281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5634 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5634  putative phosphoheptose isomerase (sedoheptulose 7-phosphate isomerase)  100 
 
 
202 aa  421  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14411  putative phosphoheptose isomerase  46.32 
 
 
204 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00991  putative phosphoheptose isomerase  45.7 
 
 
222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1337  phosphoheptose isomerase  37.29 
 
 
206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0623143  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1245  sugar isomerase (SIS)  41.18 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2365  phosphoheptose isomerase  34.44 
 
 
191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1528  sugar isomerase (SIS)  40.21 
 
 
204 aa  124  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0827  sugar isomerase (SIS)  34.68 
 
 
202 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2563  sugar isomerase (SIS)  37.71 
 
 
185 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0154  sugar isomerase (SIS)  34.88 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  33.71 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  34.95 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0184  sugar isomerase (SIS)  34.44 
 
 
184 aa  109  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  40.4 
 
 
193 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  33.96 
 
 
208 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  35.62 
 
 
672 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  36.08 
 
 
210 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0207  phosphoheptose isomerase  34.25 
 
 
216 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  35.14 
 
 
197 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  35.14 
 
 
197 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  36.25 
 
 
191 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  36.48 
 
 
192 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  36.48 
 
 
192 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  36.48 
 
 
192 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  36.48 
 
 
192 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  36.48 
 
 
192 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  34.04 
 
 
195 aa  106  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  37.41 
 
 
186 aa  105  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  37.34 
 
 
200 aa  104  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  38.46 
 
 
194 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2393  phosphoheptose isomerase  40.62 
 
 
193 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0146  sugar isomerase (SIS)  32.26 
 
 
216 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4242  phosphoheptose isomerase  32.97 
 
 
193 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.782615  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  31.82 
 
 
186 aa  102  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2898  sugar isomerase (SIS)  37.82 
 
 
188 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1822  phosphoheptose isomerase  40.12 
 
 
191 aa  102  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  33.12 
 
 
189 aa  101  6e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  34.46 
 
 
196 aa  101  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  35.62 
 
 
188 aa  101  8e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  35.86 
 
 
188 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2354  phosphoheptose isomerase  37.33 
 
 
199 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3171  sugar isomerase (SIS)  36.54 
 
 
188 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  33.1 
 
 
212 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  34.46 
 
 
197 aa  99.8  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002778  phosphoheptose isomerase  39.33 
 
 
191 aa  99.4  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  36.3 
 
 
280 aa  99  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03203  phosphoheptose isomerase  39.33 
 
 
191 aa  98.6  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  39.67 
 
 
210 aa  98.2  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1335  phosphoheptose isomerase  38.04 
 
 
191 aa  98.2  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292937  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  34.36 
 
 
191 aa  98.2  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  32.6 
 
 
198 aa  97.8  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
197 aa  97.8  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
197 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
197 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
197 aa  97.8  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  36 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  35.19 
 
 
197 aa  97.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  32.39 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
197 aa  97.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
197 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
197 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
197 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
197 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  33.96 
 
 
197 aa  96.3  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  33.96 
 
 
189 aa  96.3  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  32.77 
 
 
197 aa  96.3  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
192 aa  95.9  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  39.31 
 
 
358 aa  95.9  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  39.31 
 
 
358 aa  95.9  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1745  phosphoheptose isomerase  36.42 
 
 
199 aa  95.9  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0930264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
192 aa  95.9  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4450  sugar isomerase (SIS)  34.84 
 
 
222 aa  95.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.570371  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0714  phosphoheptose isomerase  32.74 
 
 
231 aa  95.1  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  31.87 
 
 
187 aa  95.1  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0862  phosphoheptose isomerase  32.74 
 
 
232 aa  95.1  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296003  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0144  sugar isomerase (SIS)  29.88 
 
 
198 aa  94.7  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  31.32 
 
 
195 aa  94.4  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  32.9 
 
 
197 aa  94  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1990  phosphoheptose isomerase  30.9 
 
 
222 aa  94  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  34.9 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  32.91 
 
 
186 aa  94.4  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3308  phosphoheptose isomerase  36.09 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.765862  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 
194 aa  93.6  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3320  phosphoheptose isomerase  36.09 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364582 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3170  phosphoheptose isomerase  36.09 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  35.42 
 
 
195 aa  92.8  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  35.42 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3812  sugar isomerase (SIS)  34.19 
 
 
228 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.671592  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0759  phosphoheptose isomerase  32.95 
 
 
192 aa  92.4  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  33.11 
 
 
189 aa  92.4  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0355  phosphoheptose isomerase  38.82 
 
 
191 aa  92.4  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902024  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4434  phosphoheptose isomerase  34.78 
 
 
196 aa  92  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  32.57 
 
 
198 aa  92  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08080  phosphoheptose isomerase  36.49 
 
 
224 aa  92  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10114  phosphoheptose isomerase  32.65 
 
 
196 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  36.31 
 
 
196 aa  91.7  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0950  phosphoheptose isomerase  34.81 
 
 
193 aa  91.3  8e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0349  phosphoheptose isomerase  34.91 
 
 
192 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.477864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  29.03 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0359  phosphoheptose isomerase  34.91 
 
 
192 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>