268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1892 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1892  putative phosphoheptose isomerase  100 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4450  sugar isomerase (SIS)  41.21 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.570371  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3812  sugar isomerase (SIS)  37.36 
 
 		 228 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.671592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5603  sugar isomerase (SIS)  46 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.23973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2299  putative phosphoheptose isomerase  29.03 
 
 		 198 aa  91.7  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000717178  normal  0.621895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  33.33 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4242  phosphoheptose isomerase  34.38 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.782615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14411  putative phosphoheptose isomerase  33.89 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0144  sugar isomerase (SIS)  34.06 
 
 		 198 aa  85.5  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0154  sugar isomerase (SIS)  37.04 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  36.43 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  28.65 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  34.48 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  35.17 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  35.17 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  33.12 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0258  phosphoheptose isomerase  35.17 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  33.99 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  32.26 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  31.88 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  33.99 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0501  phosphoheptose isomerase  35.17 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457964 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  30.43 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  34.31 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  33.99 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  34.48 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  32.59 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1990  phosphoheptose isomerase  32.32 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  32.59 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1245  sugar isomerase (SIS)  30.81 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.279985  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  31.05 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  32.17 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  30.92 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  30.71 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  35.17 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  33.1 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  33.79 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0146  sugar isomerase (SIS)  30.32 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  35.17 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  33.79 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2365  phosphoheptose isomerase  34.06 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  30 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  34.69 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1574  sugar isomerase (SIS)  33.82 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.231624  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0827  sugar isomerase (SIS)  34.75 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  32.86 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0207  phosphoheptose isomerase  29.03 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  32.37 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  30.43 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  31.16 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0184  sugar isomerase (SIS)  36.05 
 
 		 184 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  31.88 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  29.47 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10114  phosphoheptose isomerase  32.12 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  32.62 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  30.36 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  33.1 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  33.57 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0272  phosphoheptose isomerase  32.62 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5851  phosphoheptose isomerase  34.06 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  33.1 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  31.16 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  31.16 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  31.16 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  31.16 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0237  phosphoheptose isomerase  32.85 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00217  phosphoheptose isomerase  36.5 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3385  phosphoheptose isomerase  36.5 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0254  phosphoheptose isomerase  36.5 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3398  phosphoheptose isomerase  36.5 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0266  phosphoheptose isomerase  36.5 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0234  phosphoheptose isomerase  36.5 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.407926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0250  phosphoheptose isomerase  36.5 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0218  phosphoheptose isomerase  36.5 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  31.16 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00221  hypothetical protein  36.5 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0355  phosphoheptose isomerase  34.81 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902024  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1238  phosphoheptose isomerase  34.31 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  31.16 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  30.82 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  31.16 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  31.16 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  31.16 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  31.16 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  31.16 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0721  phosphoheptose isomerase  27.06 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0759  phosphoheptose isomerase  35.25 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  30.67 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  31.16 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0256  phosphoheptose isomerase  31.79 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.245661 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4434  phosphoheptose isomerase  31.16 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  31.25 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0340  phosphoheptose isomerase  36.5 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.648368 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0344  phosphoheptose isomerase  36.5 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573238  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0359  phosphoheptose isomerase  36.5 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  31.72 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0349  phosphoheptose isomerase  36.5 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.477864 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  31.41 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0351  phosphoheptose isomerase  36.5 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.178027  hitchhiker  0.00118485 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  29.71 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>