290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3812 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3812  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 		 228 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.671592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4450  sugar isomerase (SIS)  81 
 
 		 222 aa  370  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.570371  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5603  sugar isomerase (SIS)  59.49 
 
 		 208 aa  238  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.23973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1892  putative phosphoheptose isomerase  37.36 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2299  putative phosphoheptose isomerase  40.14 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000717178  normal  0.621895 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  38.12 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  37.42 
 
 		 189 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  36.18 
 
 		 189 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  35.56 
 
 		 196 aa  98.6  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  36.36 
 
 		 189 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  34.38 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  42.98 
 
 		 208 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  35 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  40.82 
 
 		 195 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  37.66 
 
 		 188 aa  95.9  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0321  phosphoheptose isomerase  41.33 
 
 		 199 aa  95.5  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0688781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0154  sugar isomerase (SIS)  38.89 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  38.85 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0506  phosphoheptose isomerase  37.89 
 
 		 185 aa  94.4  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1296  phosphoheptose isomerase  42.96 
 
 		 197 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  36.49 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1612  phosphoheptose isomerase  39.86 
 
 		 195 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5671  phosphoheptose isomerase  39.38 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1409 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2406  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1600  phosphoheptose isomerase  39.86 
 
 		 194 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1245  sugar isomerase (SIS)  34.05 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  48.6 
 
 		 672 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  34.57 
 
 		 195 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  34.64 
 
 		 200 aa  92  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0184  sugar isomerase (SIS)  38.19 
 
 		 184 aa  91.7  8e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  33.52 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  36.88 
 
 		 189 aa  90.9  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2365  phosphoheptose isomerase  34.39 
 
 		 191 aa  90.9  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  46.23 
 
 		 280 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2784  phosphoheptose isomerase  32.69 
 
 		 195 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  39.29 
 
 		 194 aa  89.7  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2563  sugar isomerase (SIS)  35.1 
 
 		 185 aa  89.4  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  33.12 
 
 		 186 aa  89.4  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2898  sugar isomerase (SIS)  39.46 
 
 		 188 aa  89  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1990  phosphoheptose isomerase  33.74 
 
 		 222 aa  89  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0144  sugar isomerase (SIS)  36.43 
 
 		 198 aa  88.6  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  36.17 
 
 		 188 aa  88.2  9e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3171  sugar isomerase (SIS)  38.78 
 
 		 188 aa  88.2  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  37.32 
 
 		 197 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  37.32 
 
 		 192 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  37.32 
 
 		 197 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  37.32 
 
 		 192 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  37.32 
 
 		 192 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  37.32 
 
 		 192 aa  88.2  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  37.32 
 
 		 192 aa  88.2  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  36.11 
 
 		 195 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1763  phosphoheptose isomerase  36.59 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  33.56 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  34.03 
 
 		 186 aa  87.4  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1270  phosphoheptose isomerase  31.52 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  35.42 
 
 		 195 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4434  phosphoheptose isomerase  34.48 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  34.67 
 
 		 191 aa  86.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  47.12 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1369  phosphoheptose isomerase  32.94 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  34.93 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  33.13 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1745  phosphoheptose isomerase  36.43 
 
 		 199 aa  86.3  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0930264 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  33.72 
 
 		 197 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4242  phosphoheptose isomerase  34.51 
 
 		 193 aa  85.5  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.782615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  35.63 
 
 		 193 aa  85.5  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  34.27 
 
 		 214 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  34.72 
 
 		 195 aa  85.1  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  36.62 
 
 		 195 aa  85.1  8e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  34.27 
 
 		 196 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  34.44 
 
 		 199 aa  84.7  9e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  34.27 
 
 		 196 aa  85.1  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0827  sugar isomerase (SIS)  34.41 
 
 		 202 aa  84.7  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0258  phosphoheptose isomerase  34.44 
 
 		 199 aa  85.1  9e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2354  phosphoheptose isomerase  36.99 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0146  sugar isomerase (SIS)  40.4 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1897  phosphoheptose isomerase  36.94 
 
 		 192 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.638192  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  37.01 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0759  phosphoheptose isomerase  31.72 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1238  phosphoheptose isomerase  37.61 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  34.44 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  39.23 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_002936  DET0207  phosphoheptose isomerase  38.41 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  35.62 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0107  phosphoheptose isomerase  36.3 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0339734 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  33.56 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1749  phosphoheptose isomerase  34.16 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0950  phosphoheptose isomerase  40.78 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6781  phosphoheptose isomerase  39.2 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375812  normal  0.778027 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00217  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3385  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0234  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.407926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0250  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3398  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0254  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00221  hypothetical protein  30.34 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0218  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0266  phosphoheptose isomerase  30.34 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14411  putative phosphoheptose isomerase  30.06 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0721  phosphoheptose isomerase  34.67 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>