280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2916 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2916  phosphoheptose isomerase  100 
 
 		 211 aa  428  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0427  sugar isomerase (SIS)  38.54 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  39.79 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  42.37 
 
 		 195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  41.18 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  39.04 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  39.04 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  36.46 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  38.5 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4686  phosphoheptose isomerase  36.55 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493935  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  41.42 
 
 		 195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  38.5 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  38.5 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  38.5 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  42.51 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  37.82 
 
 		 197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  42.51 
 
 		 196 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  37.7 
 
 		 197 aa  128  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  36.55 
 
 		 195 aa  128  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  37.97 
 
 		 196 aa  128  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  37.7 
 
 		 197 aa  128  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  37.7 
 
 		 197 aa  128  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  37.7 
 
 		 197 aa  128  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  41.28 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  38.5 
 
 		 197 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  37.97 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  36.98 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0931  phosphoheptose isomerase  36.55 
 
 		 197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  38.5 
 
 		 197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  37.88 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4525  phosphoheptose isomerase  36.04 
 
 		 197 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1323  phosphoheptose isomerase  36.79 
 
 		 195 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.419202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4401  phosphoheptose isomerase  36.04 
 
 		 197 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.152156 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  39.78 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  39.27 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  36.55 
 
 		 197 aa  124  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  38.95 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  37.31 
 
 		 197 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  37.31 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  37.36 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  39.08 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  41.07 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  36.79 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0107  phosphoheptose isomerase  41.53 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0339734 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2202  phosphoheptose isomerase  39.25 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.874166  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  40.83 
 
 		 195 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  35.87 
 
 		 186 aa  122  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1935  phosphoheptose isomerase  36.08 
 
 		 199 aa  121  6e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.201386  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0258  phosphoheptose isomerase  36.08 
 
 		 199 aa  121  8e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  37.5 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  40 
 
 		 186 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  38.71 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  36.07 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0272  phosphoheptose isomerase  37.7 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  39.08 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  35.2 
 
 		 198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1225  phosphoheptose isomerase  39.52 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.234834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  35.91 
 
 		 186 aa  118  7.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  41.14 
 
 		 672 aa  118  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  37.13 
 
 		 208 aa  117  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  35.91 
 
 		 186 aa  117  9e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  41.46 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  38.24 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  38.24 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0237  phosphoheptose isomerase  37.43 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522825 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  38.24 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  38.24 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  38.24 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  38.24 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  38.24 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00889  hypothetical protein  35.11 
 
 		 196 aa  116  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004503  phosphoheptose isomerase  34.57 
 
 		 196 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10114  phosphoheptose isomerase  38.24 
 
 		 196 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  38.51 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3765  phosphoheptose isomerase  42.56 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765674  normal  0.047114 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0506  phosphoheptose isomerase  33.66 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2206  phosphoheptose isomerase  38.71 
 
 		 196 aa  115  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  39.77 
 
 		 358 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  34.39 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  36.36 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  39.41 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  39.77 
 
 		 358 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  36.32 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  34.76 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4434  phosphoheptose isomerase  36.22 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  38.2 
 
 		 187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0124  phosphoheptose isomerase  39.64 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0501  phosphoheptose isomerase  38.73 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.457964 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  34.2 
 
 		 188 aa  113  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0355  phosphoheptose isomerase  34.17 
 
 		 191 aa  112  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902024  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0144  sugar isomerase (SIS)  35.89 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2311  phosphoheptose isomerase  40.33 
 
 		 208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.720425  normal  0.582035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3784  DnaA initiator-associating protein DiaA  35.83 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00388163  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1705  phosphoheptose isomerase  39.34 
 
 		 195 aa  112  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  35.36 
 
 		 198 aa  112  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0312  DnaA initiator-associating protein DiaA  35.83 
 
 		 196 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  36.89 
 
 		 189 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  42.04 
 
 		 650 aa  111  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0306  DnaA initiator-associating protein DiaA  35.29 
 
 		 196 aa  111  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168712  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  43.4 
 
 		 195 aa  111  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>