More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1230 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1230  phosphoheptose isomerase  100 
 
 		 195 aa  400  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243182  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0924  phosphoheptose isomerase  61.83 
 
 		 193 aa  242  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1335  phosphoheptose isomerase  62.9 
 
 		 191 aa  242  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0891  phosphoheptose isomerase  61.83 
 
 		 193 aa  240  9e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0344  phosphoheptose isomerase  62.16 
 
 		 192 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573238  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0349  phosphoheptose isomerase  62.16 
 
 		 192 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.477864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0759  phosphoheptose isomerase  63.78 
 
 		 192 aa  237  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0351  phosphoheptose isomerase  62.16 
 
 		 192 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.178027  hitchhiker  0.00118485 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0359  phosphoheptose isomerase  62.16 
 
 		 192 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3320  phosphoheptose isomerase  61.08 
 
 		 193 aa  236  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364582 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3170  phosphoheptose isomerase  61.08 
 
 		 193 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3308  phosphoheptose isomerase  61.08 
 
 		 193 aa  236  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.765862  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1238  phosphoheptose isomerase  60.32 
 
 		 193 aa  235  3e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0340  phosphoheptose isomerase  61.62 
 
 		 192 aa  234  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.648368 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0950  phosphoheptose isomerase  60.54 
 
 		 193 aa  233  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00217  phosphoheptose isomerase  61.08 
 
 		 192 aa  230  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3385  phosphoheptose isomerase  61.08 
 
 		 192 aa  230  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3443  phosphoheptose isomerase  62.23 
 
 		 193 aa  230  8.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0250  phosphoheptose isomerase  61.08 
 
 		 192 aa  230  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0254  phosphoheptose isomerase  61.08 
 
 		 192 aa  230  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0218  phosphoheptose isomerase  61.08 
 
 		 192 aa  230  8.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3296  phosphoheptose isomerase  62.23 
 
 		 193 aa  230  8.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3398  phosphoheptose isomerase  61.08 
 
 		 192 aa  230  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0234  phosphoheptose isomerase  61.08 
 
 		 192 aa  230  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.407926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00221  hypothetical protein  61.08 
 
 		 192 aa  230  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0266  phosphoheptose isomerase  61.08 
 
 		 192 aa  230  8.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0355  phosphoheptose isomerase  59.47 
 
 		 191 aa  225  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902024  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5851  phosphoheptose isomerase  57.14 
 
 		 190 aa  223  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03203  phosphoheptose isomerase  59.41 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3872  phosphoheptose isomerase  56.83 
 
 		 194 aa  219  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1822  phosphoheptose isomerase  60 
 
 		 191 aa  216  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002778  phosphoheptose isomerase  59.39 
 
 		 191 aa  210  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2393  phosphoheptose isomerase  58.92 
 
 		 193 aa  204  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6781  phosphoheptose isomerase  51.61 
 
 		 213 aa  187  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375812  normal  0.778027 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2406  phosphoheptose isomerase  48.22 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2784  phosphoheptose isomerase  45.88 
 
 		 195 aa  165  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  44.44 
 
 		 186 aa  158  4e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  43.09 
 
 		 186 aa  155  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  42.55 
 
 		 186 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  41.27 
 
 		 192 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  41.27 
 
 		 197 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  41.27 
 
 		 197 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  41.27 
 
 		 192 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  41.27 
 
 		 192 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  41.27 
 
 		 192 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  41.27 
 
 		 192 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  42.02 
 
 		 186 aa  150  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  47.56 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  40 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2337  phosphoheptose isomerase  46.34 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  40.1 
 
 		 195 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  41.4 
 
 		 188 aa  148  5e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  43.82 
 
 		 195 aa  147  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  44.52 
 
 		 186 aa  147  8e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  43.43 
 
 		 197 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  41.92 
 
 		 197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  43.43 
 
 		 197 aa  145  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  42.5 
 
 		 196 aa  144  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  43.43 
 
 		 197 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  43.43 
 
 		 197 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  43.43 
 
 		 197 aa  145  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  43.43 
 
 		 197 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  43.43 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  43.43 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  43.43 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  43.43 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  42.93 
 
 		 197 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  45 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  43.89 
 
 		 188 aa  141  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0144  sugar isomerase (SIS)  40.82 
 
 		 198 aa  141  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  38.71 
 
 		 186 aa  141  6e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  41.92 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  41.92 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0107  phosphoheptose isomerase  44.85 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0339734 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  36.32 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  41.3 
 
 		 200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  40.91 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  40.32 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  39.46 
 
 		 189 aa  138  4.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0256  phosphoheptose isomerase  40.96 
 
 		 213 aa  137  7e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.245661 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2710  phosphoheptose isomerase  46.95 
 
 		 211 aa  137  7.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.555636  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  37.37 
 
 		 197 aa  137  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  39.06 
 
 		 189 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  41.94 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  37.97 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  46.67 
 
 		 200 aa  136  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  41.94 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  42.42 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  39.9 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  39.27 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10114  phosphoheptose isomerase  42.37 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  40.96 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  45.06 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  44.94 
 
 		 210 aa  136  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4434  phosphoheptose isomerase  41.12 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  42.17 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  38.34 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  40.86 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  38.58 
 
 		 196 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  41.36 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>