More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4450 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4450  sugar isomerase (SIS)  100 
 
 		 222 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.570371  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3812  sugar isomerase (SIS)  81 
 
 		 228 aa  370  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.671592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5603  sugar isomerase (SIS)  63.1 
 
 		 208 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.23973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1892  putative phosphoheptose isomerase  41.21 
 
 		 205 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  39.02 
 
 		 189 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2299  putative phosphoheptose isomerase  34.38 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000717178  normal  0.621895 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  38.24 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  41.67 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  39.01 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  36.41 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  44.63 
 
 		 208 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  35.91 
 
 		 192 aa  101  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  36.42 
 
 		 192 aa  101  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5671  phosphoheptose isomerase  41.36 
 
 		 198 aa  99  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.1409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  36.88 
 
 		 195 aa  99  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  34.81 
 
 		 196 aa  98.6  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  35.36 
 
 		 189 aa  98.6  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  39.44 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1296  phosphoheptose isomerase  39.01 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0154  sugar isomerase (SIS)  39.58 
 
 		 205 aa  95.5  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  38.62 
 
 		 189 aa  95.5  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1612  phosphoheptose isomerase  41.26 
 
 		 195 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0506  phosphoheptose isomerase  36.6 
 
 		 185 aa  94.4  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0184  sugar isomerase (SIS)  38.89 
 
 		 184 aa  94.4  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1600  phosphoheptose isomerase  40.56 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1245  sugar isomerase (SIS)  32.97 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  38.19 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  40.14 
 
 		 195 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  38.19 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  38.19 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  38.19 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  38.19 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  38.19 
 
 		 197 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  38.19 
 
 		 197 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0321  phosphoheptose isomerase  39.86 
 
 		 199 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0688781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  34.21 
 
 		 189 aa  92.8  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  38.57 
 
 		 194 aa  92.4  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  35.53 
 
 		 186 aa  91.7  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  35.42 
 
 		 210 aa  91.7  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  38.19 
 
 		 195 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  37.5 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  46.23 
 
 		 280 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  48.6 
 
 		 672 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  37.5 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  36.99 
 
 		 195 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  33.52 
 
 		 200 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1745  phosphoheptose isomerase  37.14 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0930264 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  37.32 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  37.24 
 
 		 188 aa  90.5  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1238  phosphoheptose isomerase  41.88 
 
 		 193 aa  90.5  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2365  phosphoheptose isomerase  31.38 
 
 		 191 aa  90.1  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  34.97 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3171  sugar isomerase (SIS)  39.86 
 
 		 188 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  36.3 
 
 		 195 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  34.62 
 
 		 200 aa  89.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  33.56 
 
 		 194 aa  89.4  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0950  phosphoheptose isomerase  39.86 
 
 		 193 aa  89.4  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  35.42 
 
 		 186 aa  89.4  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0107  phosphoheptose isomerase  39.04 
 
 		 197 aa  89  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0339734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1763  phosphoheptose isomerase  37.2 
 
 		 246 aa  89  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  35.33 
 
 		 191 aa  88.6  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1990  phosphoheptose isomerase  36.2 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  36.36 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2563  sugar isomerase (SIS)  33.55 
 
 		 185 aa  88.2  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  39.6 
 
 		 193 aa  88.2  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  38.71 
 
 		 188 aa  88.2  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0144  sugar isomerase (SIS)  36.17 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  36.36 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2898  sugar isomerase (SIS)  40.82 
 
 		 188 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3170  phosphoheptose isomerase  44.66 
 
 		 193 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3308  phosphoheptose isomerase  44.66 
 
 		 193 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.765862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3320  phosphoheptose isomerase  44.66 
 
 		 193 aa  88.2  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364582 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  38.71 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  36.36 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00217  phosphoheptose isomerase  41.75 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3385  phosphoheptose isomerase  41.75 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2406  phosphoheptose isomerase  30.77 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0266  phosphoheptose isomerase  41.75 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0501  phosphoheptose isomerase  34.48 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0254  phosphoheptose isomerase  41.75 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0234  phosphoheptose isomerase  41.75 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.407926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0759  phosphoheptose isomerase  33.1 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0827  sugar isomerase (SIS)  34.78 
 
 		 202 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3398  phosphoheptose isomerase  41.75 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  34.48 
 
 		 186 aa  87  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0218  phosphoheptose isomerase  41.75 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0250  phosphoheptose isomerase  41.75 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00221  hypothetical protein  41.75 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4434  phosphoheptose isomerase  34.48 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  35.86 
 
 		 186 aa  85.9  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  35.86 
 
 		 186 aa  86.3  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2354  phosphoheptose isomerase  36.99 
 
 		 199 aa  86.3  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0340  phosphoheptose isomerase  41.75 
 
 		 192 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.648368 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0359  phosphoheptose isomerase  41.75 
 
 		 192 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0258  phosphoheptose isomerase  35.1 
 
 		 199 aa  85.5  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0349  phosphoheptose isomerase  41.75 
 
 		 192 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.477864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0351  phosphoheptose isomerase  41.75 
 
 		 192 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.178027  hitchhiker  0.00118485 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0344  phosphoheptose isomerase  41.75 
 
 		 192 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573238  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0721  phosphoheptose isomerase  36.36 
 
 		 193 aa  85.5  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  35.1 
 
 		 199 aa  85.5  6e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>