More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1245 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1245  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 		 200 aa  406  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0184  sugar isomerase (SIS)  45.6 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0827  sugar isomerase (SIS)  43.72 
 
 		 202 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0146  sugar isomerase (SIS)  42.78 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0154  sugar isomerase (SIS)  41.28 
 
 		 205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0207  phosphoheptose isomerase  44.44 
 
 		 216 aa  135  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14411  putative phosphoheptose isomerase  39.58 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3171  sugar isomerase (SIS)  41.52 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2563  sugar isomerase (SIS)  37.08 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  39.89 
 
 		 189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1528  sugar isomerase (SIS)  41.57 
 
 		 204 aa  125  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.244985  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2365  phosphoheptose isomerase  36.11 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00991  putative phosphoheptose isomerase  34.04 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.528712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5634  putative phosphoheptose isomerase (sedoheptulose 7-phosphate isomerase)  41.18 
 
 		 202 aa  118  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2898  sugar isomerase (SIS)  40.7 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4242  phosphoheptose isomerase  37.22 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.782615  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  42.07 
 
 		 197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  42.07 
 
 		 197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  42.07 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  42.07 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  42.07 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  42.07 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  42.07 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  37.89 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  41.84 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  39.74 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  40.14 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  36.31 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  37.58 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  38.89 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  41.22 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  36.08 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  36.6 
 
 		 201 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  36.6 
 
 		 201 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  34.44 
 
 		 192 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  33.89 
 
 		 192 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0321  phosphoheptose isomerase  38.27 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0688781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  42.18 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  37.11 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  36.13 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  38.79 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  36.31 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  39.19 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  34.81 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  37.36 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  38.75 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  38.75 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  38.75 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  38.75 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  38.75 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  34.78 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  39.49 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  39.86 
 
 		 195 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  35.29 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  38.36 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  38.12 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  35.06 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  38.12 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  35.06 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  38.12 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  35.03 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  38.12 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  38.12 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  38.12 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  38.12 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  39.44 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  37.27 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0787  phosphoheptose isomerase  34.36 
 
 		 194 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1574  sugar isomerase (SIS)  32.94 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.231624  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2393  phosphoheptose isomerase  40 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  41.13 
 
 		 197 aa  101  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  36.55 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  36.88 
 
 		 197 aa  101  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10114  phosphoheptose isomerase  39.73 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  34.46 
 
 		 189 aa  101  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  31.4 
 
 		 186 aa  101  8e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1745  phosphoheptose isomerase  36.81 
 
 		 199 aa  101  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0930264 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0272  phosphoheptose isomerase  37.11 
 
 		 199 aa  101  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0144  sugar isomerase (SIS)  38.12 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  41.01 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  40.14 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1270  phosphoheptose isomerase  35.06 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  39.86 
 
 		 280 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  41.13 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  41.13 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  32.94 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  32.94 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  34.42 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  35.62 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  36.49 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3385  phosphoheptose isomerase  40 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  40.29 
 
 		 195 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0218  phosphoheptose isomerase  40 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0266  phosphoheptose isomerase  40 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0234  phosphoheptose isomerase  40 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.407926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0254  phosphoheptose isomerase  40 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0250  phosphoheptose isomerase  40 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3398  phosphoheptose isomerase  40 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  33.78 
 
 		 195 aa  99.8  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1296  phosphoheptose isomerase  37.97 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>