902024  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  50 
 
 
189 aa  157  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  47.03 
 
 
186 aa  157  8e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  45.65 
 
 
192 aa  157  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  46.49 
 
 
186 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  46.49 
 
 
186 aa  156  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  48.11 
 
 
210 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0891  phosphoheptose isomerase  46.03 
 
 
193 aa  156  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  47.25 
 
 
186 aa  157  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  49.7 
 
 
189 aa  156  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1335  phosphoheptose isomerase  44.44 
 
 
191 aa  155  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292937  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1369  phosphoheptose isomerase  45.3 
 
 
197 aa  154  7e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  50.94 
 
 
200 aa  154  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  44.63 
 
 
186 aa  154  9e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1822  phosphoheptose isomerase  49.43 
 
 
191 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  49.68 
 
 
188 aa  153  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  42.42 
 
 
214 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1897  phosphoheptose isomerase  46.56 
 
 
192 aa  153  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.638192  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  44.39 
 
 
188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  49.7 
 
 
189 aa  152  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3872  phosphoheptose isomerase  47.93 
 
 
194 aa  151  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  42.55 
 
 
196 aa  151  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  50.31 
 
 
187 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5851  phosphoheptose isomerase  47.31 
 
 
190 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3296  phosphoheptose isomerase  46.56 
 
 
193 aa  148  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03203  phosphoheptose isomerase  47.13 
 
 
191 aa  148  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3443  phosphoheptose isomerase  46.56 
 
 
193 aa  148  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  43.92 
 
 
197 aa  147  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2393  phosphoheptose isomerase  47.4 
 
 
193 aa  147  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  42.93 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  42.86 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  42.86 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  42.86 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  42.86 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0787  phosphoheptose isomerase  41.11 
 
 
194 aa  146  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  42.86 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  42.86 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  42.86 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  42.86 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  42.86 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  45.88 
 
 
672 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  44.44 
 
 
198 aa  144  8.000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  43.33 
 
 
212 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  41.01 
 
 
210 aa  142  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  41.8 
 
 
195 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  46.63 
 
 
197 aa  142  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  42.55 
 
 
189 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  41.15 
 
 
208 aa  141  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  41.27 
 
 
196 aa  141  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  45.09 
 
 
197 aa  141  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  49.02 
 
 
200 aa  141  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  41.15 
 
 
280 aa  141  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  42.49 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0501  phosphoheptose isomerase  42.33 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.457964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  41.27 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  42.49 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  40.74 
 
 
197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  40.2 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  40.2 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002778  phosphoheptose isomerase  46.75 
 
 
191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1270  phosphoheptose isomerase  41.3 
 
 
196 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  47.44 
 
 
210 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>