291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2898 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2898  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 		 188 aa  383  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3171  sugar isomerase (SIS)  87.63 
 
 		 188 aa  338  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0827  sugar isomerase (SIS)  62.36 
 
 		 202 aa  238  5e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0207  phosphoheptose isomerase  44.02 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0146  sugar isomerase (SIS)  43.72 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0154  sugar isomerase (SIS)  42.05 
 
 		 205 aa  148  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1528  sugar isomerase (SIS)  42.7 
 
 		 204 aa  137  7.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2365  phosphoheptose isomerase  34.41 
 
 		 191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2563  sugar isomerase (SIS)  37.85 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  41.71 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4242  phosphoheptose isomerase  38.42 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.782615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  40.65 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  41.67 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  43.88 
 
 		 188 aa  117  7e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1245  sugar isomerase (SIS)  40.7 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  41.94 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  40 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  42.28 
 
 		 188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  40 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  40.51 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  43.26 
 
 		 280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  43.97 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  38.65 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0184  sugar isomerase (SIS)  37.43 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  36.91 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  38.04 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  37.42 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  36.69 
 
 		 650 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  36.84 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  37.42 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  37.42 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  37.42 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  37.36 
 
 		 672 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0717  phosphoheptose isomerase  35.36 
 
 		 356 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  36.81 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0144  sugar isomerase (SIS)  39.05 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  38.82 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1369  phosphoheptose isomerase  32.97 
 
 		 197 aa  107  7.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10114  phosphoheptose isomerase  39.49 
 
 		 196 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  36.81 
 
 		 197 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  38.12 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1270  phosphoheptose isomerase  35.06 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  36.81 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  41.55 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  36.99 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  36.99 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  36.81 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  36.6 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  36.81 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  41.55 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  40.69 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  36.81 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  36.81 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  38.04 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  35.88 
 
 		 186 aa  105  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  38.04 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  36.59 
 
 		 186 aa  104  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  40.97 
 
 		 212 aa  104  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  36.18 
 
 		 192 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  36.18 
 
 		 192 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  36.18 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  36.18 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  36.18 
 
 		 192 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  34.46 
 
 		 198 aa  104  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004503  phosphoheptose isomerase  34.83 
 
 		 196 aa  104  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  36.18 
 
 		 192 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  36.18 
 
 		 192 aa  104  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3872  phosphoheptose isomerase  38.61 
 
 		 194 aa  104  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  38.73 
 
 		 192 aa  104  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3784  DnaA initiator-associating protein DiaA  40.28 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00388163  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00889  hypothetical protein  35.39 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  37.75 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  37.16 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0787  phosphoheptose isomerase  36.84 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4434  phosphoheptose isomerase  38.67 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  38.03 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  35.95 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  37.42 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  35.56 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  36.84 
 
 		 197 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  35.95 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03016  DnaA initiator-associating factor for replication initiation  42.36 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0556  DnaA initiator-associating protein DiaA  42.36 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3631  DnaA initiator-associating protein DiaA  42.36 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3623  DnaA initiator-associating protein DiaA  42.36 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02967  hypothetical protein  42.36 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0549  DnaA initiator-associating protein DiaA  42.36 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.91217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3444  DnaA initiator-associating protein DiaA  42.36 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  35.9 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4468  DnaA initiator-associating protein DiaA  42.36 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3341  DnaA initiator-associating protein DiaA  42.36 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  36.3 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1122  DnaA initiator-associating protein DiaA  40.97 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3586  DnaA initiator-associating protein DiaA  41.67 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.187267 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0473  DnaA initiator-associating protein DiaA  40.97 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0537  DnaA initiator-associating protein DiaA  40.97 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.544086  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  39.87 
 
 		 197 aa  101  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  37.33 
 
 		 197 aa  101  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4338  DnaA initiator-associating protein DiaA  39.86 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.850453  normal  0.228591 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0111  phosphoheptose isomerase  34.27 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>