274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1528 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1528  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0827  sugar isomerase (SIS)  41.84 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3171  sugar isomerase (SIS)  44.02 
 
 		 188 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2898  sugar isomerase (SIS)  42.47 
 
 		 188 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1245  sugar isomerase (SIS)  41.57 
 
 		 200 aa  141  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2365  phosphoheptose isomerase  36.56 
 
 		 191 aa  142  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2563  sugar isomerase (SIS)  37.85 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0207  phosphoheptose isomerase  39.57 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0154  sugar isomerase (SIS)  38.98 
 
 		 205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14411  putative phosphoheptose isomerase  38.17 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5634  putative phosphoheptose isomerase (sedoheptulose 7-phosphate isomerase)  40.21 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0184  sugar isomerase (SIS)  41.9 
 
 		 184 aa  124  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0146  sugar isomerase (SIS)  38.71 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  40.46 
 
 		 188 aa  121  8e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  35.56 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5671  phosphoheptose isomerase  36.02 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1409 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  36.75 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  37.11 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  38.65 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  36.93 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  36.02 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00991  putative phosphoheptose isomerase  32.22 
 
 		 222 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  37.18 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  37.18 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  33.7 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  35.26 
 
 		 672 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  36.81 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  35.26 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1600  phosphoheptose isomerase  35.85 
 
 		 194 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4242  phosphoheptose isomerase  32.43 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.782615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  40.14 
 
 		 194 aa  106  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  35.26 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  34.38 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  34.73 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  32 
 
 		 195 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  32.81 
 
 		 197 aa  104  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1574  sugar isomerase (SIS)  31.61 
 
 		 196 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.231624  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  35.95 
 
 		 188 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  34.57 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  34.78 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  35.58 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  36.18 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  30.43 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  34.94 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  30.43 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  34.34 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  33.15 
 
 		 214 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  32.39 
 
 		 189 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  32.07 
 
 		 195 aa  101  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10114  phosphoheptose isomerase  34.15 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  32.31 
 
 		 197 aa  101  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  35.4 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  31.22 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  31.25 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1612  phosphoheptose isomerase  36.18 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  32.77 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  35.4 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  32.77 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  32.77 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  32.78 
 
 		 210 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  32.77 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  35 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  32.47 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0272  phosphoheptose isomerase  33.16 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  32.77 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  31.87 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  35.76 
 
 		 200 aa  99.8  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  30.53 
 
 		 195 aa  99.8  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1337  phosphoheptose isomerase  31.25 
 
 		 206 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0623143  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  34.34 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1296  phosphoheptose isomerase  35.12 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  34.34 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  31.44 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  31.79 
 
 		 197 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  31.96 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  31.41 
 
 		 197 aa  98.2  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  31.28 
 
 		 197 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  32.77 
 
 		 197 aa  98.2  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  33.75 
 
 		 195 aa  98.2  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  34.9 
 
 		 650 aa  98.2  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2406  phosphoheptose isomerase  35.8 
 
 		 193 aa  97.8  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  32.77 
 
 		 195 aa  97.8  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  31.41 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  34.36 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  34.36 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  34.36 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  31.32 
 
 		 195 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  34.21 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  35.62 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  34.36 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  34.36 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  34.36 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  34.36 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  32.77 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2354  phosphoheptose isomerase  34.16 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>