293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0146 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0146  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 
216 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0207  phosphoheptose isomerase  86.57 
 
 
216 aa  382  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0827  sugar isomerase (SIS)  44.26 
 
 
202 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3171  sugar isomerase (SIS)  44.2 
 
 
188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2898  sugar isomerase (SIS)  43.72 
 
 
188 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0184  sugar isomerase (SIS)  40.45 
 
 
184 aa  141  7e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1245  sugar isomerase (SIS)  42.78 
 
 
200 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0154  sugar isomerase (SIS)  38.71 
 
 
205 aa  136  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2365  phosphoheptose isomerase  35.33 
 
 
191 aa  135  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4242  phosphoheptose isomerase  41.36 
 
 
193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.782615  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2563  sugar isomerase (SIS)  38.15 
 
 
185 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  40.56 
 
 
188 aa  122  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  33.16 
 
 
189 aa  111  8.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  35.98 
 
 
208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10114  phosphoheptose isomerase  39.86 
 
 
196 aa  108  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  33.71 
 
 
196 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1528  sugar isomerase (SIS)  38.71 
 
 
204 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  40.28 
 
 
200 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0717  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
356 aa  105  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  33.53 
 
 
280 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14411  putative phosphoheptose isomerase  35.57 
 
 
204 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  32.9 
 
 
198 aa  105  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  38.51 
 
 
195 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  34.57 
 
 
191 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  32.16 
 
 
197 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0787  phosphoheptose isomerase  32.21 
 
 
194 aa  101  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
189 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  41.73 
 
 
195 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  32.37 
 
 
189 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  39.01 
 
 
212 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  35.8 
 
 
196 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  32.3 
 
 
214 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0473  phosphoheptose isomerase  32.93 
 
 
199 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114293 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  35.8 
 
 
196 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  36.05 
 
 
188 aa  100  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  36 
 
 
188 aa  100  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1369  phosphoheptose isomerase  32.28 
 
 
197 aa  99.4  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  31.61 
 
 
201 aa  99.4  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  36.36 
 
 
195 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  31.61 
 
 
201 aa  99.4  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  32.08 
 
 
195 aa  99  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
672 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  34.76 
 
 
186 aa  98.2  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  34.78 
 
 
210 aa  98.2  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  33.95 
 
 
187 aa  96.3  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  36.02 
 
 
198 aa  95.9  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0144  sugar isomerase (SIS)  34.76 
 
 
198 aa  95.9  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1337  phosphoheptose isomerase  31.41 
 
 
206 aa  95.9  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0623143  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  35.4 
 
 
197 aa  95.9  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  36.25 
 
 
195 aa  95.9  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  30.64 
 
 
193 aa  95.5  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  35.4 
 
 
197 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  35.4 
 
 
197 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5671  phosphoheptose isomerase  33.73 
 
 
198 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.1409 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3206  phosphoheptose isomerase  32.7 
 
 
204 aa  95.5  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  35.4 
 
 
197 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  33.53 
 
 
189 aa  95.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0506  phosphoheptose isomerase  35.51 
 
 
185 aa  95.1  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  36.65 
 
 
197 aa  95.1  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  34.93 
 
 
197 aa  94.7  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  32.89 
 
 
197 aa  94.7  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  34.93 
 
 
197 aa  94.7  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
189 aa  94.7  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  39.57 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  34.93 
 
 
192 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  34.93 
 
 
192 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  34.93 
 
 
192 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  34.93 
 
 
192 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  34.93 
 
 
192 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  36.13 
 
 
195 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  32.99 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  34.78 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  37.59 
 
 
200 aa  94  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00991  putative phosphoheptose isomerase  35.9 
 
 
222 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  34.78 
 
 
197 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  34.78 
 
 
197 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  34.78 
 
 
197 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  34.78 
 
 
197 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  32.05 
 
 
191 aa  92.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  32.56 
 
 
189 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  30.52 
 
 
186 aa  92.4  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  31.61 
 
 
194 aa  92  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  32.65 
 
 
650 aa  92.4  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  34.16 
 
 
196 aa  92  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1574  sugar isomerase (SIS)  35.37 
 
 
196 aa  92.4  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.231624  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1600  phosphoheptose isomerase  35.77 
 
 
194 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  35.29 
 
 
186 aa  92  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  34.13 
 
 
199 aa  92  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  35.03 
 
 
195 aa  91.7  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  35.03 
 
 
197 aa  91.7  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2311  phosphoheptose isomerase  30.37 
 
 
208 aa  91.3  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.720425  normal  0.582035 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1612  phosphoheptose isomerase  35.04 
 
 
195 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94358  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  34.78 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0272  phosphoheptose isomerase  33.95 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  34.15 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  34.59 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  34.78 
 
 
197 aa  89.7  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  31.37 
 
 
192 aa  89.4  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  38.26 
 
 
358 aa  89.4  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5603  sugar isomerase (SIS)  37.24 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.23973  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>