281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3171 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3171  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 		 188 aa  384  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2898  sugar isomerase (SIS)  87.63 
 
 		 188 aa  338  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0827  sugar isomerase (SIS)  62.09 
 
 		 202 aa  249  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0207  phosphoheptose isomerase  44.75 
 
 		 216 aa  152  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0146  sugar isomerase (SIS)  44.2 
 
 		 216 aa  152  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0154  sugar isomerase (SIS)  43.27 
 
 		 205 aa  150  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1528  sugar isomerase (SIS)  44.02 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2365  phosphoheptose isomerase  35.33 
 
 		 191 aa  134  6.0000000000000005e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1245  sugar isomerase (SIS)  41.52 
 
 		 200 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2563  sugar isomerase (SIS)  36.93 
 
 		 185 aa  127  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  39.29 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  44.6 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  40.91 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  40.38 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  42 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  44.68 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  36.46 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  36.46 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4242  phosphoheptose isomerase  36.72 
 
 		 193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.782615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  42.28 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  42.26 
 
 		 210 aa  118  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  39.66 
 
 		 200 aa  118  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  41.33 
 
 		 214 aa  117  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  36.51 
 
 		 650 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  43.06 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0184  sugar isomerase (SIS)  37.43 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  38.51 
 
 		 188 aa  114  6e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  39.64 
 
 		 672 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  38.22 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  36.6 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  39.02 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  38.24 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  35.33 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0717  phosphoheptose isomerase  37.58 
 
 		 356 aa  111  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  37.8 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  40.15 
 
 		 194 aa  110  8.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  37.8 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  37.8 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  37.8 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  37.2 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  37.2 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10114  phosphoheptose isomerase  41.4 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  41.55 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  37.78 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  37.24 
 
 		 195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  36.65 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  38.56 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  35.93 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  37.2 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  37.2 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  37.5 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  35.03 
 
 		 192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  37.2 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  37.2 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  37.2 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  37.43 
 
 		 226 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  37.2 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0144  sugar isomerase (SIS)  38.32 
 
 		 198 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  36.14 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1270  phosphoheptose isomerase  34.09 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  37.8 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3872  phosphoheptose isomerase  38.99 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  39.31 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  37.42 
 
 		 189 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0787  phosphoheptose isomerase  35.52 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0256  phosphoheptose isomerase  39.31 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.245661 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1369  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 		 197 aa  107  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  35.62 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  35.93 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  37.33 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  35.2 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  36.67 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  38.62 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  42.38 
 
 		 195 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  37.93 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  39.72 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4434  phosphoheptose isomerase  38.67 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  37.93 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  37.93 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  37.8 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  37.8 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  41.67 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  38.01 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  37.24 
 
 		 197 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  40.85 
 
 		 358 aa  104  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  34.21 
 
 		 197 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  39.87 
 
 		 197 aa  104  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  34.87 
 
 		 197 aa  104  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  40.85 
 
 		 358 aa  104  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  35 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  33.55 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5851  phosphoheptose isomerase  42.14 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2354  phosphoheptose isomerase  36.11 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  39.6 
 
 		 189 aa  104  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  39.01 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  36.26 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  35 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  40.13 
 
 		 195 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004503  phosphoheptose isomerase  33.71 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1897  phosphoheptose isomerase  40.54 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.638192  normal  0.307075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>